RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495571.5

VWA3B-220, Transcript of von Willebrand factor A domain containing 3B, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene VWA3B, Length 2,711 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3B-220ENST00000495571 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 GNB1LQ9BYB4 327 aa7.16□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 KLK10O43240 276 aa7.15□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 CD5LO43866 347 aa7.15□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 MT-CO2P00403 227 aa7.15□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 LINC00205P59089 165 aa7.15□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 CKS1BP61024 79 aa7.15□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 RPL31P62899 125 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 HBG1P69891 147 aa7.15□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 HBG2P69892 147 aa7.15□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 KIR2DS3Q14952 304 aa7.15□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 RPEL1Q2QD12 228 aa7.15□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 ZNF585BQ52M93 769 aa7.15□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 OR10J3Q5JRS4 329 aa7.15□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 FAM120AOSQ5T036 256 aa7.15□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa7.15□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 SLC35E4Q6ICL7 350 aa7.15□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 C2orf91Q6ZV80 131 aa7.15□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 FGF14Q92915 247 aa7.15□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 OR1A1Q9P1Q5 309 aa7.15□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 URB1O60287 2271 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 CD300LBA8K4G0 201 aa7.15□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 C2CD4DB7Z1M9 353 aa7.15□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 RHOBP62745 196 aa7.15□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 LINC00696Q6ZRV3 163 aa7.15□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 SPACA3Q8IXA5 215 aa7.15□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 TMEM116Q8NCL8 245 aa7.15□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 SLC25A40Q8TBP6 338 aa7.15□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 PLPPR2Q96GM1 343 aa7.15□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 C18orf15Q96N68 181 aa7.15□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa7.15□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 OR2D2Q9H210 308 aa7.15□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 PMS2P5A8MQ11 134 aa7.14□□□□□ -1.27
VWA3B-220ENST00000495571 H0Y980 276 aa7.14□□□□□ -1.27
VWA3B-220ENST00000495571 SRFP11831 508 aa7.14□□□□□ -1.27
VWA3B-220ENST00000495571 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
VWA3B-220ENST00000495571 C1orf61Q13536 156 aa7.14□□□□□ -1.27
VWA3B-220ENST00000495571 PCSK4Q6UW60 755 aa7.14□□□□□ -1.27
VWA3B-220ENST00000495571 PARM1Q6UWI2 310 aa7.14□□□□□ -1.27
VWA3B-220ENST00000495571 C19orf35Q6ZS72 473 aa7.14□□□□□ -1.27
VWA3B-220ENST00000495571 FAM222BQ8WU58 562 aa7.14□□□□□ -1.27
VWA3B-220ENST00000495571 MOB1AQ9H8S9 216 aa7.14□□□□□ -1.27
VWA3B-220ENST00000495571 TNFRSF19Q9NS68 423 aa7.14□□□□□ -1.27
VWA3B-220ENST00000495571 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
VWA3B-220ENST00000495571 ZFHX4Q86UP3 3567 aa7.14□□□□□ -1.27
VWA3B-220ENST00000495571 DEGS1O15121 323 aa7.14□□□□□ -1.27
VWA3B-220ENST00000495571 PDE6DO43924 150 aa7.14□□□□□ -1.27
VWA3B-220ENST00000495571 ZG16O60844 167 aa7.14□□□□□ -1.27
VWA3B-220ENST00000495571 HSBP1O75506 76 aa7.14□□□□□ -1.27
VWA3B-220ENST00000495571 CGAP01215 116 aa7.14□□□□□ -1.27
VWA3B-220ENST00000495571 LINC00869P0C866 280 aa7.14□□□□□ -1.27
VWA3B-220ENST00000495571 SLC25A6P12236 298 aa7.14□□□□□ -1.27
VWA3B-220ENST00000495571 MALLQ13021 153 aa7.14□□□□□ -1.27
VWA3B-220ENST00000495571 RUNX3Q13761 415 aa7.14□□□□□ -1.27
VWA3B-220ENST00000495571 SLC25A34Q6PIV7 304 aa7.14□□□□□ -1.27
VWA3B-220ENST00000495571 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa7.14□□□□□ -1.27
VWA3B-220ENST00000495571 WDR5BQ86VZ2 330 aa7.14□□□□□ -1.27
VWA3B-220ENST00000495571 YAF2Q8IY57 180 aa7.14□□□□□ -1.27
VWA3B-220ENST00000495571 COMMD5Q9GZQ3 224 aa7.14□□□□□ -1.27
VWA3B-220ENST00000495571 LRP5LA4QPB2 252 aa7.14□□□□□ -1.27
VWA3B-220ENST00000495571 K7EMI3 77 aa7.14□□□□□ -1.27
VWA3B-220ENST00000495571 COX5AP20674 150 aa7.14□□□□□ -1.27
VWA3B-220ENST00000495571 DRD1P21728 446 aa7.14□□□□□ -1.27
VWA3B-220ENST00000495571 ZNF138P52744 262 aa7.14□□□□□ -1.27
VWA3B-220ENST00000495571 PLP1P60201 277 aa7.14□□□□□ -1.27
VWA3B-220ENST00000495571 CX3CL1P78423 397 aa7.14□□□□□ -1.27
VWA3B-220ENST00000495571 ATP5G2Q06055 141 aa7.14□□□□□ -1.27
VWA3B-220ENST00000495571 IL1F10Q8WWZ1 152 aa7.14□□□□□ -1.27
VWA3B-220ENST00000495571 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
VWA3B-220ENST00000495571 SCRT2Q9NQ03 307 aa7.14□□□□□ -1.27
VWA3B-220ENST00000495571 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa7.14□□□□□ -1.27
VWA3B-220ENST00000495571 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa7.13□□□□□ -1.27
VWA3B-220ENST00000495571 A0A1B0GV72 72 aa7.13□□□□□ -1.27
VWA3B-220ENST00000495571 TUSC2O75896 110 aa7.13□□□□□ -1.27
VWA3B-220ENST00000495571 COL9A1P20849 921 aa7.13□□□□□ -1.27
VWA3B-220ENST00000495571 PLCXD2Q0VAA5 305 aa7.13□□□□□ -1.27
VWA3B-220ENST00000495571 TMEM177Q53S58 311 aa7.13□□□□□ -1.27
VWA3B-220ENST00000495571 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa7.13□□□□□ -1.27
VWA3B-220ENST00000495571 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa7.13□□□□□ -1.27
VWA3B-220ENST00000495571 MTURNQ8N3F0 131 aa7.13□□□□□ -1.27
VWA3B-220ENST00000495571 TMEM45BQ96B21 275 aa7.13□□□□□ -1.27
VWA3B-220ENST00000495571 POM121L2Q96KW2 1035 aa7.13□□□□□ -1.27
VWA3B-220ENST00000495571 SIGMAR1Q99720 223 aa7.13□□□□□ -1.27
VWA3B-220ENST00000495571 KCNIP2Q9NS61 270 aa7.13□□□□□ -1.27
VWA3B-220ENST00000495571 SS18L2Q9UHA2 77 aa7.13□□□□□ -1.27
VWA3B-220ENST00000495571 OR51B2Q9Y5P1 312 aa7.13□□□□□ -1.27
VWA3B-220ENST00000495571 KNTC1P50748 2209 aa7.13□□□□□ -1.27
VWA3B-220ENST00000495571 LIPT2A6NK58 231 aa7.13□□□□□ -1.27
VWA3B-220ENST00000495571 APCSP02743 223 aa7.13□□□□□ -1.27
VWA3B-220ENST00000495571 IGFBP2P18065 325 aa7.13□□□□□ -1.27
VWA3B-220ENST00000495571 RBM11P57052 281 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
VWA3B-220ENST00000495571 PQLC2Q6ZP29 291 aa7.13□□□□□ -1.27
VWA3B-220ENST00000495571 Q6ZR03 302 aa7.13□□□□□ -1.27
VWA3B-220ENST00000495571 SPEM1Q8N4L4 309 aa7.13□□□□□ -1.27
VWA3B-220ENST00000495571 DEFB119Q8N690 84 aa7.13□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 68 ms