RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489247.1

ATG4A-208, Transcript of autophagy related 4A cysteine peptidase, human

TSL 2

Gene ATG4A, Length 623 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATG4A-208	ENST00000489247	RPL31	P62899	125 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	PJVK	Q0ZLH3	352 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	ATP6V1F	Q16864	119 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	VWC2	Q2TAL6	325 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	BEAN1	Q3B7T3	259 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	TMEM155	Q4W5P6	130 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	LRRC10	Q5BKY1	277 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	PXDC1	Q5TGL8	231 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF841	Q6ZN19	808 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	HAPLN4	Q86UW8	402 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF429	Q86V71	674 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	STX12	Q86Y82	276 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	DEFB108B	Q8NET1	73 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	OR5C1	Q8NGR4	320 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	OR4S2	Q8NH73	311 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	CA5BP1	Q8WTZ4	195 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	TNFRSF14	Q92956	283 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	R3HDM4	Q96D70	268 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	RAB39B	Q96DA2	213 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	PCGF1	Q9BSM1	259 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	PSMG3	Q9BT73	122 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	SCRT1	Q9BWW7	348 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	ZC4H2	Q9NQZ6	224 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	CBLN4	Q9NTU7	201 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	CTSZ	Q9UBR2	303 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	CARHSP1	Q9Y2V2	147 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	ANKHD1	Q8IWZ3	2542 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	PIEZO2	Q9H5I5	2752 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	SPTBN4	Q9H254	2564 aa		4.51	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	SAA2-SAA4	A0A096LPE2	208 aa		4.51	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	BTBD17	A6NE02	478 aa		4.51	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF705E	A8MWA4	302 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	FAM157A	C9JC47	383 aa		4.51	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	INS-IGF2	F8WCM5	200 aa		4.51	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247		M0R1X1	148 aa		4.51	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	TRIAP1	O43715	76 aa		4.51	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	SOX15	O60248	233 aa		4.51	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	NDUFS6	O75380	124 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	TNFRSF6B	O95407	300 aa		4.51	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	KRAS	P01116	189 aa		4.51	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	CD5	P06127	495 aa		4.51	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	SAA2	P0DJI9	122 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	ATP6V0C	P27449	155 aa		4.51	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	G6PC	P35575	357 aa		4.51	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	VDAC2	P45880	294 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	ATP5I	P56385	69 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	SPCS3	P61009	180 aa		4.51	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	GNB2	P62879	340 aa		4.51	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	HBG1	P69891	147 aa		4.51	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	HBG2	P69892	147 aa		4.51	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF816	Q0VGE8	651 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF273	Q14593	569 aa		4.51	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	IZUMO4	Q1ZYL8	232 aa		4.51	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	HFE	Q30201	348 aa		4.51	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	RPL39P5	Q59GN2	51 aa		4.51	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	UTF1	Q5T230	341 aa		4.51	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	H2BFWT	Q7Z2G1	175 aa		4.51	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	ZCCHC24	Q8N2G6	241 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	C11orf42	Q8N5U0	333 aa		4.51	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF525	Q8N782	197 aa		4.51	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF383	Q8NA42	475 aa		4.51	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	LY6G5B	Q8NDX9	201 aa		4.51	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	LFNG	Q8NES3	379 aa		4.51	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	OR2G3	Q8NGZ4	309 aa		4.51	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	RNASE11	Q8TAA1	199 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	NEU4	Q8WWR8	484 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	ITLN2	Q8WWU7	325 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	CCL17	Q92583	94 aa		4.51	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	ST6GALNAC6	Q969X2	333 aa		4.51	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	LINC00052	Q96N35	136 aa		4.51	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF714	Q96N38	554 aa		4.51	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	S1PR3	Q99500	378 aa		4.51	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	AIFM2	Q9BRQ8	373 aa		4.51	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	GGACT	Q9BVM4	153 aa		4.51	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	MAGT1	Q9H0U3	335 aa		4.51	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	RBKS	Q9H477	322 aa		4.51	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	SMDT1	Q9H4I9	107 aa		4.51	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	C19orf12	Q9NSK7	152 aa		4.51	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	TMEM14B	Q9NUH8	114 aa		4.51	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	PSENEN	Q9NZ42	101 aa		4.51	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	FOXA2	Q9Y261	457 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	TIMM9	Q9Y5J7	89 aa		4.51	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	CHD3	Q12873	2000 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	ESPL1	Q14674	2120 aa		4.51	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	TRGV11	A0A075B6L2	103 aa		4.5	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	MED19	A0JLT2	244 aa	Predicted RBP	4.5	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	TMEM218	A2RU14	115 aa		4.5	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	C15orf61	A6NNL5	157 aa		4.5	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	FNDC10	F2Z333	226 aa		4.5	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	DVL1	O14640	695 aa		4.5	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	FCGR3B	O75015	233 aa		4.5	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	MMP23A	O75900	390 aa		4.5	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	CT45A6	P0DMU7	189 aa		4.5	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	CT45A5	P0DMU8	189 aa		4.5	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	CT45A7	P0DMV0	189 aa		4.5	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	NDUFB7	P17568	137 aa		4.5	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	OMG	P23515	440 aa		4.5	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	PPIF	P30405	207 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	ERVK-16	P61578	105 aa		4.5	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	SERF2	P84101	59 aa		4.5	□□□□□ -1.69

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