RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487547.1

USP34-216, Transcript of ubiquitin specific peptidase 34, humanhuman

TSL 3

Gene USP34, Length 612 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34-216ENST00000487547 KRT75O95678 551 aa0.96□□□□□ -2.26
USP34-216ENST00000487547 DEFA4P12838 97 aa0.96□□□□□ -2.26
USP34-216ENST00000487547 HADHBP55084 474 aaKnown RBP0.96□□□□□ -2.26
USP34-216ENST00000487547 C10orf55Q5SWW7 151 aa0.96□□□□□ -2.26
USP34-216ENST00000487547 C12orf29Q8N999 325 aa0.96□□□□□ -2.26
USP34-216ENST00000487547 C15orf53Q8NAA6 179 aa0.96□□□□□ -2.26
USP34-216ENST00000487547 ASB13Q8WXK3 278 aa0.96□□□□□ -2.26
USP34-216ENST00000487547 TESCQ96BS2 214 aa0.96□□□□□ -2.26
USP34-216ENST00000487547 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP0.96□□□□□ -2.26
USP34-216ENST00000487547 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP0.96□□□□□ -2.26
USP34-216ENST00000487547 TMEM269A0A1B0GVZ9 245 aa0.95□□□□□ -2.26
USP34-216ENST00000487547 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP0.95□□□□□ -2.26
USP34-216ENST00000487547 COX7A2LO14548 114 aa0.95□□□□□ -2.26
USP34-216ENST00000487547 PET100P0DJ07 73 aa0.95□□□□□ -2.26
USP34-216ENST00000487547 RD3LP0DJH9 198 aa0.95□□□□□ -2.26
USP34-216ENST00000487547 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP0.95□□□□□ -2.26
USP34-216ENST00000487547 BOD1L2Q8IYS8 172 aa0.95□□□□□ -2.26
USP34-216ENST00000487547 OR8B3Q8NGG8 313 aa0.95□□□□□ -2.26
USP34-216ENST00000487547 JOSD2Q8TAC2 188 aa0.95□□□□□ -2.26
USP34-216ENST00000487547 DHRS9Q9BPW9 319 aa0.95□□□□□ -2.26
USP34-216ENST00000487547 EURLQ9NYK6 297 aa0.95□□□□□ -2.26
USP34-216ENST00000487547 TECTAO75443 2155 aa0.95□□□□□ -2.26
USP34-216ENST00000487547 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP0.95□□□□□ -2.26
USP34-216ENST00000487547 PCDH15Q96QU1 1955 aa0.95□□□□□ -2.26
USP34-216ENST00000487547 MICAL3Q7RTP6 2002 aa0.94□□□□□ -2.26
USP34-216ENST00000487547 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa0.94□□□□□ -2.26
USP34-216ENST00000487547 ADAP1O75689 374 aa0.94□□□□□ -2.26
USP34-216ENST00000487547 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP0.94□□□□□ -2.26
USP34-216ENST00000487547 FAM27BQ5VT28 67 aa0.94□□□□□ -2.26
USP34-216ENST00000487547 SDHAF4Q5VUM1 108 aa0.94□□□□□ -2.26
USP34-216ENST00000487547 GID4Q8IVV7 300 aa0.94□□□□□ -2.26
USP34-216ENST00000487547 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP0.94□□□□□ -2.26
USP34-216ENST00000487547 UBL4BQ8N7F7 174 aa0.94□□□□□ -2.26
USP34-216ENST00000487547 C9orf163Q8N9P6 203 aa0.94□□□□□ -2.26
USP34-216ENST00000487547 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa0.94□□□□□ -2.26
USP34-216ENST00000487547 ACOT12Q8WYK0 555 aa0.94□□□□□ -2.26
USP34-216ENST00000487547 SPACA1Q9HBV2 294 aa0.94□□□□□ -2.26
USP34-216ENST00000487547 PRELID1Q9Y255 219 aa0.94□□□□□ -2.26
USP34-216ENST00000487547 GLI3P10071 1580 aa0.94□□□□□ -2.26
USP34-216ENST00000487547 CACNA1BQ00975 2339 aa0.94□□□□□ -2.26
USP34-216ENST00000487547 NAV1Q8NEY1 1877 aa0.93□□□□□ -2.26
USP34-216ENST00000487547 SMLR1H3BR10 107 aa0.93□□□□□ -2.26
USP34-216ENST00000487547 CCL5P13501 91 aa0.93□□□□□ -2.26
USP34-216ENST00000487547 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP0.93□□□□□ -2.26
USP34-216ENST00000487547 CDK10Q15131 360 aa0.93□□□□□ -2.26
USP34-216ENST00000487547 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP0.93□□□□□ -2.26
USP34-216ENST00000487547 SYCE1Q8N0S2 351 aa0.93□□□□□ -2.26
USP34-216ENST00000487547 REG4Q9BYZ8 158 aa0.93□□□□□ -2.26
USP34-216ENST00000487547 MS4A6AQ9H2W1 248 aa0.93□□□□□ -2.26
USP34-216ENST00000487547 GMEB1Q9Y692 573 aa0.93□□□□□ -2.26
USP34-216ENST00000487547 MYOFQ9NZM1 2061 aa0.92□□□□□ -2.26
USP34-216ENST00000487547 PTPRSQ13332 1948 aa0.92□□□□□ -2.26
USP34-216ENST00000487547 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa0.92□□□□□ -2.26
USP34-216ENST00000487547 TFPTP0C1Z6 253 aa0.92□□□□□ -2.26
USP34-216ENST00000487547 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP0.92□□□□□ -2.26
USP34-216ENST00000487547 CXCR4P61073 352 aa0.92□□□□□ -2.26
USP34-216ENST00000487547 RPL30P62888 115 aaKnown RBP0.92□□□□□ -2.26
USP34-216ENST00000487547 PMS2P3Q13401 168 aa0.92□□□□□ -2.26
USP34-216ENST00000487547 C5orf46Q6UWT4 87 aa0.92□□□□□ -2.26
USP34-216ENST00000487547 DHFR2Q86XF0 187 aa0.92□□□□□ -2.26
USP34-216ENST00000487547 CD302Q8IX05 232 aa0.92□□□□□ -2.26
USP34-216ENST00000487547 FAM19A2Q8N3H0 131 aa0.92□□□□□ -2.26
USP34-216ENST00000487547 SLC22A24Q8N4F4 322 aa0.92□□□□□ -2.26
USP34-216ENST00000487547 TBC1D19Q8N5T2 526 aa0.92□□□□□ -2.26
USP34-216ENST00000487547 SERPINI1Q99574 410 aa0.92□□□□□ -2.26
USP34-216ENST00000487547 HRASLSQ9HDD0 168 aa0.92□□□□□ -2.26
USP34-216ENST00000487547 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP0.92□□□□□ -2.26
USP34-216ENST00000487547 AK3Q9UIJ7 227 aa0.92□□□□□ -2.26
USP34-216ENST00000487547 LHFPL6Q9Y693 200 aa0.92□□□□□ -2.26
USP34-216ENST00000487547 POLEQ07864 2286 aa0.92□□□□□ -2.26
USP34-216ENST00000487547 TONSLQ96HA7 1378 aa0.92□□□□□ -2.26
USP34-216ENST00000487547 SETD5Q9C0A6 1442 aa0.91□□□□□ -2.26
USP34-216ENST00000487547 SBSNQ6UWP8 590 aa0.91□□□□□ -2.26
USP34-216ENST00000487547 OR7G1Q8NGA0 311 aa0.91□□□□□ -2.26
USP34-216ENST00000487547 YIPF3Q9GZM5 350 aa0.91□□□□□ -2.26
USP34-216ENST00000487547 TRABDQ9H4I3 376 aa0.91□□□□□ -2.26
USP34-216ENST00000487547 GPR84Q9NQS5 396 aa0.91□□□□□ -2.26
USP34-216ENST00000487547 ITGB1BP1O14713 200 aa0.9□□□□□ -2.27
USP34-216ENST00000487547 HPGDSO60760 199 aa0.9□□□□□ -2.27
USP34-216ENST00000487547 METTL15P1P0C7V9 234 aa0.9□□□□□ -2.27
USP34-216ENST00000487547 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP0.9□□□□□ -2.27
USP34-216ENST00000487547 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa0.9□□□□□ -2.27
USP34-216ENST00000487547 FAM78BQ5VT40 261 aa0.9□□□□□ -2.27
USP34-216ENST00000487547 SSX8Q7RTT4 187 aa0.9□□□□□ -2.27
USP34-216ENST00000487547 ZNF676Q8N7Q3 588 aa0.9□□□□□ -2.27
USP34-216ENST00000487547 ZNF565Q8N9K5 539 aa0.9□□□□□ -2.27
USP34-216ENST00000487547 OR2T27Q8NH04 317 aa0.9□□□□□ -2.27
USP34-216ENST00000487547 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP0.9□□□□□ -2.27
USP34-216ENST00000487547 TIMM22Q9Y584 194 aa0.9□□□□□ -2.27
USP34-216ENST00000487547 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa0.89□□□□□ -2.27
USP34-216ENST00000487547 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP0.89□□□□□ -2.27
USP34-216ENST00000487547 ERICH2A1L162 156 aa0.89□□□□□ -2.27
USP34-216ENST00000487547 TRAPPC2LH3BP13 241 aa0.89□□□□□ -2.27
USP34-216ENST00000487547 SLC22A1O15245 554 aa0.89□□□□□ -2.27
USP34-216ENST00000487547 CSN1S1P47710 185 aa0.89□□□□□ -2.27
USP34-216ENST00000487547 FXYD2P54710 66 aa0.89□□□□□ -2.27
USP34-216ENST00000487547 CLDN12P56749 244 aa0.89□□□□□ -2.27
USP34-216ENST00000487547 TEX36Q5VZQ5 186 aa0.89□□□□□ -2.27
USP34-216ENST00000487547 ZNF439Q8NDP4 499 aa0.89□□□□□ -2.27
USP34-216ENST00000487547 OR5AC2Q9NZP5 309 aa0.89□□□□□ -2.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.4 ms