RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566121.1

CMTM3-212, Transcript of CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CMTM3, Length 572 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM3-212ENST00000566121 DMRT1Q9Y5R6 373 aa11.55□□□□□ -0.56
CMTM3-212ENST00000566121 ANKRD34BA5PLL1 514 aa11.54□□□□□ -0.56
CMTM3-212ENST00000566121 TEX22C9J3V5 150 aa11.54□□□□□ -0.56
CMTM3-212ENST00000566121 LGALS9O00182 355 aa11.54□□□□□ -0.56
CMTM3-212ENST00000566121 BMPR1BO00238 502 aa11.54□□□□□ -0.56
CMTM3-212ENST00000566121 KBTBD11O94819 623 aa11.54□□□□□ -0.56
CMTM3-212ENST00000566121 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa11.54□□□□□ -0.56
CMTM3-212ENST00000566121 IDO2Q6ZQW0 420 aa11.54□□□□□ -0.56
CMTM3-212ENST00000566121 GPHB5Q86YW7 130 aa11.54□□□□□ -0.56
CMTM3-212ENST00000566121 BEST4Q8NFU0 473 aa11.54□□□□□ -0.56
CMTM3-212ENST00000566121 BORCS5Q969J3 196 aa11.54□□□□□ -0.56
CMTM3-212ENST00000566121 SLC25A38Q96DW6 304 aa11.54□□□□□ -0.56
CMTM3-212ENST00000566121 AUNIPQ9H7T9 357 aa11.54□□□□□ -0.56
CMTM3-212ENST00000566121 BET1LQ9NYM9 111 aa11.54□□□□□ -0.56
CMTM3-212ENST00000566121 DHFRP00374 187 aa11.53□□□□□ -0.56
CMTM3-212ENST00000566121 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP11.53□□□□□ -0.56
CMTM3-212ENST00000566121 ARPC4P59998 168 aa11.53□□□□□ -0.56
CMTM3-212ENST00000566121 CD300LFQ8TDQ1 290 aa11.53□□□□□ -0.56
CMTM3-212ENST00000566121 ACOT12Q8WYK0 555 aa11.53□□□□□ -0.56
CMTM3-212ENST00000566121 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa11.53□□□□□ -0.56
CMTM3-212ENST00000566121 TRAV18A0A075B6X5 111 aa11.52□□□□□ -0.57
CMTM3-212ENST00000566121 MPPED1O15442 326 aa11.52□□□□□ -0.57
CMTM3-212ENST00000566121 XRCC3O43542 346 aa11.52□□□□□ -0.57
CMTM3-212ENST00000566121 TRBV12-3P01733 135 aa11.52□□□□□ -0.57
CMTM3-212ENST00000566121 CTRB1P17538 263 aa11.52□□□□□ -0.57
CMTM3-212ENST00000566121 FCGR2CP31995 323 aa11.52□□□□□ -0.57
CMTM3-212ENST00000566121 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP11.52□□□□□ -0.57
CMTM3-212ENST00000566121 TAS2R31P59538 309 aa11.52□□□□□ -0.57
CMTM3-212ENST00000566121 CASC10Q5T4H9 136 aa11.52□□□□□ -0.57
CMTM3-212ENST00000566121 CTRB2Q6GPI1 263 aa11.52□□□□□ -0.57
CMTM3-212ENST00000566121 DHRS11Q6UWP2 260 aa11.52□□□□□ -0.57
CMTM3-212ENST00000566121 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP11.52□□□□□ -0.57
CMTM3-212ENST00000566121 FANCD2OSQ96PS1 177 aa11.52□□□□□ -0.57
CMTM3-212ENST00000566121 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP11.52□□□□□ -0.57
CMTM3-212ENST00000566121 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa11.52□□□□□ -0.57
CMTM3-212ENST00000566121 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP11.52□□□□□ -0.57
CMTM3-212ENST00000566121 ADAM30Q9UKF2 790 aa11.52□□□□□ -0.57
CMTM3-212ENST00000566121 ANAPC10Q9UM13 185 aa11.52□□□□□ -0.57
CMTM3-212ENST00000566121 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP11.51□□□□□ -0.57
CMTM3-212ENST00000566121 GGCTO75223 188 aaKnown RBP11.51□□□□□ -0.57
CMTM3-212ENST00000566121 HPRT1P00492 218 aa11.51□□□□□ -0.57
CMTM3-212ENST00000566121 PPYP01298 95 aa11.51□□□□□ -0.57
CMTM3-212ENST00000566121 PSMB6P28072 239 aa11.51□□□□□ -0.57
CMTM3-212ENST00000566121 RPL8P62917 257 aaKnown RBP11.51□□□□□ -0.57
CMTM3-212ENST00000566121 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP11.51□□□□□ -0.57
CMTM3-212ENST00000566121 C15orf32Q32M92 178 aa11.51□□□□□ -0.57
CMTM3-212ENST00000566121 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP11.51□□□□□ -0.57
CMTM3-212ENST00000566121 GTSCR1Q86UQ5 136 aa11.51□□□□□ -0.57
CMTM3-212ENST00000566121 OR5AP2Q8NGF4 316 aa11.51□□□□□ -0.57
CMTM3-212ENST00000566121 OR5H6Q8NGV6 325 aa11.51□□□□□ -0.57
CMTM3-212ENST00000566121 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa11.51□□□□□ -0.57
CMTM3-212ENST00000566121 ATP6V0BQ99437 205 aa11.51□□□□□ -0.57
CMTM3-212ENST00000566121 RSRP1Q9BUV0 290 aa11.51□□□□□ -0.57
CMTM3-212ENST00000566121 PLEKHA2Q9HB19 425 aa11.51□□□□□ -0.57
CMTM3-212ENST00000566121 SMIM30A4D0T7 59 aa11.5□□□□□ -0.57
CMTM3-212ENST00000566121 CLEC2LP0C7M8 214 aa11.5□□□□□ -0.57
CMTM3-212ENST00000566121 NAT1P18440 290 aa11.5□□□□□ -0.57
CMTM3-212ENST00000566121 IDNKQ5T6J7 187 aa11.5□□□□□ -0.57
CMTM3-212ENST00000566121 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa11.5□□□□□ -0.57
CMTM3-212ENST00000566121 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP11.5□□□□□ -0.57
CMTM3-212ENST00000566121 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
CMTM3-212ENST00000566121 CMTM3Q96MX0 182 aa11.5□□□□□ -0.57
CMTM3-212ENST00000566121 SPATA25Q9BR10 227 aa11.5□□□□□ -0.57
CMTM3-212ENST00000566121 EDA2RQ9HAV5 297 aa11.5□□□□□ -0.57
CMTM3-212ENST00000566121 A0A1B0GW64 132 aa11.49□□□□□ -0.57
CMTM3-212ENST00000566121 E7EUB6 86 aa11.49□□□□□ -0.57
CMTM3-212ENST00000566121 NQO2P16083 231 aa11.49□□□□□ -0.57
CMTM3-212ENST00000566121 HLA-GP17693 338 aa11.49□□□□□ -0.57
CMTM3-212ENST00000566121 CATR1Q13166 79 aa11.49□□□□□ -0.57
CMTM3-212ENST00000566121 DEFB114Q30KQ6 69 aa11.49□□□□□ -0.57
CMTM3-212ENST00000566121 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa11.49□□□□□ -0.57
CMTM3-212ENST00000566121 SPAG16Q8N0X2 631 aa11.49□□□□□ -0.57
CMTM3-212ENST00000566121 GVQW1Q8N7I0 195 aa11.49□□□□□ -0.57
CMTM3-212ENST00000566121 OR13F1Q8NGS4 319 aa11.49□□□□□ -0.57
CMTM3-212ENST00000566121 CXorf58Q96LI9 332 aa11.49□□□□□ -0.57
CMTM3-212ENST00000566121 CCL28Q9NRJ3 127 aa11.49□□□□□ -0.57
CMTM3-212ENST00000566121 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
CMTM3-212ENST00000566121 TAS2R8Q9NYW2 309 aa11.49□□□□□ -0.57
CMTM3-212ENST00000566121 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa11.48□□□□□ -0.57
CMTM3-212ENST00000566121 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa11.48□□□□□ -0.57
CMTM3-212ENST00000566121 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa11.48□□□□□ -0.57
CMTM3-212ENST00000566121 ZNF785A8K8V0 405 aa11.48□□□□□ -0.57
CMTM3-212ENST00000566121 A8MWP6 167 aa11.48□□□□□ -0.57
CMTM3-212ENST00000566121 J3QRK9 145 aa11.48□□□□□ -0.57
CMTM3-212ENST00000566121 OR2J3O76001 311 aa11.48□□□□□ -0.57
CMTM3-212ENST00000566121 APELAP0DMC3 54 aa11.48□□□□□ -0.57
CMTM3-212ENST00000566121 MXD1Q05195 221 aa11.48□□□□□ -0.57
CMTM3-212ENST00000566121 HAGHQ16775 308 aa11.48□□□□□ -0.57
CMTM3-212ENST00000566121 C10orf55Q5SWW7 151 aa11.48□□□□□ -0.57
CMTM3-212ENST00000566121 OR4A47Q6IF82 309 aa11.48□□□□□ -0.57
CMTM3-212ENST00000566121 SECTM1Q8WVN6 248 aa11.48□□□□□ -0.57
CMTM3-212ENST00000566121 RNF167Q9H6Y7 350 aa11.48□□□□□ -0.57
CMTM3-212ENST00000566121 COMMD9Q9P000 198 aa11.48□□□□□ -0.57
CMTM3-212ENST00000566121 FBXL7Q9UJT9 491 aa11.48□□□□□ -0.57
CMTM3-212ENST00000566121 DPPA5A6NC42 116 aa11.47□□□□□ -0.57
CMTM3-212ENST00000566121 HMX3A6NHT5 357 aa11.47□□□□□ -0.57
CMTM3-212ENST00000566121 C2orf70A6NJV1 201 aa11.47□□□□□ -0.57
CMTM3-212ENST00000566121 UPK2O00526 184 aa11.47□□□□□ -0.57
CMTM3-212ENST00000566121 PRH1P02810 166 aa11.47□□□□□ -0.57
CMTM3-212ENST00000566121 LYL1P12980 280 aa11.47□□□□□ -0.57
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