RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000537304.5

LMO3-215, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO3, Length 1,685 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-215ENST00000537304 TBR1Q16650 682 aa9.04□□□□□ -0.96
LMO3-215ENST00000537304 SPATA46Q5T0L3 261 aa9.04□□□□□ -0.96
LMO3-215ENST00000537304 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa9.04□□□□□ -0.96
LMO3-215ENST00000537304 FGFBP3Q8TAT2 258 aa9.04□□□□□ -0.96
LMO3-215ENST00000537304 TSKUQ8WUA8 353 aa9.04□□□□□ -0.96
LMO3-215ENST00000537304 C19orf24Q9BVV8 132 aa9.04□□□□□ -0.96
LMO3-215ENST00000537304 GGTLC1Q9BX51 225 aa9.04□□□□□ -0.96
LMO3-215ENST00000537304 NPVFQ9HCQ7 196 aa9.04□□□□□ -0.96
LMO3-215ENST00000537304 WNT16Q9UBV4 365 aa9.04□□□□□ -0.96
LMO3-215ENST00000537304 FER1L5A0AVI2 2057 aa9.04□□□□□ -0.96
LMO3-215ENST00000537304 CXCL13O43927 109 aa9.04□□□□□ -0.96
LMO3-215ENST00000537304 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
LMO3-215ENST00000537304 OR2H2O95918 312 aa9.04□□□□□ -0.96
LMO3-215ENST00000537304 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
LMO3-215ENST00000537304 MLF1P58340 268 aa9.04□□□□□ -0.96
LMO3-215ENST00000537304 B3GALT5-AS1P59052 145 aa9.04□□□□□ -0.96
LMO3-215ENST00000537304 ARF6P62330 175 aa9.04□□□□□ -0.96
LMO3-215ENST00000537304 PSG7Q13046 419 aa9.04□□□□□ -0.96
LMO3-215ENST00000537304 ETFRF1Q6IPR1 90 aa9.04□□□□□ -0.96
LMO3-215ENST00000537304 VWA1Q6PCB0 445 aa9.04□□□□□ -0.96
LMO3-215ENST00000537304 TRAT1Q6PIZ9 186 aa9.04□□□□□ -0.96
LMO3-215ENST00000537304 TREML4Q6UXN2 200 aa9.04□□□□□ -0.96
LMO3-215ENST00000537304 OR2M7Q8NG81 312 aa9.04□□□□□ -0.96
LMO3-215ENST00000537304 OCIAD1Q9NX40 245 aa9.04□□□□□ -0.96
LMO3-215ENST00000537304 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
LMO3-215ENST00000537304 SEC16AO15027 2179 aa9.03□□□□□ -0.96
LMO3-215ENST00000537304 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa9.03□□□□□ -0.96
LMO3-215ENST00000537304 HSBP1L1C9JCN9 74 aa9.03□□□□□ -0.96
LMO3-215ENST00000537304 F2Z2F3 143 aa9.03□□□□□ -0.96
LMO3-215ENST00000537304 H0YJW9 148 aa9.03□□□□□ -0.96
LMO3-215ENST00000537304 BMPR1BO00238 502 aa9.03□□□□□ -0.96
LMO3-215ENST00000537304 P04436 131 aa9.03□□□□□ -0.96
LMO3-215ENST00000537304 CCNOP22674 350 aa9.03□□□□□ -0.96
LMO3-215ENST00000537304 KIR2DS2P43631 304 aa9.03□□□□□ -0.96
LMO3-215ENST00000537304 GFRA1P56159 465 aa9.03□□□□□ -0.96
LMO3-215ENST00000537304 BPIFB3P59826 476 aa9.03□□□□□ -0.96
LMO3-215ENST00000537304 ERVK-16P61578 105 aa9.03□□□□□ -0.96
LMO3-215ENST00000537304 ARF1P84077 181 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
LMO3-215ENST00000537304 ZNF146Q15072 292 aa9.03□□□□□ -0.96
LMO3-215ENST00000537304 OCIAD2Q56VL3 154 aa9.03□□□□□ -0.96
LMO3-215ENST00000537304 CENPWQ5EE01 88 aa9.03□□□□□ -0.96
LMO3-215ENST00000537304 SLC35E4Q6ICL7 350 aa9.03□□□□□ -0.96
LMO3-215ENST00000537304 GGNQ86UU5 652 aa9.03□□□□□ -0.96
LMO3-215ENST00000537304 OR8B3Q8NGG8 313 aa9.03□□□□□ -0.96
LMO3-215ENST00000537304 ZDHHC16Q969W1 377 aa9.03□□□□□ -0.96
LMO3-215ENST00000537304 OR2V2Q96R30 315 aa9.03□□□□□ -0.96
LMO3-215ENST00000537304 OR8B2Q96RD0 313 aa9.03□□□□□ -0.96
LMO3-215ENST00000537304 CST9LQ9H4G1 147 aa9.03□□□□□ -0.96
LMO3-215ENST00000537304 HES4Q9HCC6 221 aa9.03□□□□□ -0.96
LMO3-215ENST00000537304 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP9.03□□□□□ -0.96
LMO3-215ENST00000537304 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
LMO3-215ENST00000537304 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
LMO3-215ENST00000537304 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa9.03□□□□□ -0.96
LMO3-215ENST00000537304 SZT2Q5T011 3432 aa9.02□□□□□ -0.97
LMO3-215ENST00000537304 PCDH15Q96QU1 1955 aa9.02□□□□□ -0.97
LMO3-215ENST00000537304 TRAV34A0A0B4J273 112 aa9.02□□□□□ -0.97
LMO3-215ENST00000537304 FAM181BA6NEQ2 426 aa9.02□□□□□ -0.97
LMO3-215ENST00000537304 CBY3A6NI87 242 aa9.02□□□□□ -0.97
LMO3-215ENST00000537304 M0R2Z0 102 aa9.02□□□□□ -0.97
LMO3-215ENST00000537304 RAMP3O60896 148 aa9.02□□□□□ -0.97
LMO3-215ENST00000537304 NTF3P20783 257 aa9.02□□□□□ -0.97
LMO3-215ENST00000537304 USF1P22415 310 aaPredicted RBP9.02□□□□□ -0.97
LMO3-215ENST00000537304 FOXL2P58012 376 aa9.02□□□□□ -0.97
LMO3-215ENST00000537304 TAS2R45P59539 299 aa9.02□□□□□ -0.97
LMO3-215ENST00000537304 PRR27Q6MZM9 219 aa9.02□□□□□ -0.97
LMO3-215ENST00000537304 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
LMO3-215ENST00000537304 TEPPQ6URK8 271 aa9.02□□□□□ -0.97
LMO3-215ENST00000537304 OR4A16Q8NH70 328 aa9.02□□□□□ -0.97
LMO3-215ENST00000537304 OR10D3Q8NH80 312 aa9.02□□□□□ -0.97
LMO3-215ENST00000537304 POM121L2Q96KW2 1035 aa9.02□□□□□ -0.97
LMO3-215ENST00000537304 MGST2Q99735 147 aa9.02□□□□□ -0.97
LMO3-215ENST00000537304 SPOCK3Q9BQ16 436 aa9.02□□□□□ -0.97
LMO3-215ENST00000537304 PMCHL2Q9BQD1 86 aa9.02□□□□□ -0.97
LMO3-215ENST00000537304 CLEC7AQ9BXN2 247 aa9.02□□□□□ -0.97
LMO3-215ENST00000537304 PROK2Q9HC23 129 aa9.02□□□□□ -0.97
LMO3-215ENST00000537304 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP9.02□□□□□ -0.97
LMO3-215ENST00000537304 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
LMO3-215ENST00000537304 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa9.01□□□□□ -0.97
LMO3-215ENST00000537304 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa9.01□□□□□ -0.97
LMO3-215ENST00000537304 A0A1W2PR80 420 aa9.01□□□□□ -0.97
LMO3-215ENST00000537304 M0R1X1 148 aa9.01□□□□□ -0.97
LMO3-215ENST00000537304 GDF9O60383 454 aa9.01□□□□□ -0.97
LMO3-215ENST00000537304 CIDEAO60543 219 aa9.01□□□□□ -0.97
LMO3-215ENST00000537304 NGFP01138 241 aa9.01□□□□□ -0.97
LMO3-215ENST00000537304 HLA-DRB1P01911 266 aa9.01□□□□□ -0.97
LMO3-215ENST00000537304 ARG2P78540 354 aa9.01□□□□□ -0.97
LMO3-215ENST00000537304 OR1C1Q15619 314 aa9.01□□□□□ -0.97
LMO3-215ENST00000537304 EFNB3Q15768 340 aa9.01□□□□□ -0.97
LMO3-215ENST00000537304 GCSAMLQ5JQS6 135 aa9.01□□□□□ -0.97
LMO3-215ENST00000537304 PQLC2Q6ZP29 291 aa9.01□□□□□ -0.97
LMO3-215ENST00000537304 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa9.01□□□□□ -0.97
LMO3-215ENST00000537304 OR4F17Q8NGA8 305 aa9.01□□□□□ -0.97
LMO3-215ENST00000537304 LOXL4Q96JB6 756 aa9.01□□□□□ -0.97
LMO3-215ENST00000537304 IMMP1LQ96LU5 166 aa9.01□□□□□ -0.97
LMO3-215ENST00000537304 TMEM70Q9BUB7 260 aa9.01□□□□□ -0.97
LMO3-215ENST00000537304 WNT10AQ9GZT5 417 aa9.01□□□□□ -0.97
LMO3-215ENST00000537304 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
LMO3-215ENST00000537304 RNF114Q9Y508 228 aa9.01□□□□□ -0.97
LMO3-215ENST00000537304 C17orf98A8MV24 154 aa9□□□□□ -0.97
LMO3-215ENST00000537304 OR2J3O76001 311 aa9□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.4 ms