RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568693.1

E2F4-211, Transcript of E2F transcription factor 4, human

TSL 2

Gene E2F4, Length 596 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
E2F4-211	ENST00000568693	IL15RA	Q13261	267 aa		6.65	□□□□□ -1.34
E2F4-211	ENST00000568693	C9orf139	Q6ZV77	190 aa		6.65	□□□□□ -1.34
E2F4-211	ENST00000568693	H2BFWT	Q7Z2G1	175 aa		6.65	□□□□□ -1.34
E2F4-211	ENST00000568693	NOXA1	Q86UR1	476 aa		6.65	□□□□□ -1.34
E2F4-211	ENST00000568693	VKORC1L1	Q8N0U8	176 aa		6.65	□□□□□ -1.34
E2F4-211	ENST00000568693	OR4D5	Q8NGN0	318 aa		6.65	□□□□□ -1.34
E2F4-211	ENST00000568693	OR2T35	Q8NGX2	323 aa		6.65	□□□□□ -1.34
E2F4-211	ENST00000568693	VSTM2A	Q8TAG5	236 aa		6.65	□□□□□ -1.34
E2F4-211	ENST00000568693	PPP1R1C	Q8WVI7	109 aa		6.65	□□□□□ -1.34
E2F4-211	ENST00000568693	GPR146	Q96CH1	333 aa		6.65	□□□□□ -1.34
E2F4-211	ENST00000568693	TSNAX	Q99598	290 aa	Known RBP	6.65	□□□□□ -1.34
E2F4-211	ENST00000568693	RNF5	Q99942	180 aa		6.65	□□□□□ -1.34
E2F4-211	ENST00000568693	MS4A7	Q9GZW8	240 aa	Predicted RBP	6.65	□□□□□ -1.34
E2F4-211	ENST00000568693	MEGF9	Q9H1U4	602 aa		6.65	□□□□□ -1.34
E2F4-211	ENST00000568693	TMEM140	Q9NV12	185 aa		6.65	□□□□□ -1.34
E2F4-211	ENST00000568693	BET1L	Q9NYM9	111 aa		6.65	□□□□□ -1.34
E2F4-211	ENST00000568693	CACNG5	Q9UF02	275 aa		6.65	□□□□□ -1.34
E2F4-211	ENST00000568693	NUP50	Q9UKX7	468 aa		6.65	□□□□□ -1.34
E2F4-211	ENST00000568693	ABCA1	O95477	2261 aa		6.64	□□□□□ -1.35
E2F4-211	ENST00000568693	PITX3	O75364	302 aa		6.64	□□□□□ -1.35
E2F4-211	ENST00000568693	KBTBD11	O94819	623 aa		6.64	□□□□□ -1.35
E2F4-211	ENST00000568693	MOS	P00540	346 aa		6.64	□□□□□ -1.35
E2F4-211	ENST00000568693	IGKV1D-33	P01593	117 aa		6.64	□□□□□ -1.35
E2F4-211	ENST00000568693	IGKV1-33	P01594	117 aa		6.64	□□□□□ -1.35
E2F4-211	ENST00000568693	IGLV2-23	P01705	113 aa		6.64	□□□□□ -1.35
E2F4-211	ENST00000568693	SNRNP70	P08621	437 aa	Known RBP	6.64	□□□□□ -1.35
E2F4-211	ENST00000568693	IL6R	P08887	468 aa	Predicted RBP	6.64	□□□□□ -1.35
E2F4-211	ENST00000568693	FGF2	P09038	288 aa		6.64	□□□□□ -1.35
E2F4-211	ENST00000568693	FBP1	P09467	338 aa		6.64	□□□□□ -1.35
E2F4-211	ENST00000568693	PET100	P0DJ07	73 aa		6.64	□□□□□ -1.35
E2F4-211	ENST00000568693	SAA1	P0DJI8	122 aa	Predicted RBP	6.64	□□□□□ -1.35
E2F4-211	ENST00000568693	BRS3	P32247	399 aa		6.64	□□□□□ -1.35
E2F4-211	ENST00000568693	UBE2K	P61086	200 aa		6.64	□□□□□ -1.35
E2F4-211	ENST00000568693	RPS16	P62249	146 aa	Known RBP	6.64	□□□□□ -1.35
E2F4-211	ENST00000568693	FGL1	Q08830	312 aa		6.64	□□□□□ -1.35
E2F4-211	ENST00000568693	EBI3	Q14213	229 aa		6.64	□□□□□ -1.35
E2F4-211	ENST00000568693	AANAT	Q16613	207 aa		6.64	□□□□□ -1.35
E2F4-211	ENST00000568693	IZUMO4	Q1ZYL8	232 aa		6.64	□□□□□ -1.35
E2F4-211	ENST00000568693	VMA21	Q3ZAQ7	101 aa		6.64	□□□□□ -1.35
E2F4-211	ENST00000568693	AARD	Q4LEZ3	155 aa		6.64	□□□□□ -1.35
E2F4-211	ENST00000568693	OR4A47	Q6IF82	309 aa		6.64	□□□□□ -1.35
E2F4-211	ENST00000568693		Q6ZRM9	215 aa		6.64	□□□□□ -1.35
E2F4-211	ENST00000568693	C8orf86	Q6ZUL3	223 aa		6.64	□□□□□ -1.35
E2F4-211	ENST00000568693	SSX9	Q7RTT3	188 aa		6.64	□□□□□ -1.35
E2F4-211	ENST00000568693	THNSL2	Q86YJ6	484 aa		6.64	□□□□□ -1.35
E2F4-211	ENST00000568693	FOXRED2	Q8IWF2	684 aa		6.64	□□□□□ -1.35
E2F4-211	ENST00000568693	PUSL1	Q8N0Z8	303 aa	Known RBP	6.64	□□□□□ -1.35
E2F4-211	ENST00000568693	OR2T10	Q8NGZ9	312 aa		6.64	□□□□□ -1.35
E2F4-211	ENST00000568693	OR4A5	Q8NH83	315 aa		6.64	□□□□□ -1.35
E2F4-211	ENST00000568693	RBMXL1	Q96E39	390 aa	Known RBP	6.64	□□□□□ -1.35
E2F4-211	ENST00000568693	WDR89	Q96FK6	387 aa	Predicted RBP	6.64	□□□□□ -1.35
E2F4-211	ENST00000568693	ZFP57	Q9NU63	452 aa		6.64	□□□□□ -1.35
E2F4-211	ENST00000568693	GSKIP	Q9P0R6	139 aa		6.64	□□□□□ -1.35
E2F4-211	ENST00000568693	CACFD1	Q9UGQ2	172 aa		6.64	□□□□□ -1.35
E2F4-211	ENST00000568693	FAM96B	Q9Y3D0	163 aa		6.64	□□□□□ -1.35
E2F4-211	ENST00000568693	NIPBL	Q6KC79	2804 aa	eCLIP	6.64	□□□□□ -1.35
E2F4-211	ENST00000568693	ANK3	Q12955	4377 aa	Known RBP	6.64	□□□□□ -1.35
E2F4-211	ENST00000568693	TRAV14DV4	A0A0A6YYC5	116 aa		6.63	□□□□□ -1.35
E2F4-211	ENST00000568693	C15orf61	A6NNL5	157 aa		6.63	□□□□□ -1.35
E2F4-211	ENST00000568693	FAM90A26	D6RGX4	464 aa		6.63	□□□□□ -1.35
E2F4-211	ENST00000568693	SMLR1	H3BR10	107 aa		6.63	□□□□□ -1.35
E2F4-211	ENST00000568693	NDUFA3	O95167	84 aa		6.63	□□□□□ -1.35
E2F4-211	ENST00000568693	MPC2	O95563	127 aa		6.63	□□□□□ -1.35
E2F4-211	ENST00000568693	MBP	P02686	304 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
E2F4-211	ENST00000568693	OR9G9	P0C7N8	305 aa		6.63	□□□□□ -1.35
E2F4-211	ENST00000568693	FAM106CP	P0CH98	169 aa		6.63	□□□□□ -1.35
E2F4-211	ENST00000568693	PSMB6	P28072	239 aa		6.63	□□□□□ -1.35
E2F4-211	ENST00000568693	NKX2-1	P43699	371 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
E2F4-211	ENST00000568693	RAB32	Q13637	225 aa		6.63	□□□□□ -1.35
E2F4-211	ENST00000568693	HES1	Q14469	280 aa		6.63	□□□□□ -1.35
E2F4-211	ENST00000568693	LRRC75B	Q2VPJ9	315 aa		6.63	□□□□□ -1.35
E2F4-211	ENST00000568693	LRRC37A5P	Q49AS3	106 aa		6.63	□□□□□ -1.35
E2F4-211	ENST00000568693	PDLIM3	Q53GG5	364 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
E2F4-211	ENST00000568693	FBLN7	Q53RD9	439 aa		6.63	□□□□□ -1.35
E2F4-211	ENST00000568693	ZNF429	Q86V71	674 aa		6.63	□□□□□ -1.35
E2F4-211	ENST00000568693		Q8N6K4	173 aa		6.63	□□□□□ -1.35
E2F4-211	ENST00000568693	TEX45	Q8NA69	505 aa		6.63	□□□□□ -1.35
E2F4-211	ENST00000568693	NPB	Q8NG41	125 aa		6.63	□□□□□ -1.35
E2F4-211	ENST00000568693	OR4A16	Q8NH70	328 aa		6.63	□□□□□ -1.35
E2F4-211	ENST00000568693	OR1S1	Q8NH92	325 aa		6.63	□□□□□ -1.35
E2F4-211	ENST00000568693	RITA1	Q96K30	269 aa		6.63	□□□□□ -1.35
E2F4-211	ENST00000568693	CTNNBIP1	Q9NSA3	81 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
E2F4-211	ENST00000568693	TMEM14B	Q9NUH8	114 aa		6.63	□□□□□ -1.35
E2F4-211	ENST00000568693	TMEM160	Q9NX00	188 aa		6.63	□□□□□ -1.35
E2F4-211	ENST00000568693	PRND	Q9UKY0	176 aa		6.63	□□□□□ -1.35
E2F4-211	ENST00000568693	FOXA2	Q9Y261	457 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
E2F4-211	ENST00000568693	POMT1	Q9Y6A1	747 aa		6.63	□□□□□ -1.35
E2F4-211	ENST00000568693	NSD1	Q96L73	2696 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
E2F4-211	ENST00000568693	TRAV3	A0A0B4J244	114 aa		6.62	□□□□□ -1.35
E2F4-211	ENST00000568693		K7EPK0	472 aa		6.62	□□□□□ -1.35
E2F4-211	ENST00000568693	UPK2	O00526	184 aa		6.62	□□□□□ -1.35
E2F4-211	ENST00000568693	RRH	O14718	337 aa		6.62	□□□□□ -1.35
E2F4-211	ENST00000568693	NBR2	O15453	112 aa		6.62	□□□□□ -1.35
E2F4-211	ENST00000568693	ST8SIA3	O43173	380 aa		6.62	□□□□□ -1.35
E2F4-211	ENST00000568693	SLC25A17	O43808	307 aa		6.62	□□□□□ -1.35
E2F4-211	ENST00000568693	RBMXL2	O75526	392 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
E2F4-211	ENST00000568693	DEDD	O75618	318 aa		6.62	□□□□□ -1.35
E2F4-211	ENST00000568693	SNAPC5	O75971	98 aa		6.62	□□□□□ -1.35
E2F4-211	ENST00000568693	SCGB1D2	O95969	90 aa		6.62	□□□□□ -1.35
E2F4-211	ENST00000568693	CRYGB	P07316	175 aa		6.62	□□□□□ -1.35

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