RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588780.5

CAPNS1-205, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,035 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-205ENST00000588780 QRFPP83859 136 aa16.01■□□□□ 0.15
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CAPNS1-205ENST00000588780 ZNF645Q8N7E2 425 aa15.91■□□□□ 0.14
CAPNS1-205ENST00000588780 CYGBQ8WWM9 190 aa15.91■□□□□ 0.14
CAPNS1-205ENST00000588780 RAB3CQ96E17 227 aa15.91■□□□□ 0.14
CAPNS1-205ENST00000588780 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
CAPNS1-205ENST00000588780 TRAV10A0A0B4J240 114 aa15.9■□□□□ 0.14
CAPNS1-205ENST00000588780 SLC17A2O00624 439 aa15.9■□□□□ 0.14
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