RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517728.1

IGHVII-44-2-201, Transcript of immunoglobulin heavy variable (II)-44-2 (pseudogene), humanhuman

BASIC

Gene IGHVII-44-2, Length 250 nt, Biotype IG V pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 RORCP51449 518 aa4□□□□□ -1.77
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 LINC00205P59089 165 aa4□□□□□ -1.77
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 NCS1P62166 190 aa4□□□□□ -1.77
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 TNXAQ16473 311 aa4□□□□□ -1.77
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 PRSS8Q16651 343 aa4□□□□□ -1.77
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 DEFB136Q30KP8 78 aa4□□□□□ -1.77
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 FAM209BQ5JX69 171 aa4□□□□□ -1.77
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 SLC25A42Q86VD7 318 aa4□□□□□ -1.77
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa4□□□□□ -1.77
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 GVQW1Q8N7I0 195 aa4□□□□□ -1.77
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 OR5H2Q8NGV7 314 aa4□□□□□ -1.77
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 CD300LFQ8TDQ1 290 aa4□□□□□ -1.77
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 C15orf40Q8WUR7 153 aa4□□□□□ -1.77
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 SECTM1Q8WVN6 248 aa4□□□□□ -1.77
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 GIMAP1Q8WWP7 306 aa4□□□□□ -1.77
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 C5orf30Q96GV9 206 aa4□□□□□ -1.77
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 C20orf173Q96LM9 149 aa4□□□□□ -1.77
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 DUX3Q96PT4 197 aa4□□□□□ -1.77
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 OR5B12Q96R08 314 aa4□□□□□ -1.77
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 SPIN2AQ99865 258 aa4□□□□□ -1.77
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa4□□□□□ -1.77
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 SLC5A7Q9GZV3 580 aa4□□□□□ -1.77
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 KLK15Q9H2R5 256 aa4□□□□□ -1.77
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 GNB4Q9HAV0 340 aa4□□□□□ -1.77
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 SCPEP1Q9HB40 452 aa4□□□□□ -1.77
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa4□□□□□ -1.77
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 TAS2R8Q9NYW2 309 aa4□□□□□ -1.77
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 COMMD3Q9UBI1 195 aa4□□□□□ -1.77
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa3.99□□□□□ -1.77
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 DPPA5A6NC42 116 aa3.99□□□□□ -1.77
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 FAM223BA6NKX1 122 aa3.99□□□□□ -1.77
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 SULT1C2O00338 296 aa3.99□□□□□ -1.77
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 OVOL1O14753 267 aa3.99□□□□□ -1.77
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 NOL3O60936 208 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 TPPPO94811 219 aa3.99□□□□□ -1.77
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 OR2A4O95047 310 aa3.99□□□□□ -1.77
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 DHFRP00374 187 aa3.99□□□□□ -1.77
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 IGLV2-14P01704 120 aa3.99□□□□□ -1.77
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 OR9G9P0C7N8 305 aa3.99□□□□□ -1.77
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 SMIM18P0DKX4 95 aa3.99□□□□□ -1.77
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 IGKV1-13P0DP09 117 aa3.99□□□□□ -1.77
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 ZP3P21754 424 aa3.99□□□□□ -1.77
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 RCVRNP35243 200 aa3.99□□□□□ -1.77
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 MAS1LP35410 378 aa3.99□□□□□ -1.77
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 TGFBR1P36897 503 aa3.99□□□□□ -1.77
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 TAS2R31P59538 309 aa3.99□□□□□ -1.77
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 FXYD4P59646 89 aa3.99□□□□□ -1.77
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 VBP1P61758 197 aa3.99□□□□□ -1.77
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 DYRK1AQ13627 763 aa3.99□□□□□ -1.77
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 TATDN3Q17R31 274 aa3.99□□□□□ -1.77
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 OR2B11Q5JQS5 317 aa3.99□□□□□ -1.77
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 TOR2AQ5JU69 321 aa3.99□□□□□ -1.77
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 LPCAT3Q6P1A2 487 aa3.99□□□□□ -1.77
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 GPR141Q7Z602 305 aa3.99□□□□□ -1.77
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 ZNF429Q86V71 674 aa3.99□□□□□ -1.77
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 FAM223AQ8IWN6 122 aa3.99□□□□□ -1.77
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 CMTM1Q8IZ96 169 aa3.99□□□□□ -1.77
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 SPAG16Q8N0X2 631 aa3.99□□□□□ -1.77
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 OR5T1Q8NG75 326 aa3.99□□□□□ -1.77
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 OR6F1Q8NGZ6 308 aa3.99□□□□□ -1.77
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 OR4A5Q8NH83 315 aa3.99□□□□□ -1.77
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa3.99□□□□□ -1.77
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 SNAPC3Q92966 411 aa3.99□□□□□ -1.77
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 USMG5Q96IX5 58 aa3.99□□□□□ -1.77
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 MS4A10Q96PG2 267 aa3.99□□□□□ -1.77
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 OR2A7Q96R45 310 aa3.99□□□□□ -1.77
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 ELOVL1Q9BW60 279 aa3.99□□□□□ -1.77
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 CCL28Q9NRJ3 127 aa3.99□□□□□ -1.77
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 COA4Q9NYJ1 87 aa3.99□□□□□ -1.77
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 EHFQ9NZC4 300 aa3.99□□□□□ -1.77
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 ANAPC10Q9UM13 185 aa3.99□□□□□ -1.77
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 PLXNB1O43157 2135 aa3.98□□□□□ -1.77
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa3.98□□□□□ -1.77
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 A0A087WW49 117 aa3.98□□□□□ -1.77
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 MEIS3P1A6NDR6 274 aa3.98□□□□□ -1.77
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 MSGN1A6NI15 193 aa3.98□□□□□ -1.77
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 FAM25AB3EWG3 89 aa3.98□□□□□ -1.77
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 FAM25CB3EWG5 89 aa3.98□□□□□ -1.77
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 FAM25GB3EWG6 89 aa3.98□□□□□ -1.77
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 K7EIL1 84 aa3.98□□□□□ -1.77
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 CYB5BO43169 146 aa3.98□□□□□ -1.77
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 TNFSF12O43508 249 aa3.98□□□□□ -1.77
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 SAP30O75446 220 aa3.98□□□□□ -1.77
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 KBTBD11O94819 623 aa3.98□□□□□ -1.77
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 HPRT1P00492 218 aa3.98□□□□□ -1.77
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 IGHV3-11P01762 117 aa3.98□□□□□ -1.77
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 EIF4EP06730 217 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 FCER2P06734 321 aa3.98□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.7 ms