RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577468.2

PTPRM-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-204ENST00000577468 LGALS2P05162 132 aa2.47□□□□□ -2.01
PTPRM-204ENST00000577468 FGF1P05230 155 aa2.47□□□□□ -2.01
PTPRM-204ENST00000577468 IGKV5-2P06315 115 aa2.47□□□□□ -2.01
PTPRM-204ENST00000577468 H2AFZP0C0S5 128 aa2.47□□□□□ -2.01
PTPRM-204ENST00000577468 SEC11BP0C7V7 166 aa2.47□□□□□ -2.01
PTPRM-204ENST00000577468 BCL2P10415 239 aa2.47□□□□□ -2.01
PTPRM-204ENST00000577468 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP2.47□□□□□ -2.01
PTPRM-204ENST00000577468 CRYBB3P26998 211 aa2.47□□□□□ -2.01
PTPRM-204ENST00000577468 CTRLP40313 264 aa2.47□□□□□ -2.01
PTPRM-204ENST00000577468 CCR2P41597 374 aa2.47□□□□□ -2.01
PTPRM-204ENST00000577468 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP2.47□□□□□ -2.01
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PTPRM-204ENST00000577468 KCNRGQ8N5I3 272 aa2.47□□□□□ -2.01
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PTPRM-204ENST00000577468 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP2.47□□□□□ -2.01
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PTPRM-204ENST00000577468 Q499Y3 187 aa2.46□□□□□ -2.02
PTPRM-204ENST00000577468 FHL5Q5TD97 284 aa2.46□□□□□ -2.02
PTPRM-204ENST00000577468 Q5XG85 94 aa2.46□□□□□ -2.02
PTPRM-204ENST00000577468 Q6AWC8 147 aa2.46□□□□□ -2.02
PTPRM-204ENST00000577468 SLC35E4Q6ICL7 350 aa2.46□□□□□ -2.02
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PTPRM-204ENST00000577468 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP2.46□□□□□ -2.02
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PTPRM-204ENST00000577468 LCN15Q6UWW0 184 aa2.46□□□□□ -2.02
PTPRM-204ENST00000577468 Q6ZN92 141 aa2.46□□□□□ -2.02
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