RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495350.5

CBX1-205, Transcript of chromobox 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CBX1, Length 550 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1-205ENST00000495350 HSMCR30P0CW71 290 aa4.51□□□□□ -1.69
CBX1-205ENST00000495350 DEFA4P12838 97 aa4.51□□□□□ -1.69
CBX1-205ENST00000495350 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
CBX1-205ENST00000495350 CELP19835 753 aa4.51□□□□□ -1.69
CBX1-205ENST00000495350 ELLP55199 621 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
CBX1-205ENST00000495350 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
CBX1-205ENST00000495350 UBE2KP61086 200 aa4.51□□□□□ -1.69
CBX1-205ENST00000495350 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP4.51□□□□□ -1.69
CBX1-205ENST00000495350 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
CBX1-205ENST00000495350 TMEM187Q14656 261 aa4.51□□□□□ -1.69
CBX1-205ENST00000495350 Q499Y3 187 aa4.51□□□□□ -1.69
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CBX1-205ENST00000495350 ZNF773Q6PK81 442 aa4.51□□□□□ -1.69
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CBX1-205ENST00000495350 ZNF367Q7RTV3 350 aa4.51□□□□□ -1.69
CBX1-205ENST00000495350 C6orf201Q7Z4U5 140 aa4.51□□□□□ -1.69
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CBX1-205ENST00000495350 ZNF645Q8N7E2 425 aa4.51□□□□□ -1.69
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CBX1-205ENST00000495350 PTX4Q96A99 478 aa4.51□□□□□ -1.69
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CBX1-205ENST00000495350 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa4.51□□□□□ -1.69
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CBX1-205ENST00000495350 NDUFAF3Q9BU61 184 aa4.51□□□□□ -1.69
CBX1-205ENST00000495350 TMEM59Q9BXS4 323 aa4.51□□□□□ -1.69
CBX1-205ENST00000495350 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa4.51□□□□□ -1.69
CBX1-205ENST00000495350 RDH8Q9NYR8 311 aa4.51□□□□□ -1.69
CBX1-205ENST00000495350 GHRLQ9UBU3 117 aa4.51□□□□□ -1.69
CBX1-205ENST00000495350 S4R3C0 116 aa4.51□□□□□ -1.69
CBX1-205ENST00000495350 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa4.5□□□□□ -1.69
CBX1-205ENST00000495350 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa4.5□□□□□ -1.69
CBX1-205ENST00000495350 A0A087WXM4 84 aa4.5□□□□□ -1.69
CBX1-205ENST00000495350 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa4.5□□□□□ -1.69
CBX1-205ENST00000495350 HMX3A6NHT5 357 aa4.5□□□□□ -1.69
CBX1-205ENST00000495350 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
CBX1-205ENST00000495350 NPIPB5A8MRT5 1133 aa4.5□□□□□ -1.69
CBX1-205ENST00000495350 PROP1O75360 226 aa4.5□□□□□ -1.69
CBX1-205ENST00000495350 S1PR2O95136 353 aa4.5□□□□□ -1.69
CBX1-205ENST00000495350 NAPSAO96009 420 aa4.5□□□□□ -1.69
CBX1-205ENST00000495350 AMBPP02760 352 aa4.5□□□□□ -1.69
CBX1-205ENST00000495350 CLEC3BP05452 202 aa4.5□□□□□ -1.69
CBX1-205ENST00000495350 UBBP0CG47 229 aa4.5□□□□□ -1.69
CBX1-205ENST00000495350 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
CBX1-205ENST00000495350 C8orf88P0DMB2 117 aa4.5□□□□□ -1.69
CBX1-205ENST00000495350 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
CBX1-205ENST00000495350 HLA-DMBP28068 263 aa4.5□□□□□ -1.69
CBX1-205ENST00000495350 GPR183P32249 361 aa4.5□□□□□ -1.69
CBX1-205ENST00000495350 SERPINB10P48595 397 aa4.5□□□□□ -1.69
CBX1-205ENST00000495350 CDK10Q15131 360 aa4.5□□□□□ -1.69
CBX1-205ENST00000495350 TRAM1Q15629 374 aa4.5□□□□□ -1.69
CBX1-205ENST00000495350 ACSM3Q53FZ2 586 aa4.5□□□□□ -1.69
CBX1-205ENST00000495350 C10orf55Q5SWW7 151 aa4.5□□□□□ -1.69
CBX1-205ENST00000495350 C1orf134Q5TEV5 83 aa4.5□□□□□ -1.69
CBX1-205ENST00000495350 UBE2UQ5VVX9 321 aa4.5□□□□□ -1.69
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CBX1-205ENST00000495350 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa4.5□□□□□ -1.69
CBX1-205ENST00000495350 Q6ZTC4 211 aa4.5□□□□□ -1.69
CBX1-205ENST00000495350 APRG1Q8IVJ8 170 aa4.5□□□□□ -1.69
CBX1-205ENST00000495350 CDH26Q8IXH8 852 aa4.5□□□□□ -1.69
CBX1-205ENST00000495350 Q8N1X5 172 aa4.5□□□□□ -1.69
CBX1-205ENST00000495350 MS4A15Q8N5U1 240 aa4.5□□□□□ -1.69
CBX1-205ENST00000495350 TSPAN14Q8NG11 270 aa4.5□□□□□ -1.69
CBX1-205ENST00000495350 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
CBX1-205ENST00000495350 FCGR1BQ92637 280 aa4.5□□□□□ -1.69
CBX1-205ENST00000495350 ADTRPQ96IZ2 230 aa4.5□□□□□ -1.69
CBX1-205ENST00000495350 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
CBX1-205ENST00000495350 UQCC2Q9BRT2 126 aa4.5□□□□□ -1.69
CBX1-205ENST00000495350 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
CBX1-205ENST00000495350 SCRT2Q9NQ03 307 aa4.5□□□□□ -1.69
CBX1-205ENST00000495350 C12orf4Q9NQ89 552 aa4.5□□□□□ -1.69
CBX1-205ENST00000495350 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
CBX1-205ENST00000495350 DMRT1Q9Y5R6 373 aa4.5□□□□□ -1.69
CBX1-205ENST00000495350 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa4.49□□□□□ -1.69
CBX1-205ENST00000495350 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa4.49□□□□□ -1.69
CBX1-205ENST00000495350 A0A1W2PPK0 400 aa4.49□□□□□ -1.69
CBX1-205ENST00000495350 CYB5BO43169 146 aa4.49□□□□□ -1.69
CBX1-205ENST00000495350 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
CBX1-205ENST00000495350 SRMP19623 302 aa4.49□□□□□ -1.69
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CBX1-205ENST00000495350 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
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CBX1-205ENST00000495350 PSMB6P28072 239 aa4.49□□□□□ -1.69
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CBX1-205ENST00000495350 TFPI2P48307 235 aa4.49□□□□□ -1.69
CBX1-205ENST00000495350 PSMD7P51665 324 aa4.49□□□□□ -1.69
CBX1-205ENST00000495350 RPS25P62851 125 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
CBX1-205ENST00000495350 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
CBX1-205ENST00000495350 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
CBX1-205ENST00000495350 INSL4Q14641 139 aa4.49□□□□□ -1.69
CBX1-205ENST00000495350 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
CBX1-205ENST00000495350 SSX1Q16384 188 aa4.49□□□□□ -1.69
CBX1-205ENST00000495350 CEACAM19Q7Z692 300 aa4.49□□□□□ -1.69
CBX1-205ENST00000495350 VSTM2AQ8TAG5 236 aa4.49□□□□□ -1.69
CBX1-205ENST00000495350 TMEM190Q8WZ59 177 aa4.49□□□□□ -1.69
CBX1-205ENST00000495350 TMEM203Q969S6 136 aa4.49□□□□□ -1.69
CBX1-205ENST00000495350 CYYR1Q96J86 154 aa4.49□□□□□ -1.69
CBX1-205ENST00000495350 CMTM3Q96MX0 182 aa4.49□□□□□ -1.69
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