RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549221.5

CS-216, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-216ENST00000549221 TNFRSF19Q9NS68 423 aa6.49□□□□□ -1.37
CS-216ENST00000549221 MGAT4CQ9UBM8 478 aa6.49□□□□□ -1.37
CS-216ENST00000549221 CACNG5Q9UF02 275 aa6.49□□□□□ -1.37
CS-216ENST00000549221 TCF19Q9Y242 345 aa6.49□□□□□ -1.37
CS-216ENST00000549221 MMP24Q9Y5R2 645 aa6.49□□□□□ -1.37
CS-216ENST00000549221 TNCP24821 2201 aa6.48□□□□□ -1.37
CS-216ENST00000549221 A0A1B0GW64 132 aa6.48□□□□□ -1.37
CS-216ENST00000549221 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa6.48□□□□□ -1.37
CS-216ENST00000549221 FAM25EA8MYX2 175 aa6.48□□□□□ -1.37
CS-216ENST00000549221 UPK2O00526 184 aa6.48□□□□□ -1.37
CS-216ENST00000549221 FCN1O00602 326 aa6.48□□□□□ -1.37
CS-216ENST00000549221 RRHO14718 337 aa6.48□□□□□ -1.37
CS-216ENST00000549221 NBR2O15453 112 aa6.48□□□□□ -1.37
CS-216ENST00000549221 PLXNB1O43157 2135 aa6.48□□□□□ -1.37
CS-216ENST00000549221 KBTBD11O94819 623 aa6.48□□□□□ -1.37
CS-216ENST00000549221 NXPH3O95157 252 aa6.48□□□□□ -1.37
CS-216ENST00000549221 HRASP01112 189 aa6.48□□□□□ -1.37
CS-216ENST00000549221 AMY1AP04745 511 aa6.48□□□□□ -1.37
CS-216ENST00000549221 FAM106CPP0CH98 169 aa6.48□□□□□ -1.37
CS-216ENST00000549221 HLA-GP17693 338 aa6.48□□□□□ -1.37
CS-216ENST00000549221 SRD5A1P18405 259 aa6.48□□□□□ -1.37
CS-216ENST00000549221 ARHGDIBP52566 201 aa6.48□□□□□ -1.37
CS-216ENST00000549221 UBE2KP61086 200 aa6.48□□□□□ -1.37
CS-216ENST00000549221 RELBQ01201 579 aa6.48□□□□□ -1.37
CS-216ENST00000549221 CD300CQ08708 224 aa6.48□□□□□ -1.37
CS-216ENST00000549221 AANATQ16613 207 aa6.48□□□□□ -1.37
CS-216ENST00000549221 C10orf55Q5SWW7 151 aa6.48□□□□□ -1.37
CS-216ENST00000549221 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa6.48□□□□□ -1.37
CS-216ENST00000549221 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa6.48□□□□□ -1.37
CS-216ENST00000549221 TEX29Q8N6K0 151 aa6.48□□□□□ -1.37
CS-216ENST00000549221 NPBQ8NG41 125 aa6.48□□□□□ -1.37
CS-216ENST00000549221 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
CS-216ENST00000549221 ZDHHC16Q969W1 377 aa6.48□□□□□ -1.37
CS-216ENST00000549221 SLC25A33Q9BSK2 321 aa6.48□□□□□ -1.37
CS-216ENST00000549221 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
CS-216ENST00000549221 RAB18Q9NP72 206 aa6.48□□□□□ -1.37
CS-216ENST00000549221 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa6.48□□□□□ -1.37
CS-216ENST00000549221 SIGLEC9Q9Y336 463 aa6.48□□□□□ -1.37
CS-216ENST00000549221 TMED3Q9Y3Q3 217 aa6.48□□□□□ -1.37
CS-216ENST00000549221 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-216ENST00000549221 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-216ENST00000549221 HMX3A6NHT5 357 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-216ENST00000549221 CGB1A6NKQ9 187 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-216ENST00000549221 E7EUB6 86 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-216ENST00000549221 PITX3O75364 302 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-216ENST00000549221 OR2F2O95006 317 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-216ENST00000549221 OR2A4O95047 310 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-216ENST00000549221 SPDEFO95238 335 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-216ENST00000549221 LGALS7P47929 136 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-216ENST00000549221 ERVK-16P61578 105 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-216ENST00000549221 NDPQ00604 133 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-216ENST00000549221 IL15RAQ13261 267 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-216ENST00000549221 PRSS8Q16651 343 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-216ENST00000549221 C5orf64Q2M2E5 130 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-216ENST00000549221 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
CS-216ENST00000549221 Q5BKY6 102 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-216ENST00000549221 Q6ZS46 218 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-216ENST00000549221 C5orf56Q8N8D9 126 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-216ENST00000549221 TEX45Q8NA69 505 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-216ENST00000549221 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
CS-216ENST00000549221 OR4D5Q8NGN0 318 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-216ENST00000549221 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
CS-216ENST00000549221 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-216ENST00000549221 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP6.47□□□□□ -1.37
CS-216ENST00000549221 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
CS-216ENST00000549221 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
CS-216ENST00000549221 OR2A7Q96R45 310 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-216ENST00000549221 CLCC1Q96S66 551 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-216ENST00000549221 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
CS-216ENST00000549221 RNF5Q99942 180 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-216ENST00000549221 HSPB9Q9BQS6 159 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-216ENST00000549221 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
CS-216ENST00000549221 CHIAQ9BZP6 476 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-216ENST00000549221 BET1LQ9NYM9 111 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-216ENST00000549221 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
CS-216ENST00000549221 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
CS-216ENST00000549221 A0A1B0GU03 582 aa6.46□□□□□ -1.38
CS-216ENST00000549221 C5orf51A6NDU8 294 aa6.46□□□□□ -1.38
CS-216ENST00000549221 LINC01548A6NM66 108 aa6.46□□□□□ -1.38
CS-216ENST00000549221 C15orf61A6NNL5 157 aa6.46□□□□□ -1.38
CS-216ENST00000549221 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
CS-216ENST00000549221 G3V3Q6 166 aa6.46□□□□□ -1.38
CS-216ENST00000549221 SMLR1H3BR10 107 aa6.46□□□□□ -1.38
CS-216ENST00000549221 ST8SIA3O43173 380 aa6.46□□□□□ -1.38
CS-216ENST00000549221 CRLF1O75462 422 aa6.46□□□□□ -1.38
CS-216ENST00000549221 CA2P00918 260 aa6.46□□□□□ -1.38
CS-216ENST00000549221 IFNA21P01568 189 aa6.46□□□□□ -1.38
CS-216ENST00000549221 OPN1MWP04001 364 aa6.46□□□□□ -1.38
CS-216ENST00000549221 OPN1MW2P0DN77 364 aa6.46□□□□□ -1.38
CS-216ENST00000549221 OPN1MW3P0DN78 364 aa6.46□□□□□ -1.38
CS-216ENST00000549221 CD83Q01151 205 aa6.46□□□□□ -1.38
CS-216ENST00000549221 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
CS-216ENST00000549221 SMCO1Q147U7 214 aa6.46□□□□□ -1.38
CS-216ENST00000549221 VMA21Q3ZAQ7 101 aa6.46□□□□□ -1.38
CS-216ENST00000549221 AARDQ4LEZ3 155 aa6.46□□□□□ -1.38
CS-216ENST00000549221 SPINK9Q5DT21 86 aa6.46□□□□□ -1.38
CS-216ENST00000549221 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
CS-216ENST00000549221 GSG1LQ6UXU4 331 aa6.46□□□□□ -1.38
CS-216ENST00000549221 OR5R1Q8NH85 324 aa6.46□□□□□ -1.38
CS-216ENST00000549221 SSMEM1Q8WWF3 244 aa6.46□□□□□ -1.38
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