RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513325.5

HERC3-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-211ENST00000513325 TAS2R8Q9NYW2 309 aa12.78□□□□□ -0.36
HERC3-211ENST00000513325 DAPK2Q9UIK4 370 aa12.78□□□□□ -0.36
HERC3-211ENST00000513325 ANXA10Q9UJ72 324 aa12.78□□□□□ -0.36
HERC3-211ENST00000513325 DPPA5A6NC42 116 aa12.77□□□□□ -0.37
HERC3-211ENST00000513325 KBTBD11O94819 623 aa12.77□□□□□ -0.37
HERC3-211ENST00000513325 FOLR2P14207 255 aa12.77□□□□□ -0.37
HERC3-211ENST00000513325 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP12.77□□□□□ -0.37
HERC3-211ENST00000513325 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP12.77□□□□□ -0.37
HERC3-211ENST00000513325 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP12.77□□□□□ -0.37
HERC3-211ENST00000513325 GUCA2BQ16661 112 aa12.77□□□□□ -0.37
HERC3-211ENST00000513325 FAM209BQ5JX69 171 aa12.77□□□□□ -0.37
HERC3-211ENST00000513325 UBE2UQ5VVX9 321 aa12.77□□□□□ -0.37
HERC3-211ENST00000513325 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP12.77□□□□□ -0.37
HERC3-211ENST00000513325 DEFB125Q8N687 156 aa12.77□□□□□ -0.37
HERC3-211ENST00000513325 VSTM2AQ8TAG5 236 aa12.77□□□□□ -0.37
HERC3-211ENST00000513325 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa12.77□□□□□ -0.37
HERC3-211ENST00000513325 FAM110AQ9BQ89 295 aa12.77□□□□□ -0.37
HERC3-211ENST00000513325 FBXL7Q9UJT9 491 aa12.77□□□□□ -0.37
HERC3-211ENST00000513325 A0A1B0GW64 132 aa12.76□□□□□ -0.37
HERC3-211ENST00000513325 C2orf70A6NJV1 201 aa12.76□□□□□ -0.37
HERC3-211ENST00000513325 NPIPB5A8MRT5 1133 aa12.76□□□□□ -0.37
HERC3-211ENST00000513325 GGCTO75223 188 aaKnown RBP12.76□□□□□ -0.37
HERC3-211ENST00000513325 SCGNO76038 276 aa12.76□□□□□ -0.37
HERC3-211ENST00000513325 IGHV3-23P01764 117 aa12.76□□□□□ -0.37
HERC3-211ENST00000513325 PSMB9P28065 219 aa12.76□□□□□ -0.37
HERC3-211ENST00000513325 KIR2DS2P43631 304 aa12.76□□□□□ -0.37
HERC3-211ENST00000513325 GABARAPL2P60520 117 aa12.76□□□□□ -0.37
HERC3-211ENST00000513325 MFSD4AQ8N468 514 aa12.76□□□□□ -0.37
HERC3-211ENST00000513325 LGALS14Q8TCE9 139 aa12.76□□□□□ -0.37
HERC3-211ENST00000513325 GPHA2Q96T91 129 aa12.76□□□□□ -0.37
HERC3-211ENST00000513325 WFDC10AQ9H1F0 79 aa12.76□□□□□ -0.37
HERC3-211ENST00000513325 SLC2A9Q9NRM0 540 aa12.76□□□□□ -0.37
HERC3-211ENST00000513325 RAB26Q9ULW5 256 aa12.76□□□□□ -0.37
HERC3-211ENST00000513325 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP12.76□□□□□ -0.37
HERC3-211ENST00000513325 S4R3C0 116 aa12.76□□□□□ -0.37
HERC3-211ENST00000513325 STARD9Q9P2P6 4700 aa12.75□□□□□ -0.37
HERC3-211ENST00000513325 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP12.75□□□□□ -0.37
HERC3-211ENST00000513325 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP12.75□□□□□ -0.37
HERC3-211ENST00000513325 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP12.75□□□□□ -0.37
HERC3-211ENST00000513325 NDUFB8O95169 186 aa12.75□□□□□ -0.37
HERC3-211ENST00000513325 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP12.75□□□□□ -0.37
HERC3-211ENST00000513325 ZNF735P0CB33 412 aa12.75□□□□□ -0.37
HERC3-211ENST00000513325 AREGP15514 252 aa12.75□□□□□ -0.37
HERC3-211ENST00000513325 MAS1LP35410 378 aa12.75□□□□□ -0.37
HERC3-211ENST00000513325 CLEC19AQ6UXS0 136 aa12.75□□□□□ -0.37
HERC3-211ENST00000513325 ZNF66Q6ZN08 573 aa12.75□□□□□ -0.37
HERC3-211ENST00000513325 SSX9Q7RTT3 188 aa12.75□□□□□ -0.37
HERC3-211ENST00000513325 TPRA1Q86W33 373 aa12.75□□□□□ -0.37
HERC3-211ENST00000513325 SPARTQ8N0X7 666 aa12.75□□□□□ -0.37
HERC3-211ENST00000513325 CCDC140Q96MF4 163 aa12.75□□□□□ -0.37
HERC3-211ENST00000513325 FANCD2OSQ96PS1 177 aa12.75□□□□□ -0.37
HERC3-211ENST00000513325 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa12.75□□□□□ -0.37
HERC3-211ENST00000513325 SELENOKQ9Y6D0 94 aa12.75□□□□□ -0.37
HERC3-211ENST00000513325 OR11H12B2RN74 326 aa12.74□□□□□ -0.37
HERC3-211ENST00000513325 LGALS9O00182 355 aa12.74□□□□□ -0.37
HERC3-211ENST00000513325 CRYGCP07315 174 aa12.74□□□□□ -0.37
HERC3-211ENST00000513325 MYOD1P15172 320 aa12.74□□□□□ -0.37
HERC3-211ENST00000513325 SFXN4Q6P4A7 337 aa12.74□□□□□ -0.37
HERC3-211ENST00000513325 GPHB5Q86YW7 130 aa12.74□□□□□ -0.37
HERC3-211ENST00000513325 CACNG8Q8WXS5 425 aa12.74□□□□□ -0.37
HERC3-211ENST00000513325 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP12.74□□□□□ -0.37
HERC3-211ENST00000513325 SRD5A3Q9H8P0 318 aa12.74□□□□□ -0.37
HERC3-211ENST00000513325 CCL28Q9NRJ3 127 aa12.74□□□□□ -0.37
HERC3-211ENST00000513325 RHBDL2Q9NX52 303 aa12.74□□□□□ -0.37
HERC3-211ENST00000513325 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP12.74□□□□□ -0.37
HERC3-211ENST00000513325 TNFSF12O43508 249 aa12.73□□□□□ -0.37
HERC3-211ENST00000513325 HRASP01112 189 aa12.73□□□□□ -0.37
HERC3-211ENST00000513325 PTHLHP12272 177 aa12.73□□□□□ -0.37
HERC3-211ENST00000513325 CBLN1P23435 193 aa12.73□□□□□ -0.37
HERC3-211ENST00000513325 PSMB6P28072 239 aa12.73□□□□□ -0.37
HERC3-211ENST00000513325 ARL3P36405 182 aa12.73□□□□□ -0.37
HERC3-211ENST00000513325 RPL8P62917 257 aaKnown RBP12.73□□□□□ -0.37
HERC3-211ENST00000513325 SECTM1Q8WVN6 248 aa12.73□□□□□ -0.37
HERC3-211ENST00000513325 SSR3Q9UNL2 185 aa12.73□□□□□ -0.37
HERC3-211ENST00000513325 CSMD3Q7Z407 3707 aa12.73□□□□□ -0.37
HERC3-211ENST00000513325 TRAV18A0A075B6X5 111 aa12.72□□□□□ -0.37
HERC3-211ENST00000513325 ZNF320A2RRD8 509 aa12.72□□□□□ -0.37
HERC3-211ENST00000513325 DHFRP00374 187 aa12.72□□□□□ -0.37
HERC3-211ENST00000513325 REG1AP05451 166 aa12.72□□□□□ -0.37
HERC3-211ENST00000513325 CTRB1P17538 263 aa12.72□□□□□ -0.37
HERC3-211ENST00000513325 FCGR2CP31995 323 aa12.72□□□□□ -0.37
HERC3-211ENST00000513325 SDC2P34741 201 aa12.72□□□□□ -0.37
HERC3-211ENST00000513325 ARPC4P59998 168 aa12.72□□□□□ -0.37
HERC3-211ENST00000513325 MXD1Q05195 221 aa12.72□□□□□ -0.37
HERC3-211ENST00000513325 CTRB2Q6GPI1 263 aa12.72□□□□□ -0.37
HERC3-211ENST00000513325 OR4A47Q6IF82 309 aa12.72□□□□□ -0.37
HERC3-211ENST00000513325 GVQW1Q8N7I0 195 aa12.72□□□□□ -0.37
HERC3-211ENST00000513325 BEST4Q8NFU0 473 aa12.72□□□□□ -0.37
HERC3-211ENST00000513325 OR13F1Q8NGS4 319 aa12.72□□□□□ -0.37
HERC3-211ENST00000513325 OR5H6Q8NGV6 325 aa12.72□□□□□ -0.37
HERC3-211ENST00000513325 IL17DQ8TAD2 202 aa12.72□□□□□ -0.37
HERC3-211ENST00000513325 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa12.72□□□□□ -0.37
HERC3-211ENST00000513325 DNAH1Q9P2D7 4330 aa12.71□□□□□ -0.37
HERC3-211ENST00000513325 TMEM213A2RRL7 107 aa12.71□□□□□ -0.37
HERC3-211ENST00000513325 CGB1A6NKQ9 187 aa12.71□□□□□ -0.37
HERC3-211ENST00000513325 CLEC2LP0C7M8 214 aa12.71□□□□□ -0.37
HERC3-211ENST00000513325 DEFA4P12838 97 aa12.71□□□□□ -0.37
HERC3-211ENST00000513325 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP12.71□□□□□ -0.37
HERC3-211ENST00000513325 HLA-GP17693 338 aa12.71□□□□□ -0.37
HERC3-211ENST00000513325 KLK9Q2XQG4 91 aa12.71□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.1 ms