RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602516.1

HCG18-244, Transcript of HLA complex group 18, humanhuman

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Gene HCG18, Length 2,890 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG18-244ENST00000602516 ACTL10Q5JWF8 245 aa6.4□□□□□ -1.38
HCG18-244ENST00000602516 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
HCG18-244ENST00000602516 SLC25A40Q8TBP6 338 aa6.4□□□□□ -1.38
HCG18-244ENST00000602516 TMEM170AQ8WVE7 144 aa6.4□□□□□ -1.38
HCG18-244ENST00000602516 FAM3DQ96BQ1 224 aa6.4□□□□□ -1.38
HCG18-244ENST00000602516 IMMP1LQ96LU5 166 aa6.4□□□□□ -1.38
HCG18-244ENST00000602516 SPIN2AQ99865 258 aa6.4□□□□□ -1.38
HCG18-244ENST00000602516 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa6.4□□□□□ -1.38
HCG18-244ENST00000602516 DEFB126Q9BYW3 111 aa6.4□□□□□ -1.38
HCG18-244ENST00000602516 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
HCG18-244ENST00000602516 TMEM133Q9H2Q1 129 aa6.4□□□□□ -1.38
HCG18-244ENST00000602516 MAP1LC3AQ9H492 121 aa6.4□□□□□ -1.38
HCG18-244ENST00000602516 MTFP1Q9UDX5 166 aa6.4□□□□□ -1.38
HCG18-244ENST00000602516 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
HCG18-244ENST00000602516 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
HCG18-244ENST00000602516 CACNA1CQ13936 2221 aa6.4□□□□□ -1.38
HCG18-244ENST00000602516 NCKAP5O14513 1909 aa6.4□□□□□ -1.38
HCG18-244ENST00000602516 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa6.4□□□□□ -1.38
HCG18-244ENST00000602516 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa6.4□□□□□ -1.38
HCG18-244ENST00000602516 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa6.4□□□□□ -1.38
HCG18-244ENST00000602516 OR4C46A6NHA9 309 aa6.4□□□□□ -1.38
HCG18-244ENST00000602516 FAM90A7PA6NKC0 464 aa6.4□□□□□ -1.38
HCG18-244ENST00000602516 FAM90A22PA8MWA6 464 aa6.4□□□□□ -1.38
HCG18-244ENST00000602516 FAM90A12PA8MX19 464 aa6.4□□□□□ -1.38
HCG18-244ENST00000602516 FAM90A23PA8MXZ1 464 aa6.4□□□□□ -1.38
HCG18-244ENST00000602516 HRASP01112 189 aa6.4□□□□□ -1.38
HCG18-244ENST00000602516 KRASP01116 189 aa6.4□□□□□ -1.38
HCG18-244ENST00000602516 CT45A10P0DMU9 189 aa6.4□□□□□ -1.38
HCG18-244ENST00000602516 VSIG10L2P0DP72 767 aa6.4□□□□□ -1.38
HCG18-244ENST00000602516 IGFBP2P18065 325 aa6.4□□□□□ -1.38
HCG18-244ENST00000602516 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
HCG18-244ENST00000602516 RPL24P83731 157 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
HCG18-244ENST00000602516 CATR1Q13166 79 aa6.4□□□□□ -1.38
HCG18-244ENST00000602516 OPN5Q6U736 354 aa6.4□□□□□ -1.38
HCG18-244ENST00000602516 TMEM178AQ8NBL3 297 aa6.4□□□□□ -1.38
HCG18-244ENST00000602516 HSPB9Q9BQS6 159 aa6.4□□□□□ -1.38
HCG18-244ENST00000602516 TM2D2Q9BX73 214 aa6.4□□□□□ -1.38
HCG18-244ENST00000602516 MOB1AQ9H8S9 216 aa6.4□□□□□ -1.38
HCG18-244ENST00000602516 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
HCG18-244ENST00000602516 EMC9Q9Y3B6 208 aa6.4□□□□□ -1.38
HCG18-244ENST00000602516 MEGF11A6BM72 1044 aa6.39□□□□□ -1.39
HCG18-244ENST00000602516 K7EP34 96 aa6.39□□□□□ -1.39
HCG18-244ENST00000602516 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
HCG18-244ENST00000602516 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
HCG18-244ENST00000602516 TAS2R19P59542 299 aa6.39□□□□□ -1.39
HCG18-244ENST00000602516 GNB2P62879 340 aa6.39□□□□□ -1.39
HCG18-244ENST00000602516 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
HCG18-244ENST00000602516 C1orf100Q5SVJ3 147 aa6.39□□□□□ -1.39
HCG18-244ENST00000602516 DPPA3Q6W0C5 159 aa6.39□□□□□ -1.39
HCG18-244ENST00000602516 KLHDC1Q8N7A1 406 aa6.39□□□□□ -1.39
HCG18-244ENST00000602516 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
HCG18-244ENST00000602516 ZNF439Q8NDP4 499 aa6.39□□□□□ -1.39
HCG18-244ENST00000602516 OR10V1Q8NGI7 309 aa6.39□□□□□ -1.39
HCG18-244ENST00000602516 OR2I1PQ8NGU4 316 aa6.39□□□□□ -1.39
HCG18-244ENST00000602516 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
HCG18-244ENST00000602516 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa6.39□□□□□ -1.39
HCG18-244ENST00000602516 TMEM204Q9BSN7 226 aa6.39□□□□□ -1.39
HCG18-244ENST00000602516 CABLES2Q9BTV7 478 aa6.39□□□□□ -1.39
HCG18-244ENST00000602516 EMC6Q9BV81 110 aa6.39□□□□□ -1.39
HCG18-244ENST00000602516 GPR84Q9NQS5 396 aa6.39□□□□□ -1.39
HCG18-244ENST00000602516 FAM206AQ9NX38 181 aa6.39□□□□□ -1.39
HCG18-244ENST00000602516 TAS2R4Q9NYW5 299 aa6.39□□□□□ -1.39
HCG18-244ENST00000602516 CKLFQ9UBR5 152 aa6.39□□□□□ -1.39
HCG18-244ENST00000602516 RAXQ9Y2V3 346 aa6.39□□□□□ -1.39
HCG18-244ENST00000602516 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa6.39□□□□□ -1.39
HCG18-244ENST00000602516 NDUFB6O95139 128 aa6.39□□□□□ -1.39
HCG18-244ENST00000602516 CT45A6P0DMU7 189 aa6.39□□□□□ -1.39
HCG18-244ENST00000602516 CT45A5P0DMU8 189 aa6.39□□□□□ -1.39
HCG18-244ENST00000602516 CT45A7P0DMV0 189 aa6.39□□□□□ -1.39
HCG18-244ENST00000602516 CD99P14209 185 aa6.39□□□□□ -1.39
HCG18-244ENST00000602516 GRB2P62993 217 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
HCG18-244ENST00000602516 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
HCG18-244ENST00000602516 C4orf26Q17RF5 130 aa6.39□□□□□ -1.39
HCG18-244ENST00000602516 LINC00303Q3SY05 128 aa6.39□□□□□ -1.39
HCG18-244ENST00000602516 TMEM97Q5BJF2 176 aa6.39□□□□□ -1.39
HCG18-244ENST00000602516 CT45A1Q5HYN5 189 aa6.39□□□□□ -1.39
HCG18-244ENST00000602516 ZFAND6Q6FIF0 208 aa6.39□□□□□ -1.39
HCG18-244ENST00000602516 Q8N976 141 aa6.39□□□□□ -1.39
HCG18-244ENST00000602516 ZIC4Q8N9L1 334 aa6.39□□□□□ -1.39
HCG18-244ENST00000602516 OR10G7Q8NGN6 311 aa6.39□□□□□ -1.39
HCG18-244ENST00000602516 CT45A3Q8NHU0 189 aa6.39□□□□□ -1.39
HCG18-244ENST00000602516 Q8TCH9 128 aa6.39□□□□□ -1.39
HCG18-244ENST00000602516 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
HCG18-244ENST00000602516 LINC00477Q96M19 166 aa6.39□□□□□ -1.39
HCG18-244ENST00000602516 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
HCG18-244ENST00000602516 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
HCG18-244ENST00000602516 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
HCG18-244ENST00000602516 PATE3B3GLJ2 98 aa6.39□□□□□ -1.39
HCG18-244ENST00000602516 THBDP07204 575 aa6.39□□□□□ -1.39
HCG18-244ENST00000602516 H2BFMP0C1H6 154 aa6.39□□□□□ -1.39
HCG18-244ENST00000602516 COX6A1P12074 109 aa6.39□□□□□ -1.39
HCG18-244ENST00000602516 MDKP21741 143 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
HCG18-244ENST00000602516 SULT1A2P50226 295 aa6.39□□□□□ -1.39
HCG18-244ENST00000602516 CT83Q5H943 113 aa6.39□□□□□ -1.39
HCG18-244ENST00000602516 OR10J3Q5JRS4 329 aa6.39□□□□□ -1.39
HCG18-244ENST00000602516 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa6.39□□□□□ -1.39
HCG18-244ENST00000602516 TTC9CQ8N5M4 171 aa6.39□□□□□ -1.39
HCG18-244ENST00000602516 TMEM105Q8N8V8 129 aa6.39□□□□□ -1.39
HCG18-244ENST00000602516 POC1AQ8NBT0 407 aa6.39□□□□□ -1.39
HCG18-244ENST00000602516 TMEM242Q9NWH2 141 aa6.39□□□□□ -1.39
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