RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511747.5

SH3BP2-221, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 2,351 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-221ENST00000511747 CCL11P51671 97 aa22.41■■□□□ 1.18
SH3BP2-221ENST00000511747 YPEL2Q96QA6 119 aa22.41■■□□□ 1.18
SH3BP2-221ENST00000511747 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa22.4■■□□□ 1.18
SH3BP2-221ENST00000511747 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
SH3BP2-221ENST00000511747 F6UZH7 168 aa22.4■■□□□ 1.18
SH3BP2-221ENST00000511747 RELBQ01201 579 aa22.4■■□□□ 1.18
SH3BP2-221ENST00000511747 MIC13Q5XKP0 118 aa22.4■■□□□ 1.18
SH3BP2-221ENST00000511747 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
SH3BP2-221ENST00000511747 PXMP4Q9Y6I8 212 aa22.4■■□□□ 1.18
SH3BP2-221ENST00000511747 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa22.4■■□□□ 1.18
SH3BP2-221ENST00000511747 MKRN2OSH3BPM6 223 aa22.4■■□□□ 1.18
SH3BP2-221ENST00000511747 STAG3L2P0CL84 134 aa22.4■■□□□ 1.18
SH3BP2-221ENST00000511747 STAG3L3P0CL85 134 aa22.4■■□□□ 1.18
SH3BP2-221ENST00000511747 CNN1P51911 297 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
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SH3BP2-221ENST00000511747 ERVK-16P61578 105 aa22.4■■□□□ 1.18
SH3BP2-221ENST00000511747 FOXL1Q12952 345 aa22.4■■□□□ 1.18
SH3BP2-221ENST00000511747 TMEM144Q7Z5S9 345 aa22.4■■□□□ 1.18
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SH3BP2-221ENST00000511747 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP22.39■■□□□ 1.182e-7■■■■■ 31.2
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SH3BP2-221ENST00000511747 TMEM204Q9BSN7 226 aa22.39■■□□□ 1.18
SH3BP2-221ENST00000511747 GGTLC1Q9BX51 225 aa22.39■■□□□ 1.18
SH3BP2-221ENST00000511747 A0A1B0GWJ7 208 aa22.39■■□□□ 1.17
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SH3BP2-221ENST00000511747 ZNRF1Q8ND25 227 aa22.39■■□□□ 1.17
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SH3BP2-221ENST00000511747 CR1LQ2VPA4 569 aa22.38■■□□□ 1.17
SH3BP2-221ENST00000511747 SGMS2Q8NHU3 365 aa22.38■■□□□ 1.17
SH3BP2-221ENST00000511747 IFI27L2Q9H2X8 130 aa22.38■■□□□ 1.17
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SH3BP2-221ENST00000511747 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa22.38■■□□□ 1.17
SH3BP2-221ENST00000511747 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa22.37■■□□□ 1.17
SH3BP2-221ENST00000511747 CXorf1O96002 111 aa22.37■■□□□ 1.17
SH3BP2-221ENST00000511747 LOXL4Q96JB6 756 aa22.37■■□□□ 1.17
SH3BP2-221ENST00000511747 A0A1B0GV90 55 aa22.36■■□□□ 1.17
SH3BP2-221ENST00000511747 AQP7O14520 342 aa22.36■■□□□ 1.17
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SH3BP2-221ENST00000511747 GCSAMQ8N6F7 178 aa22.36■■□□□ 1.17
SH3BP2-221ENST00000511747 SSMEM1Q8WWF3 244 aa22.36■■□□□ 1.17
SH3BP2-221ENST00000511747 C1orf159Q96HA4 380 aa22.36■■□□□ 1.17
SH3BP2-221ENST00000511747 BTF3L4Q96K17 158 aa22.36■■□□□ 1.17
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SH3BP2-221ENST00000511747 TCF19Q9Y242 345 aa22.35■■□□□ 1.17
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SH3BP2-221ENST00000511747 MSMPQ1L6U9 139 aa22.35■■□□□ 1.17
SH3BP2-221ENST00000511747 UTF1Q5T230 341 aa22.35■■□□□ 1.17
SH3BP2-221ENST00000511747 GBGT1Q8N5D6 347 aa22.35■■□□□ 1.17
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SH3BP2-221ENST00000511747 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
SH3BP2-221ENST00000511747 CADP27708 2225 aa22.35■■□□□ 1.17
SH3BP2-221ENST00000511747 TTC28Q96AY4 2481 aa22.34■■□□□ 1.17
SH3BP2-221ENST00000511747 SCO2A0A1W2PP80 73 aa22.34■■□□□ 1.17
SH3BP2-221ENST00000511747 SLC31A2O15432 143 aa22.34■■□□□ 1.17
SH3BP2-221ENST00000511747 OCC1Q8TAD7 63 aa22.34■■□□□ 1.17
SH3BP2-221ENST00000511747 SARAFQ96BY9 339 aa22.34■■□□□ 1.17
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SH3BP2-221ENST00000511747 ELOVL5Q9NYP7 299 aa22.34■■□□□ 1.17
SH3BP2-221ENST00000511747 CCKARP32238 428 aa22.33■■□□□ 1.17
SH3BP2-221ENST00000511747 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
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SH3BP2-221ENST00000511747 DDB2Q92466 427 aa22.33■■□□□ 1.17
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SH3BP2-221ENST00000511747 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa22.33■■□□□ 1.16
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SH3BP2-221ENST00000511747 SVILO95425 2214 aa22.32■■□□□ 1.16
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SH3BP2-221ENST00000511747 WFIKKN1Q96NZ8 548 aa22.32■■□□□ 1.16
SH3BP2-221ENST00000511747 HNF1AP20823 631 aa22.32■■□□□ 1.16
SH3BP2-221ENST00000511747 STARD4Q96DR4 205 aa22.32■■□□□ 1.16
SH3BP2-221ENST00000511747 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa22.31■■□□□ 1.16
SH3BP2-221ENST00000511747 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
SH3BP2-221ENST00000511747 EFNB3Q15768 340 aa22.31■■□□□ 1.16
SH3BP2-221ENST00000511747 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
SH3BP2-221ENST00000511747 OR4S2Q8NH73 311 aa22.31■■□□□ 1.16
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