RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552295.5

BEST3-211, Transcript of bestrophin 3, humanhuman

TSL 5

Gene BEST3, Length 720 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST3-211ENST00000552295 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
BEST3-211ENST00000552295 SLC35G3Q8N808 338 aa6.45□□□□□ -1.38
BEST3-211ENST00000552295 OR4S2Q8NH73 311 aa6.45□□□□□ -1.38
BEST3-211ENST00000552295 CD300LFQ8TDQ1 290 aa6.45□□□□□ -1.38
BEST3-211ENST00000552295 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
BEST3-211ENST00000552295 IL22RA2Q969J5 263 aa6.45□□□□□ -1.38
BEST3-211ENST00000552295 MED28Q9H204 178 aa6.45□□□□□ -1.38
BEST3-211ENST00000552295 WASHC3Q9Y3C0 194 aa6.45□□□□□ -1.38
BEST3-211ENST00000552295 CCDC168Q8NDH2 2452 aa6.45□□□□□ -1.38
BEST3-211ENST00000552295 A0A0U1RQK1 487 aa6.44□□□□□ -1.38
BEST3-211ENST00000552295 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa6.44□□□□□ -1.38
BEST3-211ENST00000552295 HMX3A6NHT5 357 aa6.44□□□□□ -1.38
BEST3-211ENST00000552295 ADAP1O75689 374 aa6.44□□□□□ -1.38
BEST3-211ENST00000552295 VENTXO95231 258 aa6.44□□□□□ -1.38
BEST3-211ENST00000552295 CRYZL1O95825 349 aa6.44□□□□□ -1.38
BEST3-211ENST00000552295 HPRT1P00492 218 aa6.44□□□□□ -1.38
BEST3-211ENST00000552295 IGKV1-5P01602 117 aa6.44□□□□□ -1.38
BEST3-211ENST00000552295 RRASP10301 218 aa6.44□□□□□ -1.38
BEST3-211ENST00000552295 RPA2P15927 270 aa6.44□□□□□ -1.38
BEST3-211ENST00000552295 HLA-GP17693 338 aa6.44□□□□□ -1.38
BEST3-211ENST00000552295 CXCL3P19876 107 aa6.44□□□□□ -1.38
BEST3-211ENST00000552295 CD1BP29016 333 aa6.44□□□□□ -1.38
BEST3-211ENST00000552295 MC5RP33032 325 aa6.44□□□□□ -1.38
BEST3-211ENST00000552295 BPIFB3P59826 476 aa6.44□□□□□ -1.38
BEST3-211ENST00000552295 DHRS7BQ6IAN0 325 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
BEST3-211ENST00000552295 LYZL2Q7Z4W2 148 aa6.44□□□□□ -1.38
BEST3-211ENST00000552295 ZNF695Q8IW36 515 aa6.44□□□□□ -1.38
BEST3-211ENST00000552295 UXS1Q8NBZ7 420 aa6.44□□□□□ -1.38
BEST3-211ENST00000552295 OR11H7Q8NGC8 314 aa6.44□□□□□ -1.38
BEST3-211ENST00000552295 NANPQ8TBE9 248 aa6.44□□□□□ -1.38
BEST3-211ENST00000552295 SEC22AQ96IW7 307 aa6.44□□□□□ -1.38
BEST3-211ENST00000552295 SMR3AQ99954 134 aa6.44□□□□□ -1.38
BEST3-211ENST00000552295 PLEKHA2Q9HB19 425 aa6.44□□□□□ -1.38
BEST3-211ENST00000552295 RAB18Q9NP72 206 aa6.44□□□□□ -1.38
BEST3-211ENST00000552295 YAE1D1Q9NRH1 226 aa6.44□□□□□ -1.38
BEST3-211ENST00000552295 COMMD9Q9P000 198 aa6.44□□□□□ -1.38
BEST3-211ENST00000552295 MGAT4CQ9UBM8 478 aa6.44□□□□□ -1.38
BEST3-211ENST00000552295 NUP50Q9UKX7 468 aa6.44□□□□□ -1.38
BEST3-211ENST00000552295 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
BEST3-211ENST00000552295 COX11Q9Y6N1 276 aa6.44□□□□□ -1.38
BEST3-211ENST00000552295 MYO9AB2RTY4 2548 aa6.43□□□□□ -1.38
BEST3-211ENST00000552295 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
BEST3-211ENST00000552295 CREBBPQ92793 2442 aa6.43□□□□□ -1.38
BEST3-211ENST00000552295 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa6.43□□□□□ -1.38
BEST3-211ENST00000552295 A0A0G2JRQ6 117 aa6.43□□□□□ -1.38
BEST3-211ENST00000552295 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa6.43□□□□□ -1.38
BEST3-211ENST00000552295 MPTX1A8MV57 137 aa6.43□□□□□ -1.38
BEST3-211ENST00000552295 H7C2Y5 167 aa6.43□□□□□ -1.38
BEST3-211ENST00000552295 CCSO14618 274 aa6.43□□□□□ -1.38
BEST3-211ENST00000552295 GOSR2O14653 212 aa6.43□□□□□ -1.38
BEST3-211ENST00000552295 SIX6O95475 246 aa6.43□□□□□ -1.38
BEST3-211ENST00000552295 LY6G6DO95868 133 aa6.43□□□□□ -1.38
BEST3-211ENST00000552295 HOXB5P09067 269 aa6.43□□□□□ -1.38
BEST3-211ENST00000552295 P0C879 139 aa6.43□□□□□ -1.38
BEST3-211ENST00000552295 TRAPPC2P0DI81 140 aa6.43□□□□□ -1.38
BEST3-211ENST00000552295 TRAPPC2BP0DI82 140 aa6.43□□□□□ -1.38
BEST3-211ENST00000552295 CD99P14209 185 aa6.43□□□□□ -1.38
BEST3-211ENST00000552295 VDAC1P21796 283 aa6.43□□□□□ -1.38
BEST3-211ENST00000552295 G6PCP35575 357 aa6.43□□□□□ -1.38
BEST3-211ENST00000552295 RAB13P51153 203 aa6.43□□□□□ -1.38
BEST3-211ENST00000552295 PTTG1IPP53801 180 aa6.43□□□□□ -1.38
BEST3-211ENST00000552295 H2BFSP57053 126 aa6.43□□□□□ -1.38
BEST3-211ENST00000552295 POU2AF1Q16633 256 aa6.43□□□□□ -1.38
BEST3-211ENST00000552295 NMSQ5H8A3 153 aa6.43□□□□□ -1.38
BEST3-211ENST00000552295 FAM120AOSQ5T036 256 aa6.43□□□□□ -1.38
BEST3-211ENST00000552295 GGNBP1Q5YKI7 109 aa6.43□□□□□ -1.38
BEST3-211ENST00000552295 C9orf139Q6ZV77 190 aa6.43□□□□□ -1.38
BEST3-211ENST00000552295 OR4C13Q8NGP0 309 aa6.43□□□□□ -1.38
BEST3-211ENST00000552295 OR5M8Q8NGP6 311 aa6.43□□□□□ -1.38
BEST3-211ENST00000552295 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
BEST3-211ENST00000552295 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
BEST3-211ENST00000552295 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
BEST3-211ENST00000552295 R3HDM4Q96D70 268 aa6.43□□□□□ -1.38
BEST3-211ENST00000552295 RITA1Q96K30 269 aa6.43□□□□□ -1.38
BEST3-211ENST00000552295 HARBI1Q96MB7 349 aa6.43□□□□□ -1.38
BEST3-211ENST00000552295 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa6.42□□□□□ -1.38
BEST3-211ENST00000552295 GAGE12BA1L429 117 aa6.42□□□□□ -1.38
BEST3-211ENST00000552295 GAGE12HA6NDE8 117 aa6.42□□□□□ -1.38
BEST3-211ENST00000552295 MARCH11A6NNE9 402 aa6.42□□□□□ -1.38
BEST3-211ENST00000552295 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
BEST3-211ENST00000552295 MOSP00540 346 aa6.42□□□□□ -1.38
BEST3-211ENST00000552295 HRASP01112 189 aa6.42□□□□□ -1.38
BEST3-211ENST00000552295 KRASP01116 189 aa6.42□□□□□ -1.38
BEST3-211ENST00000552295 IGKV1D-33P01593 117 aa6.42□□□□□ -1.38
BEST3-211ENST00000552295 IGKV1-33P01594 117 aa6.42□□□□□ -1.38
BEST3-211ENST00000552295 IGLV2-23P01705 113 aa6.42□□□□□ -1.38
BEST3-211ENST00000552295 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
BEST3-211ENST00000552295 FBP1P09467 338 aa6.42□□□□□ -1.38
BEST3-211ENST00000552295 NQO2P16083 231 aa6.42□□□□□ -1.38
BEST3-211ENST00000552295 CD24P25063 80 aa6.42□□□□□ -1.38
BEST3-211ENST00000552295 BRS3P32247 399 aa6.42□□□□□ -1.38
BEST3-211ENST00000552295 DYNLT3P51808 116 aa6.42□□□□□ -1.38
BEST3-211ENST00000552295 AKR1C2P52895 323 aa6.42□□□□□ -1.38
BEST3-211ENST00000552295 EBI3Q14213 229 aa6.42□□□□□ -1.38
BEST3-211ENST00000552295 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa6.42□□□□□ -1.38
BEST3-211ENST00000552295 DEFB112Q30KQ8 113 aa6.42□□□□□ -1.38
BEST3-211ENST00000552295 GSG1LQ6UXU4 331 aa6.42□□□□□ -1.38
BEST3-211ENST00000552295 IL17RELQ6ZVW7 336 aa6.42□□□□□ -1.38
BEST3-211ENST00000552295 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa6.42□□□□□ -1.38
BEST3-211ENST00000552295 TEX29Q8N6K0 151 aa6.42□□□□□ -1.38
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