RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491266.5

RABGGTB-212, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, human

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 961 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RABGGTB-212	ENST00000491266	DCAF12L2	Q5VW00	463 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	C11orf87	Q6NUJ2	197 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZNF833P	Q6ZTB9	187 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	LYG2	Q86SG7	212 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	FAM219A	Q8IW50	185 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	SLC38A6	Q8IZM9	456 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZNF645	Q8N7E2	425 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	MINDY2	Q8NBR6	621 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	OR11H7	Q8NGC8	314 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	OR9G1	Q8NH87	305 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	PIFO	Q8TCI5	191 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZNF431	Q8TF32	576 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	RTN4IP1	Q8WWV3	396 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	LHX4	Q969G2	390 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	TMEM186	Q96B77	213 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	RNF125	Q96EQ8	232 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	NABP2	Q9BQ15	211 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	METTL8	Q9H825	291 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	PPP1R14D	Q9NXH3	145 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	ABCA1	O95477	2261 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	IGHV3-72	A0A0B4J1Y9	119 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	C3orf85	A0A1B0GTC6	90 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	MDFIC2	A0A1B0GVS7	189 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	TEX22	C9J3V5	150 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266		M0R1X1	148 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	CCS	O14618	274 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	ADAP1	O75689	374 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	TGFA	P01135	160 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	IGKV1-5	P01602	117 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	IGLV2-23	P01705	113 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	CD24	P25063	80 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	F2R	P25116	425 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	UCP1	P25874	307 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	BCAP31	P51572	246 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	HERV-K104	P61576	105 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	IL15RA	Q13261	267 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	MSMO1	Q15800	293 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	TMEM30B	Q3MIR4	351 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	TMEM128	Q5BJH2	165 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	OR2B11	Q5JQS5	317 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	TPTE2P1	Q5T6R2	138 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	BRD3OS	Q6XYD6	125 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	SELENOH	Q8IZQ5	122 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	LYG1	Q8N1E2	194 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	OR2AK2	Q8NG84	335 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	OR51H1	Q8NH63	302 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	CASTOR1	Q8WTX7	329 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	MITD1	Q8WV92	249 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	GALNT14	Q96FL9	552 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZNF486	Q96H40	463 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	AKR1E2	Q96JD6	320 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	ST6GAL2	Q96JF0	529 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	C18orf12	Q96KH6	178 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	NEURL2	Q9BR09	285 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	CLEC7A	Q9BXN2	247 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	OR51J1	Q9H342	316 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	NAA60	Q9H7X0	242 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	COPZ2	Q9P299	210 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	KCNS2	Q9ULS6	477 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	AUP1	Q9Y679	476 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	MTOR	P42345	2549 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	MXRA5	Q9NR99	2828 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	SVEP1	Q4LDE5	3571 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	PRPF8	Q6P2Q9	2335 aa	Known RBP eCLIP	4.89	□□□□□ -1.63	2e-10	■■■■■ 54.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	TRAV3	A0A0B4J244	114 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	TRAV40	A0A0B4J280	105 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	IGHV1-69D	A0A0B4J2H0	117 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	IGHV1-3	A0A0C4DH29	117 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	TEX13D	A0A0J9YY54	714 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266		A0A0U1RQK1	487 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266		A0A1B0GW64	132 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266		H0YJW9	148 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	RHOD	O00212	210 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	S1PR2	O95136	353 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	DUS4L	O95620	317 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	CDS2	O95674	445 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	IGHV1-69	P01742	117 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	IGKV1-16	P04430	117 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	ARG1	P05089	322 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	SULT1A3	P0DMM9	295 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	SULT1A4	P0DMN0	295 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	MYOD1	P15172	320 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	RPA2	P15927	270 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	CNTFR	P26992	372 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	SAA4	P35542	130 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	LPAR6	P43657	344 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	GPR12	P47775	334 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	RAB7A	P51149	207 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	RAB13	P51153	203 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	UBE2E1	P51965	193 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	H2BFS	P57053	126 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	SRSF4	Q08170	494 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	C10orf25	Q5T742	122 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	FAHD2B	Q6P2I3	314 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	IL17REL	Q6ZVW7	336 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	LYZL2	Q7Z4W2	148 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	VKORC1L1	Q8N0U8	176 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZNF436-AS1	Q8NC38	126 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZFAND1	Q8TCF1	268 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	GPR146	Q96CH1	333 aa		4.89	□□□□□ -1.63

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