RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566882.5

CCNDBP1-210, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene CCNDBP1, Length 2,746 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-210ENST00000566882 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
CCNDBP1-210ENST00000566882 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
CCNDBP1-210ENST00000566882 IGKV1D-33P01593 117 aa8.33□□□□□ -1.08
CCNDBP1-210ENST00000566882 IGKV1-33P01594 117 aa8.33□□□□□ -1.08
CCNDBP1-210ENST00000566882 CA7P43166 264 aa8.33□□□□□ -1.08
CCNDBP1-210ENST00000566882 RAB5CP51148 216 aa8.33□□□□□ -1.08
CCNDBP1-210ENST00000566882 TFF3Q07654 80 aa8.33□□□□□ -1.08
CCNDBP1-210ENST00000566882 SOHLH1Q5JUK2 328 aa8.33□□□□□ -1.08
CCNDBP1-210ENST00000566882 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa8.33□□□□□ -1.08
CCNDBP1-210ENST00000566882 ZNF343Q6P1L6 599 aa8.33□□□□□ -1.08
CCNDBP1-210ENST00000566882 LCN15Q6UWW0 184 aa8.33□□□□□ -1.08
CCNDBP1-210ENST00000566882 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
CCNDBP1-210ENST00000566882 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
CCNDBP1-210ENST00000566882 DYNLRB1Q9NP97 96 aa8.33□□□□□ -1.08
CCNDBP1-210ENST00000566882 TMEM106BQ9NUM4 274 aa8.33□□□□□ -1.08
CCNDBP1-210ENST00000566882 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa8.33□□□□□ -1.08
CCNDBP1-210ENST00000566882 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa8.33□□□□□ -1.08
CCNDBP1-210ENST00000566882 PPIAL4EA0A075B759 164 aa8.33□□□□□ -1.08
CCNDBP1-210ENST00000566882 FAM90A26D6RGX4 464 aa8.33□□□□□ -1.08
CCNDBP1-210ENST00000566882 PPIAL4DF5H284 164 aa8.33□□□□□ -1.08
CCNDBP1-210ENST00000566882 DFFBO76075 338 aa8.33□□□□□ -1.08
CCNDBP1-210ENST00000566882 LY6HO94772 140 aa8.33□□□□□ -1.08
CCNDBP1-210ENST00000566882 IFNA17P01571 189 aa8.33□□□□□ -1.08
CCNDBP1-210ENST00000566882 PPIAL4FP0DN26 164 aa8.33□□□□□ -1.08
CCNDBP1-210ENST00000566882 RPL31P62899 125 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
CCNDBP1-210ENST00000566882 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
CCNDBP1-210ENST00000566882 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa8.33□□□□□ -1.08
CCNDBP1-210ENST00000566882 LRRC75BQ2VPJ9 315 aa8.33□□□□□ -1.08
CCNDBP1-210ENST00000566882 TMEM200BQ69YZ2 307 aa8.33□□□□□ -1.08
CCNDBP1-210ENST00000566882 S1PR3Q99500 378 aa8.33□□□□□ -1.08
CCNDBP1-210ENST00000566882 SSX3Q99909 188 aa8.33□□□□□ -1.08
CCNDBP1-210ENST00000566882 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
CCNDBP1-210ENST00000566882 PPIAL4AQ9Y536 164 aa8.33□□□□□ -1.08
CCNDBP1-210ENST00000566882 CFAP46Q8IYW2 2715 aa8.33□□□□□ -1.08
CCNDBP1-210ENST00000566882 ZFP92A6NM28 416 aa8.32□□□□□ -1.08
CCNDBP1-210ENST00000566882 PPIHO43447 177 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
CCNDBP1-210ENST00000566882 HPRT1P00492 218 aa8.32□□□□□ -1.08
CCNDBP1-210ENST00000566882 IGKV1-16P04430 117 aa8.32□□□□□ -1.08
CCNDBP1-210ENST00000566882 REG1BP48304 166 aa8.32□□□□□ -1.08
CCNDBP1-210ENST00000566882 ICAM4Q14773 271 aa8.32□□□□□ -1.08
CCNDBP1-210ENST00000566882 SCGB1C1Q8TD33 95 aa8.32□□□□□ -1.08
CCNDBP1-210ENST00000566882 FAM122AQ96E09 287 aa8.32□□□□□ -1.08
CCNDBP1-210ENST00000566882 PBDC1Q9BVG4 233 aa8.32□□□□□ -1.08
CCNDBP1-210ENST00000566882 TMEM140Q9NV12 185 aa8.32□□□□□ -1.08
CCNDBP1-210ENST00000566882 GNG13Q9P2W3 67 aa8.32□□□□□ -1.08
CCNDBP1-210ENST00000566882 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa8.32□□□□□ -1.08
CCNDBP1-210ENST00000566882 VPS13CQ709C8 3753 aa8.32□□□□□ -1.08
CCNDBP1-210ENST00000566882 C15orf62A8K5M9 175 aa8.32□□□□□ -1.08
CCNDBP1-210ENST00000566882 RRHO14718 337 aa8.32□□□□□ -1.08
CCNDBP1-210ENST00000566882 OPN1MWP04001 364 aa8.32□□□□□ -1.08
CCNDBP1-210ENST00000566882 OPN1MW2P0DN77 364 aa8.32□□□□□ -1.08
CCNDBP1-210ENST00000566882 OPN1MW3P0DN78 364 aa8.32□□□□□ -1.08
CCNDBP1-210ENST00000566882 RELBQ01201 579 aa8.32□□□□□ -1.08
CCNDBP1-210ENST00000566882 KLRB1Q12918 225 aa8.32□□□□□ -1.08
CCNDBP1-210ENST00000566882 ABHD12Q8N2K0 398 aa8.32□□□□□ -1.08
CCNDBP1-210ENST00000566882 TMEM170AQ8WVE7 144 aa8.32□□□□□ -1.08
CCNDBP1-210ENST00000566882 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP8.32□□□□□ -1.08
CCNDBP1-210ENST00000566882 BIN3Q9NQY0 253 aa8.32□□□□□ -1.08
CCNDBP1-210ENST00000566882 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
CCNDBP1-210ENST00000566882 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
CCNDBP1-210ENST00000566882 PIEZO1Q92508 2521 aa8.32□□□□□ -1.08
CCNDBP1-210ENST00000566882 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa8.31□□□□□ -1.08
CCNDBP1-210ENST00000566882 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa8.31□□□□□ -1.08
CCNDBP1-210ENST00000566882 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
CCNDBP1-210ENST00000566882 H3BQ15 152 aa8.31□□□□□ -1.08
CCNDBP1-210ENST00000566882 DVL1O14640 695 aa8.31□□□□□ -1.08
CCNDBP1-210ENST00000566882 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
CCNDBP1-210ENST00000566882 CD3EP07766 207 aa8.31□□□□□ -1.08
CCNDBP1-210ENST00000566882 SRP19P09132 144 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
CCNDBP1-210ENST00000566882 CT45A6P0DMU7 189 aa8.31□□□□□ -1.08
CCNDBP1-210ENST00000566882 CT45A5P0DMU8 189 aa8.31□□□□□ -1.08
CCNDBP1-210ENST00000566882 CT45A7P0DMV0 189 aa8.31□□□□□ -1.08
CCNDBP1-210ENST00000566882 RAB2AP61019 212 aa8.31□□□□□ -1.08
CCNDBP1-210ENST00000566882 HBG1P69891 147 aa8.31□□□□□ -1.08
CCNDBP1-210ENST00000566882 HBG2P69892 147 aa8.31□□□□□ -1.08
CCNDBP1-210ENST00000566882 ACSM6Q6P461 480 aa8.31□□□□□ -1.08
CCNDBP1-210ENST00000566882 COMMD1Q8N668 190 aa8.31□□□□□ -1.08
CCNDBP1-210ENST00000566882 C15orf54Q8N8G6 183 aa8.31□□□□□ -1.08
CCNDBP1-210ENST00000566882 RAB39BQ96DA2 213 aa8.31□□□□□ -1.08
CCNDBP1-210ENST00000566882 RNF24Q9Y225 148 aa8.31□□□□□ -1.08
CCNDBP1-210ENST00000566882 PKD1L2Q7Z442 2459 aa8.31□□□□□ -1.08
CCNDBP1-210ENST00000566882 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa8.31□□□□□ -1.08
CCNDBP1-210ENST00000566882 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
CCNDBP1-210ENST00000566882 RAB4BP61018 213 aa8.31□□□□□ -1.08
CCNDBP1-210ENST00000566882 OR4A16Q8NH70 328 aa8.31□□□□□ -1.08
CCNDBP1-210ENST00000566882 CORO2AQ92828 525 aa8.31□□□□□ -1.08
CCNDBP1-210ENST00000566882 EGLN1Q9GZT9 426 aa8.31□□□□□ -1.08
CCNDBP1-210ENST00000566882 NKX6-3A6NJ46 265 aa8.31□□□□□ -1.08
CCNDBP1-210ENST00000566882 RAB5AP20339 215 aa8.31□□□□□ -1.08
CCNDBP1-210ENST00000566882 UCNP55089 124 aa8.31□□□□□ -1.08
CCNDBP1-210ENST00000566882 TAS2R60P59551 318 aa8.31□□□□□ -1.08
CCNDBP1-210ENST00000566882 OR4A47Q6IF82 309 aa8.31□□□□□ -1.08
CCNDBP1-210ENST00000566882 SLC16A13Q7RTY0 426 aa8.31□□□□□ -1.08
CCNDBP1-210ENST00000566882 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa8.31□□□□□ -1.08
CCNDBP1-210ENST00000566882 CLDND2Q8NHS1 167 aa8.31□□□□□ -1.08
CCNDBP1-210ENST00000566882 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
CCNDBP1-210ENST00000566882 RHOVQ96L33 236 aa8.31□□□□□ -1.08
CCNDBP1-210ENST00000566882 DIRC2Q96SL1 478 aa8.31□□□□□ -1.08
CCNDBP1-210ENST00000566882 hADV38S2A0JD32 116 aa8.3□□□□□ -1.08
CCNDBP1-210ENST00000566882 C1orf196B1AJZ1 125 aa8.3□□□□□ -1.08
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