RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491445.1

NCBP1-204, Transcript of nuclear cap binding protein subunit 1, human

TSL 3

Gene NCBP1, Length 300 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NCBP1-204	ENST00000491445	IL1F10	Q8WWZ1	152 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NCBP1-204	ENST00000491445	ACOT12	Q8WYK0	555 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NCBP1-204	ENST00000491445	C8orf49	Q96NF6	230 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NCBP1-204	ENST00000491445	OR2A7	Q96R45	310 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NCBP1-204	ENST00000491445	RIBC2	Q9H4K1	309 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NCBP1-204	ENST00000491445	ZNF430	Q9H8G1	570 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
NCBP1-204	ENST00000491445	FGFR1OP2	Q9NVK5	253 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NCBP1-204	ENST00000491445	TAS2R4	Q9NYW5	299 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NCBP1-204	ENST00000491445	SMPX	Q9UHP9	88 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NCBP1-204	ENST00000491445	TMED3	Q9Y3Q3	217 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NCBP1-204	ENST00000491445		V9GYY5	206 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
NCBP1-204	ENST00000491445	TRBV5-7	A0A0A0MS05	114 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NCBP1-204	ENST00000491445	UBE2QL1	A1L167	161 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NCBP1-204	ENST00000491445	TMEM189	A5PLL7	270 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NCBP1-204	ENST00000491445	MFSD2B	A6NFX1	497 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NCBP1-204	ENST00000491445	HMGB1P1	B2RPK0	211 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
NCBP1-204	ENST00000491445		M0R129	80 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NCBP1-204	ENST00000491445		M0R1X1	148 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NCBP1-204	ENST00000491445	ACTL6B	O94805	426 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NCBP1-204	ENST00000491445	CD2	P06729	351 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NCBP1-204	ENST00000491445	ZNF735	P0CB33	412 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NCBP1-204	ENST00000491445	SPART-AS1	P0CW21	52 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NCBP1-204	ENST00000491445	C4BPB	P20851	252 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NCBP1-204	ENST00000491445	PRKACG	P22612	351 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NCBP1-204	ENST00000491445	PTBP1	P26599	531 aa	Known RBP eCLIP	4.89	□□□□□ -1.63
NCBP1-204	ENST00000491445	BDKRB2	P30411	391 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NCBP1-204	ENST00000491445	ATP6V1E1	P36543	226 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NCBP1-204	ENST00000491445	CEACAM6	P40199	344 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NCBP1-204	ENST00000491445	SOX2	P48431	317 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NCBP1-204	ENST00000491445	RTL8B	Q17RB0	113 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NCBP1-204	ENST00000491445	CDH26	Q8IXH8	852 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NCBP1-204	ENST00000491445	HS3ST5	Q8IZT8	346 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NCBP1-204	ENST00000491445	SYS1	Q8N2H4	156 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NCBP1-204	ENST00000491445	OR5AK2	Q8NH90	309 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NCBP1-204	ENST00000491445	RFK	Q969G6	155 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NCBP1-204	ENST00000491445	NRBF2	Q96F24	287 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NCBP1-204	ENST00000491445	MYCBP	Q99417	103 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
NCBP1-204	ENST00000491445	RNF2	Q99496	336 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NCBP1-204	ENST00000491445	NEU1	Q99519	415 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NCBP1-204	ENST00000491445		A0A1W2PPQ1	181 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NCBP1-204	ENST00000491445	HMX3	A6NHT5	357 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NCBP1-204	ENST00000491445	CHEK1	O14757	476 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NCBP1-204	ENST00000491445	IL6R	P08887	468 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
NCBP1-204	ENST00000491445	MGMT	P16455	207 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NCBP1-204	ENST00000491445	IGFBP3	P17936	291 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
NCBP1-204	ENST00000491445	GPR183	P32249	361 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NCBP1-204	ENST00000491445	MAS1L	P35410	378 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NCBP1-204	ENST00000491445	PPP3R1	P63098	170 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NCBP1-204	ENST00000491445	PAFAH1B2	P68402	229 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NCBP1-204	ENST00000491445	ICAM4	Q14773	271 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NCBP1-204	ENST00000491445	TTC32	Q5I0X7	151 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NCBP1-204	ENST00000491445	C10orf55	Q5SWW7	151 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NCBP1-204	ENST00000491445	SPSB3	Q6PJ21	355 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NCBP1-204	ENST00000491445	IDO2	Q6ZQW0	420 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NCBP1-204	ENST00000491445	C19orf35	Q6ZS72	473 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NCBP1-204	ENST00000491445	SSX9	Q7RTT3	188 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NCBP1-204	ENST00000491445	STH	Q8IWL8	128 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NCBP1-204	ENST00000491445	ARHGAP24	Q8N264	748 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NCBP1-204	ENST00000491445	VN1R17P	Q8TDU5	208 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NCBP1-204	ENST00000491445	BSCL2	Q96G97	398 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
NCBP1-204	ENST00000491445	ADTRP	Q96IZ2	230 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NCBP1-204	ENST00000491445	CYYR1	Q96J86	154 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NCBP1-204	ENST00000491445	C4orf36	Q96KX1	117 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NCBP1-204	ENST00000491445	KRTAP9-8	Q9BYQ0	159 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NCBP1-204	ENST00000491445	RIMS4	Q9H426	269 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
NCBP1-204	ENST00000491445	OR1A1	Q9P1Q5	309 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NCBP1-204	ENST00000491445	AASS	Q9UDR5	926 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NCBP1-204	ENST00000491445	MGAT4A	Q9UM21	535 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NCBP1-204	ENST00000491445		S4R3C0	116 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NCBP1-204	ENST00000491445	IGHV7-4-1	A0A0J9YVY3	117 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NCBP1-204	ENST00000491445	DAPL1	A0PJW8	107 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NCBP1-204	ENST00000491445	DPPA5	A6NC42	116 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NCBP1-204	ENST00000491445		B2RBV5	119 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NCBP1-204	ENST00000491445		J3QLW9	94 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NCBP1-204	ENST00000491445	GNGT2	O14610	69 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NCBP1-204	ENST00000491445	BAG2	O95816	211 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NCBP1-204	ENST00000491445	SAA1	P0DJI8	122 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
NCBP1-204	ENST00000491445	ZNF19	P17023	458 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NCBP1-204	ENST00000491445	DAP	P51397	102 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NCBP1-204	ENST00000491445	DEFB131A	P59861	70 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NCBP1-204	ENST00000491445	SSX1	Q16384	188 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NCBP1-204	ENST00000491445	TMEM88	Q6PEY1	159 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NCBP1-204	ENST00000491445	GLIPR1L1	Q6UWM5	242 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NCBP1-204	ENST00000491445	DHFR2	Q86XF0	187 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NCBP1-204	ENST00000491445	ADGRG5	Q8IZF4	528 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NCBP1-204	ENST00000491445	ACBD7	Q8N6N7	88 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NCBP1-204	ENST00000491445	OR8J1	Q8NGP2	316 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NCBP1-204	ENST00000491445	GPR148	Q8TDV2	347 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NCBP1-204	ENST00000491445	DEFB104A	Q8WTQ1	72 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NCBP1-204	ENST00000491445	MRPL48	Q96GC5	212 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
NCBP1-204	ENST00000491445	OR10C1	Q96KK4	312 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NCBP1-204	ENST00000491445	CMTM3	Q96MX0	182 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NCBP1-204	ENST00000491445	ZNF184	Q99676	751 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
NCBP1-204	ENST00000491445	PDCD1LG2	Q9BQ51	273 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NCBP1-204	ENST00000491445	ATG101	Q9BSB4	218 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NCBP1-204	ENST00000491445	THTPA	Q9BU02	230 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NCBP1-204	ENST00000491445	RHPN1-AS1	Q9BWJ2	59 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NCBP1-204	ENST00000491445	SELENOI	Q9C0D9	397 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NCBP1-204	ENST00000491445	SDHAF2	Q9NX18	166 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NCBP1-204	ENST00000491445	IMPAD1	Q9NX62	359 aa		4.87	□□□□□ -1.63

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