RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538923.1

MRE11-208, Transcript of MRE11 homolog, double strand break repair nuclease, humanhuman

TSL 5

Gene MRE11, Length 558 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRE11-208ENST00000538923 CRYZL1O95825 349 aa6.67□□□□□ -1.34
MRE11-208ENST00000538923 LY6G6CO95867 125 aa6.67□□□□□ -1.34
MRE11-208ENST00000538923 PRH1P02810 166 aa6.67□□□□□ -1.34
MRE11-208ENST00000538923 CDK1P06493 297 aa6.67□□□□□ -1.34
MRE11-208ENST00000538923 FCGR3AP08637 254 aa6.67□□□□□ -1.34
MRE11-208ENST00000538923 GNAO1P09471 354 aa6.67□□□□□ -1.34
MRE11-208ENST00000538923 CD3GP09693 182 aa6.67□□□□□ -1.34
MRE11-208ENST00000538923 GSTT2P0CG29 244 aa6.67□□□□□ -1.34
MRE11-208ENST00000538923 GSTT2BP0CG30 244 aa6.67□□□□□ -1.34
MRE11-208ENST00000538923 MAP2K4P45985 399 aa6.67□□□□□ -1.34
MRE11-208ENST00000538923 ZNF45Q02386 682 aa6.67□□□□□ -1.34
MRE11-208ENST00000538923 CDK10Q15131 360 aa6.67□□□□□ -1.34
MRE11-208ENST00000538923 SPHARQ15513 63 aa6.67□□□□□ -1.34
MRE11-208ENST00000538923 IGSF11Q5DX21 431 aa6.67□□□□□ -1.34
MRE11-208ENST00000538923 TTC9CQ8N5M4 171 aa6.67□□□□□ -1.34
MRE11-208ENST00000538923 DDB2Q92466 427 aa6.67□□□□□ -1.34
MRE11-208ENST00000538923 GINS4Q9BRT9 223 aa6.67□□□□□ -1.34
MRE11-208ENST00000538923 GGTLC1Q9BX51 225 aa6.67□□□□□ -1.34
MRE11-208ENST00000538923 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
MRE11-208ENST00000538923 NUPR2A6NF83 97 aa6.66□□□□□ -1.34
MRE11-208ENST00000538923 PPP5D1E7EU14 171 aa6.66□□□□□ -1.34
MRE11-208ENST00000538923 DENRO43583 198 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
MRE11-208ENST00000538923 OR2C1O95371 312 aa6.66□□□□□ -1.34
MRE11-208ENST00000538923 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
MRE11-208ENST00000538923 CBLN1P23435 193 aa6.66□□□□□ -1.34
MRE11-208ENST00000538923 DUTP33316 252 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
MRE11-208ENST00000538923 MED22Q15528 200 aa6.66□□□□□ -1.34
MRE11-208ENST00000538923 TRAM1Q15629 374 aa6.66□□□□□ -1.34
MRE11-208ENST00000538923 ANKRD55Q3KP44 614 aa6.66□□□□□ -1.34
MRE11-208ENST00000538923 LIPKQ5VXJ0 399 aa6.66□□□□□ -1.34
MRE11-208ENST00000538923 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
MRE11-208ENST00000538923 GPHB5Q86YW7 130 aa6.66□□□□□ -1.34
MRE11-208ENST00000538923 MMD2Q8IY49 270 aa6.66□□□□□ -1.34
MRE11-208ENST00000538923 OR52B4Q8NGK2 314 aa6.66□□□□□ -1.34
MRE11-208ENST00000538923 UFD1Q92890 307 aa6.66□□□□□ -1.34
MRE11-208ENST00000538923 TMEM203Q969S6 136 aa6.66□□□□□ -1.34
MRE11-208ENST00000538923 FAM3DQ96BQ1 224 aa6.66□□□□□ -1.34
MRE11-208ENST00000538923 RAB3CQ96E17 227 aa6.66□□□□□ -1.34
MRE11-208ENST00000538923 C5orf30Q96GV9 206 aa6.66□□□□□ -1.34
MRE11-208ENST00000538923 GFI1Q99684 422 aa6.66□□□□□ -1.34
MRE11-208ENST00000538923 OVOL2Q9BRP0 275 aa6.66□□□□□ -1.34
MRE11-208ENST00000538923 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa6.66□□□□□ -1.34
MRE11-208ENST00000538923 RAB22AQ9UL26 194 aa6.66□□□□□ -1.34
MRE11-208ENST00000538923 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa6.66□□□□□ -1.34
MRE11-208ENST00000538923 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
MRE11-208ENST00000538923 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
MRE11-208ENST00000538923 DMRT1Q9Y5R6 373 aa6.66□□□□□ -1.34
MRE11-208ENST00000538923 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
MRE11-208ENST00000538923 LINC00473A8K010 186 aa6.65□□□□□ -1.34
MRE11-208ENST00000538923 PTGES3LE9PB15 166 aa6.65□□□□□ -1.34
MRE11-208ENST00000538923 OR2J3O76001 311 aa6.65□□□□□ -1.34
MRE11-208ENST00000538923 NDUFB8O95169 186 aa6.65□□□□□ -1.34
MRE11-208ENST00000538923 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
MRE11-208ENST00000538923 EDN2P20800 178 aa6.65□□□□□ -1.34
MRE11-208ENST00000538923 GADD45AP24522 165 aa6.65□□□□□ -1.34
MRE11-208ENST00000538923 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
MRE11-208ENST00000538923 ARL3P36405 182 aa6.65□□□□□ -1.34
MRE11-208ENST00000538923 PSMD7P51665 324 aa6.65□□□□□ -1.34
MRE11-208ENST00000538923 CLDN12P56749 244 aa6.65□□□□□ -1.34
MRE11-208ENST00000538923 C2orf76Q3KRA6 126 aa6.65□□□□□ -1.34
MRE11-208ENST00000538923 FAM106AQ4KMX7 169 aa6.65□□□□□ -1.34
MRE11-208ENST00000538923 TMEM91Q6ZNR0 172 aa6.65□□□□□ -1.34
MRE11-208ENST00000538923 TMEM61Q8N0U2 210 aa6.65□□□□□ -1.34
MRE11-208ENST00000538923 VSTM2AQ8TAG5 236 aa6.65□□□□□ -1.34
MRE11-208ENST00000538923 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa6.65□□□□□ -1.34
MRE11-208ENST00000538923 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
MRE11-208ENST00000538923 KCNK7Q9Y2U2 307 aa6.65□□□□□ -1.34
MRE11-208ENST00000538923 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa6.65□□□□□ -1.34
MRE11-208ENST00000538923 ALMS1Q8TCU4 4167 aa6.65□□□□□ -1.35
MRE11-208ENST00000538923 ZNF320A2RRD8 509 aa6.64□□□□□ -1.35
MRE11-208ENST00000538923 DPPA5A6NC42 116 aa6.64□□□□□ -1.35
MRE11-208ENST00000538923 NPIPB5A8MRT5 1133 aa6.64□□□□□ -1.35
MRE11-208ENST00000538923 A8MWP6 167 aa6.64□□□□□ -1.35
MRE11-208ENST00000538923 FCGR3BO75015 233 aa6.64□□□□□ -1.35
MRE11-208ENST00000538923 DHFRP00374 187 aa6.64□□□□□ -1.35
MRE11-208ENST00000538923 HSMCR30P0CW71 290 aa6.64□□□□□ -1.35
MRE11-208ENST00000538923 GNB3P16520 340 aa6.64□□□□□ -1.35
MRE11-208ENST00000538923 CD36P16671 472 aa6.64□□□□□ -1.35
MRE11-208ENST00000538923 CALRP27797 417 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
MRE11-208ENST00000538923 TALDO1P37837 337 aa6.64□□□□□ -1.35
MRE11-208ENST00000538923 TNFRSF9Q07011 255 aa6.64□□□□□ -1.35
MRE11-208ENST00000538923 PMS2P11Q13670 270 aa6.64□□□□□ -1.35
MRE11-208ENST00000538923 C10orf55Q5SWW7 151 aa6.64□□□□□ -1.35
MRE11-208ENST00000538923 OR4A47Q6IF82 309 aa6.64□□□□□ -1.35
MRE11-208ENST00000538923 KCTD9Q7L273 389 aa6.64□□□□□ -1.35
MRE11-208ENST00000538923 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
MRE11-208ENST00000538923 ZNF645Q8N7E2 425 aa6.64□□□□□ -1.35
MRE11-208ENST00000538923 OR10R2Q8NGX6 335 aa6.64□□□□□ -1.35
MRE11-208ENST00000538923 CACNG8Q8WXS5 425 aa6.64□□□□□ -1.35
MRE11-208ENST00000538923 MAFIPQ8WZ33 124 aa6.64□□□□□ -1.35
MRE11-208ENST00000538923 ST8SIA2Q92186 375 aa6.64□□□□□ -1.35
MRE11-208ENST00000538923 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa6.64□□□□□ -1.35
MRE11-208ENST00000538923 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa6.64□□□□□ -1.35
MRE11-208ENST00000538923 MLXQ9UH92 298 aa6.64□□□□□ -1.35
MRE11-208ENST00000538923 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa6.64□□□□□ -1.35
MRE11-208ENST00000538923 V9GY05 133 aa6.64□□□□□ -1.35
MRE11-208ENST00000538923 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa6.63□□□□□ -1.35
MRE11-208ENST00000538923 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa6.63□□□□□ -1.35
MRE11-208ENST00000538923 A0A0J9YWU9 116 aa6.63□□□□□ -1.35
MRE11-208ENST00000538923 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa6.63□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 278.3 ms