RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541576.5

THBS3-210, Transcript of thrombospondin 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene THBS3, Length 3,200 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS3-210ENST00000541576 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
THBS3-210ENST00000541576 BTNL8Q6UX41 500 aa7.13□□□□□ -1.27
THBS3-210ENST00000541576 HEPN1Q6WQI6 88 aa7.13□□□□□ -1.27
THBS3-210ENST00000541576 CLEC18CQ8NCF0 446 aa7.13□□□□□ -1.27
THBS3-210ENST00000541576 LEAP2Q969E1 77 aa7.13□□□□□ -1.27
THBS3-210ENST00000541576 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
THBS3-210ENST00000541576 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
THBS3-210ENST00000541576 MED13LQ71F56 2210 aa7.13□□□□□ -1.27
THBS3-210ENST00000541576 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa7.13□□□□□ -1.27
THBS3-210ENST00000541576 RNF212BA8MTL3 300 aa7.13□□□□□ -1.27
THBS3-210ENST00000541576 J3QKU1 62 aa7.13□□□□□ -1.27
THBS3-210ENST00000541576 ITGB1BP1O14713 200 aa7.13□□□□□ -1.27
THBS3-210ENST00000541576 HIST1H2BKO60814 126 aa7.13□□□□□ -1.27
THBS3-210ENST00000541576 HIST1H2BJP06899 126 aa7.13□□□□□ -1.27
THBS3-210ENST00000541576 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
THBS3-210ENST00000541576 HOXA5P20719 270 aa7.13□□□□□ -1.27
THBS3-210ENST00000541576 HIST1H2BOP23527 126 aa7.13□□□□□ -1.27
THBS3-210ENST00000541576 UCP1P25874 307 aa7.13□□□□□ -1.27
THBS3-210ENST00000541576 HIST1H2BBP33778 126 aa7.13□□□□□ -1.27
THBS3-210ENST00000541576 GPR12P47775 334 aa7.13□□□□□ -1.27
THBS3-210ENST00000541576 SULT1A2P50226 295 aa7.13□□□□□ -1.27
THBS3-210ENST00000541576 RAB7AP51149 207 aa7.13□□□□□ -1.27
THBS3-210ENST00000541576 HIST1H2BDP58876 126 aa7.13□□□□□ -1.27
THBS3-210ENST00000541576 HIST1H2BCP62807 126 aa7.13□□□□□ -1.27
THBS3-210ENST00000541576 HIST2H2BEQ16778 126 aa7.13□□□□□ -1.27
THBS3-210ENST00000541576 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
THBS3-210ENST00000541576 TMEM268Q5VZI3 342 aa7.13□□□□□ -1.27
THBS3-210ENST00000541576 ZNF695Q8IW36 515 aa7.13□□□□□ -1.27
THBS3-210ENST00000541576 HIST1H2BHQ93079 126 aa7.13□□□□□ -1.27
THBS3-210ENST00000541576 RAB39BQ96DA2 213 aa7.13□□□□□ -1.27
THBS3-210ENST00000541576 TMEM56Q96MV1 263 aa7.13□□□□□ -1.27
THBS3-210ENST00000541576 HIST1H2BNQ99877 126 aa7.13□□□□□ -1.27
THBS3-210ENST00000541576 HIST1H2BMQ99879 126 aa7.13□□□□□ -1.27
THBS3-210ENST00000541576 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
THBS3-210ENST00000541576 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
THBS3-210ENST00000541576 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa7.13□□□□□ -1.27
THBS3-210ENST00000541576 CDS2O95674 445 aa7.12□□□□□ -1.27
THBS3-210ENST00000541576 IGHV4-39P01824 125 aa7.12□□□□□ -1.27
THBS3-210ENST00000541576 SERPINE2P07093 398 aa7.12□□□□□ -1.27
THBS3-210ENST00000541576 FOLR2P14207 255 aa7.12□□□□□ -1.27
THBS3-210ENST00000541576 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
THBS3-210ENST00000541576 LINC00205P59089 165 aa7.12□□□□□ -1.27
THBS3-210ENST00000541576 TAS2R60P59551 318 aa7.12□□□□□ -1.27
THBS3-210ENST00000541576 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
THBS3-210ENST00000541576 ZNF525Q8N782 197 aa7.12□□□□□ -1.27
THBS3-210ENST00000541576 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
THBS3-210ENST00000541576 C2orf50Q96LR7 162 aa7.12□□□□□ -1.27
THBS3-210ENST00000541576 MAGT1Q9H0U3 335 aa7.12□□□□□ -1.27
THBS3-210ENST00000541576 IFI27L2Q9H2X8 130 aa7.12□□□□□ -1.27
THBS3-210ENST00000541576 ABCA12Q86UK0 2595 aa7.12□□□□□ -1.27
THBS3-210ENST00000541576 H3BQ15 152 aa7.12□□□□□ -1.27
THBS3-210ENST00000541576 EREGO14944 169 aa7.12□□□□□ -1.27
THBS3-210ENST00000541576 PROP1O75360 226 aa7.12□□□□□ -1.27
THBS3-210ENST00000541576 TRGC1P0CF51 173 aa7.12□□□□□ -1.27
THBS3-210ENST00000541576 SNCAP37840 140 aa7.12□□□□□ -1.27
THBS3-210ENST00000541576 PCP4P48539 62 aa7.12□□□□□ -1.27
THBS3-210ENST00000541576 CATR1Q13166 79 aa7.12□□□□□ -1.27
THBS3-210ENST00000541576 CT45A1Q5HYN5 189 aa7.12□□□□□ -1.27
THBS3-210ENST00000541576 BTNL3Q6UXE8 466 aa7.12□□□□□ -1.27
THBS3-210ENST00000541576 REC114Q7Z4M0 266 aa7.12□□□□□ -1.27
THBS3-210ENST00000541576 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
THBS3-210ENST00000541576 SLC35G3Q8N808 338 aa7.12□□□□□ -1.27
THBS3-210ENST00000541576 CT45A3Q8NHU0 189 aa7.12□□□□□ -1.27
THBS3-210ENST00000541576 NMES1Q9C002 83 aa7.12□□□□□ -1.27
THBS3-210ENST00000541576 SLC35B3Q9H1N7 401 aa7.12□□□□□ -1.27
THBS3-210ENST00000541576 POLQO75417 2590 aa7.12□□□□□ -1.27
THBS3-210ENST00000541576 MBP02144 154 aa7.12□□□□□ -1.27
THBS3-210ENST00000541576 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
THBS3-210ENST00000541576 GNG10P50151 68 aa7.12□□□□□ -1.27
THBS3-210ENST00000541576 DLX6P56179 175 aa7.12□□□□□ -1.27
THBS3-210ENST00000541576 GNB2P62879 340 aa7.12□□□□□ -1.27
THBS3-210ENST00000541576 RPL30P62888 115 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
THBS3-210ENST00000541576 DLK1P80370 383 aa7.12□□□□□ -1.27
THBS3-210ENST00000541576 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
THBS3-210ENST00000541576 ZNF439Q8NDP4 499 aa7.12□□□□□ -1.27
THBS3-210ENST00000541576 FRZBQ92765 325 aa7.12□□□□□ -1.27
THBS3-210ENST00000541576 TMED3Q9Y3Q3 217 aa7.12□□□□□ -1.27
THBS3-210ENST00000541576 IFNA10P01566 189 aa7.11□□□□□ -1.27
THBS3-210ENST00000541576 PET100P0DJ07 73 aa7.11□□□□□ -1.27
THBS3-210ENST00000541576 ZNF585BQ52M93 769 aa7.11□□□□□ -1.27
THBS3-210ENST00000541576 ZNF66Q6ZN08 573 aa7.11□□□□□ -1.27
THBS3-210ENST00000541576 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa7.11□□□□□ -1.27
THBS3-210ENST00000541576 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa7.11□□□□□ -1.27
THBS3-210ENST00000541576 IL22RA2Q969J5 263 aa7.11□□□□□ -1.27
THBS3-210ENST00000541576 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
THBS3-210ENST00000541576 GAB2Q9UQC2 676 aa7.11□□□□□ -1.27
THBS3-210ENST00000541576 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
THBS3-210ENST00000541576 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa7.11□□□□□ -1.27
THBS3-210ENST00000541576 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa7.11□□□□□ -1.27
THBS3-210ENST00000541576 ZFP92A6NM28 416 aa7.11□□□□□ -1.27
THBS3-210ENST00000541576 IGKV1-39P01597 117 aa7.11□□□□□ -1.27
THBS3-210ENST00000541576 IGKV1D-39P04432 117 aa7.11□□□□□ -1.27
THBS3-210ENST00000541576 PPIAL4GP0DN37 164 aa7.11□□□□□ -1.27
THBS3-210ENST00000541576 PDLIM4P50479 330 aa7.11□□□□□ -1.27
THBS3-210ENST00000541576 BRWD1-AS2P59051 145 aa7.11□□□□□ -1.27
THBS3-210ENST00000541576 SLC25A24Q6NUK1 477 aa7.11□□□□□ -1.27
THBS3-210ENST00000541576 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
THBS3-210ENST00000541576 C8orf46Q8TAG6 207 aa7.11□□□□□ -1.27
THBS3-210ENST00000541576 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
THBS3-210ENST00000541576 PARP11Q9NR21 331 aa7.11□□□□□ -1.27
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