RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519815.5

TRPS1-210, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 3

Gene TRPS1, Length 584 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-210ENST00000519815 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
TRPS1-210ENST00000519815 OR9G9P0C7N8 305 aa8.4□□□□□ -1.06
TRPS1-210ENST00000519815 SAA4P35542 130 aa8.4□□□□□ -1.06
TRPS1-210ENST00000519815 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
TRPS1-210ENST00000519815 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
TRPS1-210ENST00000519815 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
TRPS1-210ENST00000519815 GPR157Q5UAW9 335 aa8.4□□□□□ -1.06
TRPS1-210ENST00000519815 OR4A47Q6IF82 309 aa8.4□□□□□ -1.06
TRPS1-210ENST00000519815 C9orf62Q8N4C0 152 aa8.4□□□□□ -1.06
TRPS1-210ENST00000519815 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
TRPS1-210ENST00000519815 OR4A5Q8NH83 315 aa8.4□□□□□ -1.06
TRPS1-210ENST00000519815 VSTM2AQ8TAG5 236 aa8.4□□□□□ -1.06
TRPS1-210ENST00000519815 DCUN1D4Q92564 292 aa8.4□□□□□ -1.06
TRPS1-210ENST00000519815 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
TRPS1-210ENST00000519815 MFFQ9GZY8 342 aa8.4□□□□□ -1.06
TRPS1-210ENST00000519815 MAGT1Q9H0U3 335 aa8.4□□□□□ -1.06
TRPS1-210ENST00000519815 OR5AC2Q9NZP5 309 aa8.4□□□□□ -1.06
TRPS1-210ENST00000519815 TNFSF18Q9UNG2 199 aa8.4□□□□□ -1.06
TRPS1-210ENST00000519815 NSG2Q9Y328 171 aa8.4□□□□□ -1.06
TRPS1-210ENST00000519815 HSPB11Q9Y547 144 aa8.4□□□□□ -1.06
TRPS1-210ENST00000519815 CELSR2Q9HCU4 2923 aa8.4□□□□□ -1.06
TRPS1-210ENST00000519815 TACC2O95359 2948 aa8.39□□□□□ -1.07
TRPS1-210ENST00000519815 TRAV40A0A0B4J280 105 aa8.39□□□□□ -1.07
TRPS1-210ENST00000519815 ANKRD34BA5PLL1 514 aa8.39□□□□□ -1.07
TRPS1-210ENST00000519815 L7N2F9 121 aa8.39□□□□□ -1.07
TRPS1-210ENST00000519815 UPK2O00526 184 aa8.39□□□□□ -1.07
TRPS1-210ENST00000519815 SYNGR2O43760 224 aa8.39□□□□□ -1.07
TRPS1-210ENST00000519815 CHST1O43916 411 aa8.39□□□□□ -1.07
TRPS1-210ENST00000519815 NXPH3O95157 252 aa8.39□□□□□ -1.07
TRPS1-210ENST00000519815 VENTXO95231 258 aa8.39□□□□□ -1.07
TRPS1-210ENST00000519815 C4BPBP20851 252 aa8.39□□□□□ -1.07
TRPS1-210ENST00000519815 BRS3P32247 399 aa8.39□□□□□ -1.07
TRPS1-210ENST00000519815 UBE2KP61086 200 aa8.39□□□□□ -1.07
TRPS1-210ENST00000519815 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP8.39□□□□□ -1.07
TRPS1-210ENST00000519815 VAMP2P63027 116 aa8.39□□□□□ -1.07
TRPS1-210ENST00000519815 TNFRSF9Q07011 255 aa8.39□□□□□ -1.07
TRPS1-210ENST00000519815 VMA21Q3ZAQ7 101 aa8.39□□□□□ -1.07
TRPS1-210ENST00000519815 AARDQ4LEZ3 155 aa8.39□□□□□ -1.07
TRPS1-210ENST00000519815 TM4SF20Q53R12 229 aa8.39□□□□□ -1.07
TRPS1-210ENST00000519815 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa8.39□□□□□ -1.07
TRPS1-210ENST00000519815 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa8.39□□□□□ -1.07
TRPS1-210ENST00000519815 THNSL2Q86YJ6 484 aa8.39□□□□□ -1.07
TRPS1-210ENST00000519815 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
TRPS1-210ENST00000519815 DYNAPQ8N1N2 210 aa8.39□□□□□ -1.07
TRPS1-210ENST00000519815 OR52E5Q8NH55 327 aa8.39□□□□□ -1.07
TRPS1-210ENST00000519815 C17orf50Q8WW18 174 aa8.39□□□□□ -1.07
TRPS1-210ENST00000519815 CFHR4Q92496 578 aa8.39□□□□□ -1.07
TRPS1-210ENST00000519815 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
TRPS1-210ENST00000519815 AJUBAQ96IF1 538 aa8.39□□□□□ -1.07
TRPS1-210ENST00000519815 CLUHP3Q96NS8 147 aa8.39□□□□□ -1.07
TRPS1-210ENST00000519815 RAB40CQ96S21 281 aa8.39□□□□□ -1.07
TRPS1-210ENST00000519815 FKBP11Q9NYL4 201 aa8.39□□□□□ -1.07
TRPS1-210ENST00000519815 BET1LQ9NYM9 111 aa8.39□□□□□ -1.07
TRPS1-210ENST00000519815 HSPB7Q9UBY9 170 aa8.39□□□□□ -1.07
TRPS1-210ENST00000519815 PRNDQ9UKY0 176 aa8.39□□□□□ -1.07
TRPS1-210ENST00000519815 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
TRPS1-210ENST00000519815 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
TRPS1-210ENST00000519815 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa8.38□□□□□ -1.07
TRPS1-210ENST00000519815 TRAV3A0A0B4J244 114 aa8.38□□□□□ -1.07
TRPS1-210ENST00000519815 A0A0D9SG52 128 aa8.38□□□□□ -1.07
TRPS1-210ENST00000519815 SSSCA1O60232 199 aa8.38□□□□□ -1.07
TRPS1-210ENST00000519815 GPR137BO60478 399 aa8.38□□□□□ -1.07
TRPS1-210ENST00000519815 ATP6V1G1O75348 118 aa8.38□□□□□ -1.07
TRPS1-210ENST00000519815 KBTBD11O94819 623 aa8.38□□□□□ -1.07
TRPS1-210ENST00000519815 OR2F2O95006 317 aa8.38□□□□□ -1.07
TRPS1-210ENST00000519815 MOSP00540 346 aa8.38□□□□□ -1.07
TRPS1-210ENST00000519815 IFNA17P01571 189 aa8.38□□□□□ -1.07
TRPS1-210ENST00000519815 IGLV2-23P01705 113 aa8.38□□□□□ -1.07
TRPS1-210ENST00000519815 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
TRPS1-210ENST00000519815 CXCL2P19875 107 aa8.38□□□□□ -1.07
TRPS1-210ENST00000519815 P2RY1P47900 373 aa8.38□□□□□ -1.07
TRPS1-210ENST00000519815 BPIFB3P59826 476 aa8.38□□□□□ -1.07
TRPS1-210ENST00000519815 SPCS3P61009 180 aa8.38□□□□□ -1.07
TRPS1-210ENST00000519815 OR2F1Q13607 317 aa8.38□□□□□ -1.07
TRPS1-210ENST00000519815 PSG5Q15238 335 aa8.38□□□□□ -1.07
TRPS1-210ENST00000519815 ZNF429Q86V71 674 aa8.38□□□□□ -1.07
TRPS1-210ENST00000519815 TEX45Q8NA69 505 aa8.38□□□□□ -1.07
TRPS1-210ENST00000519815 OR2T10Q8NGZ9 312 aa8.38□□□□□ -1.07
TRPS1-210ENST00000519815 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa8.38□□□□□ -1.07
TRPS1-210ENST00000519815 RITA1Q96K30 269 aa8.38□□□□□ -1.07
TRPS1-210ENST00000519815 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
TRPS1-210ENST00000519815 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa8.38□□□□□ -1.07
TRPS1-210ENST00000519815 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
TRPS1-210ENST00000519815 POLQO75417 2590 aa8.38□□□□□ -1.07
TRPS1-210ENST00000519815 ABCA12Q86UK0 2595 aa8.38□□□□□ -1.07
TRPS1-210ENST00000519815 MED13LQ71F56 2210 aa8.38□□□□□ -1.07
TRPS1-210ENST00000519815 CENPEQ02224 2701 aa8.38□□□□□ -1.07
TRPS1-210ENST00000519815 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
TRPS1-210ENST00000519815 APCP25054 2843 aa8.37□□□□□ -1.07
TRPS1-210ENST00000519815 RNF222A6NCQ9 220 aa8.37□□□□□ -1.07
TRPS1-210ENST00000519815 C15orf61A6NNL5 157 aa8.37□□□□□ -1.07
TRPS1-210ENST00000519815 SLC25A17O43808 307 aa8.37□□□□□ -1.07
TRPS1-210ENST00000519815 LY86O95711 162 aa8.37□□□□□ -1.07
TRPS1-210ENST00000519815 IGKV1D-33P01593 117 aa8.37□□□□□ -1.07
TRPS1-210ENST00000519815 IGKV1-33P01594 117 aa8.37□□□□□ -1.07
TRPS1-210ENST00000519815 FGF2P09038 288 aa8.37□□□□□ -1.07
TRPS1-210ENST00000519815 FAM106CPP0CH98 169 aa8.37□□□□□ -1.07
TRPS1-210ENST00000519815 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa8.37□□□□□ -1.07
TRPS1-210ENST00000519815 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
TRPS1-210ENST00000519815 TAS2R30P59541 319 aa8.37□□□□□ -1.07
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