RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549308.5

PTPRR-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRR, Length 1,603 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-209ENST00000549308 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
PTPRR-209ENST00000549308 C11orf1Q9H5F2 150 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRR-209ENST00000549308 BET1LQ9NYM9 111 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRR-209ENST00000549308 PRNDQ9UKY0 176 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRR-209ENST00000549308 ABCA2Q9BZC7 2435 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRR-209ENST00000549308 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
PTPRR-209ENST00000549308 FAM24AA6NFZ4 105 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRR-209ENST00000549308 KBTBD11O94819 623 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRR-209ENST00000549308 VENTXO95231 258 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRR-209ENST00000549308 CAV2P51636 162 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRR-209ENST00000549308 TMEM249Q2WGJ8 235 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRR-209ENST00000549308 SPINK9Q5DT21 86 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRR-209ENST00000549308 OR2C3Q8N628 320 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRR-209ENST00000549308 OR4A5Q8NH83 315 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRR-209ENST00000549308 RITA1Q96K30 269 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRR-209ENST00000549308 PSENENQ9NZ42 101 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRR-209ENST00000549308 CACFD1Q9UGQ2 172 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRR-209ENST00000549308 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.85
PTPRR-209ENST00000549308 J3QLI3 93 aa9.71□□□□□ -0.85
PTPRR-209ENST00000549308 BCL2L11O43521 198 aa9.71□□□□□ -0.85
PTPRR-209ENST00000549308 SLC25A17O43808 307 aa9.71□□□□□ -0.85
PTPRR-209ENST00000549308 IGLV2-23P01705 113 aa9.71□□□□□ -0.85
PTPRR-209ENST00000549308 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.85
PTPRR-209ENST00000549308 PAX9P55771 341 aa9.71□□□□□ -0.85
PTPRR-209ENST00000549308 SPCS3P61009 180 aa9.71□□□□□ -0.85
PTPRR-209ENST00000549308 HES1Q14469 280 aa9.71□□□□□ -0.85
PTPRR-209ENST00000549308 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa9.71□□□□□ -0.85
PTPRR-209ENST00000549308 ZNF429Q86V71 674 aa9.71□□□□□ -0.85
PTPRR-209ENST00000549308 WFDC11Q8NEX6 87 aa9.71□□□□□ -0.85
PTPRR-209ENST00000549308 OR52E5Q8NH55 327 aa9.71□□□□□ -0.85
PTPRR-209ENST00000549308 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa9.71□□□□□ -0.85
PTPRR-209ENST00000549308 DTD1Q8TEA8 209 aa9.71□□□□□ -0.85
PTPRR-209ENST00000549308 ZDHHC16Q969W1 377 aa9.71□□□□□ -0.85
PTPRR-209ENST00000549308 SMIM8Q96KF7 97 aa9.71□□□□□ -0.85
PTPRR-209ENST00000549308 CLCC1Q96S66 551 aa9.71□□□□□ -0.85
PTPRR-209ENST00000549308 RNF5Q99942 180 aa9.71□□□□□ -0.85
PTPRR-209ENST00000549308 FOXC2Q99958 501 aa9.71□□□□□ -0.85
PTPRR-209ENST00000549308 ARPC5LQ9BPX5 153 aa9.71□□□□□ -0.85
PTPRR-209ENST00000549308 GON7Q9BXV9 100 aa9.71□□□□□ -0.85
PTPRR-209ENST00000549308 SLC25A31Q9H0C2 315 aa9.71□□□□□ -0.85
PTPRR-209ENST00000549308 SLA2Q9H6Q3 261 aa9.71□□□□□ -0.85
PTPRR-209ENST00000549308 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.85
PTPRR-209ENST00000549308 OR51B2Q9Y5P1 312 aa9.71□□□□□ -0.85
PTPRR-209ENST00000549308 IGSF23A1L1A6 192 aa9.71□□□□□ -0.86
PTPRR-209ENST00000549308 H3BP45 60 aa9.71□□□□□ -0.86
PTPRR-209ENST00000549308 TMEM50AO95807 157 aa9.71□□□□□ -0.86
PTPRR-209ENST00000549308 IGKV1D-33P01593 117 aa9.71□□□□□ -0.86
PTPRR-209ENST00000549308 IGKV1-33P01594 117 aa9.71□□□□□ -0.86
PTPRR-209ENST00000549308 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.86
PTPRR-209ENST00000549308 CNTFRP26992 372 aa9.71□□□□□ -0.86
PTPRR-209ENST00000549308 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.86
PTPRR-209ENST00000549308 HNF4GQ14541 408 aa9.71□□□□□ -0.86
PTPRR-209ENST00000549308 PSG5Q15238 335 aa9.71□□□□□ -0.86
PTPRR-209ENST00000549308 AARDQ4LEZ3 155 aa9.71□□□□□ -0.86
PTPRR-209ENST00000549308 CYB5R2Q6BCY4 276 aa9.71□□□□□ -0.86
PTPRR-209ENST00000549308 CLEC9AQ6UXN8 241 aa9.71□□□□□ -0.86
PTPRR-209ENST00000549308 BRD3OSQ6XYD6 125 aa9.71□□□□□ -0.86
PTPRR-209ENST00000549308 PIP4P2Q8N4L2 257 aa9.71□□□□□ -0.86
PTPRR-209ENST00000549308 TEX45Q8NA69 505 aa9.71□□□□□ -0.86
PTPRR-209ENST00000549308 OR2T10Q8NGZ9 312 aa9.71□□□□□ -0.86
PTPRR-209ENST00000549308 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.86
PTPRR-209ENST00000549308 HINT2Q9BX68 163 aa9.71□□□□□ -0.86
PTPRR-209ENST00000549308 ENY2Q9NPA8 101 aa9.71□□□□□ -0.86
PTPRR-209ENST00000549308 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.86
PTPRR-209ENST00000549308 TMEM14BQ9NUH8 114 aa9.71□□□□□ -0.86
PTPRR-209ENST00000549308 FKBP11Q9NYL4 201 aa9.71□□□□□ -0.86
PTPRR-209ENST00000549308 TCF19Q9Y242 345 aa9.71□□□□□ -0.86
PTPRR-209ENST00000549308 WSB1Q9Y6I7 421 aa9.71□□□□□ -0.86
PTPRR-209ENST00000549308 PTPN13Q12923 2485 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRR-209ENST00000549308 MOSP00540 346 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRR-209ENST00000549308 FGF2P09038 288 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRR-209ENST00000549308 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRR-209ENST00000549308 MYOD1P15172 320 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRR-209ENST00000549308 CD24P25063 80 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRR-209ENST00000549308 BRS3P32247 399 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRR-209ENST00000549308 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
PTPRR-209ENST00000549308 TAS2R30P59541 319 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRR-209ENST00000549308 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
PTPRR-209ENST00000549308 RPL8P62917 257 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
PTPRR-209ENST00000549308 IFITM2Q01629 132 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRR-209ENST00000549308 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP9.7□□□□□ -0.86
PTPRR-209ENST00000549308 SPANXN5Q5MJ07 72 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRR-209ENST00000549308 TMEM252Q8N6L7 170 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRR-209ENST00000549308 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
PTPRR-209ENST00000549308 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
PTPRR-209ENST00000549308 CR1P17927 2039 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRR-209ENST00000549308 SPDEFO95238 335 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRR-209ENST00000549308 OPN1MWP04001 364 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRR-209ENST00000549308 OPN1MW2P0DN77 364 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRR-209ENST00000549308 OPN1MW3P0DN78 364 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRR-209ENST00000549308 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
PTPRR-209ENST00000549308 PLGLAQ15195 96 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRR-209ENST00000549308 MMDQ15546 238 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRR-209ENST00000549308 SLC51BQ86UW2 128 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRR-209ENST00000549308 STX12Q86Y82 276 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRR-209ENST00000549308 OR8H1Q8NGG4 311 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRR-209ENST00000549308 AJUBAQ96IF1 538 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRR-209ENST00000549308 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
PTPRR-209ENST00000549308 SMIM3Q9BZL3 60 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRR-209ENST00000549308 COMMD5Q9GZQ3 224 aa9.69□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.8 ms