RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487538.1

GTPBP1-211, Transcript of GTP binding protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene GTPBP1, Length 358 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTPBP1-211ENST00000487538 H7C2Y5 167 aa8.43□□□□□ -1.06
GTPBP1-211ENST00000487538 SHOXO15266 292 aa8.43□□□□□ -1.06
GTPBP1-211ENST00000487538 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
GTPBP1-211ENST00000487538 IFNA17P01571 189 aa8.43□□□□□ -1.06
GTPBP1-211ENST00000487538 IGHV2-5P01817 119 aa8.43□□□□□ -1.06
GTPBP1-211ENST00000487538 IGKV1-16P04430 117 aa8.43□□□□□ -1.06
GTPBP1-211ENST00000487538 FAM157CP0CG43 387 aa8.43□□□□□ -1.06
GTPBP1-211ENST00000487538 SPP1P10451 314 aa8.43□□□□□ -1.06
GTPBP1-211ENST00000487538 COX7A1P24310 79 aa8.43□□□□□ -1.06
GTPBP1-211ENST00000487538 REG1BP48304 166 aa8.43□□□□□ -1.06
GTPBP1-211ENST00000487538 SULT1A2P50226 295 aa8.43□□□□□ -1.06
GTPBP1-211ENST00000487538 PDLIM4P50479 330 aa8.43□□□□□ -1.06
GTPBP1-211ENST00000487538 RAB13P51153 203 aa8.43□□□□□ -1.06
GTPBP1-211ENST00000487538 HLA-DRB5Q30154 266 aa8.43□□□□□ -1.06
GTPBP1-211ENST00000487538 TMEM177Q53S58 311 aa8.43□□□□□ -1.06
GTPBP1-211ENST00000487538 ZNF429Q86V71 674 aa8.43□□□□□ -1.06
GTPBP1-211ENST00000487538 KIR3DL3Q8N743 410 aa8.43□□□□□ -1.06
GTPBP1-211ENST00000487538 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa8.43□□□□□ -1.06
GTPBP1-211ENST00000487538 ZDHHC16Q969W1 377 aa8.43□□□□□ -1.06
GTPBP1-211ENST00000487538 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
GTPBP1-211ENST00000487538 OR4C12Q96R67 309 aa8.43□□□□□ -1.06
GTPBP1-211ENST00000487538 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
GTPBP1-211ENST00000487538 PRNDQ9UKY0 176 aa8.43□□□□□ -1.06
GTPBP1-211ENST00000487538 WASHC3Q9Y3C0 194 aa8.43□□□□□ -1.06
GTPBP1-211ENST00000487538 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
GTPBP1-211ENST00000487538 ARID1AO14497 2285 aa8.43□□□□□ -1.06
GTPBP1-211ENST00000487538 ABCA4P78363 2273 aa8.43□□□□□ -1.06
GTPBP1-211ENST00000487538 F8P00451 2351 aa8.43□□□□□ -1.06
GTPBP1-211ENST00000487538 NF1P21359 2839 aa8.43□□□□□ -1.06
GTPBP1-211ENST00000487538 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
GTPBP1-211ENST00000487538 TRAV3A0A0B4J244 114 aa8.42□□□□□ -1.06
GTPBP1-211ENST00000487538 UPK2O00526 184 aa8.42□□□□□ -1.06
GTPBP1-211ENST00000487538 ENSAO43768 121 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
GTPBP1-211ENST00000487538 IFNA5P01569 189 aa8.42□□□□□ -1.06
GTPBP1-211ENST00000487538 IGLV1-47P01700 117 aa8.42□□□□□ -1.06
GTPBP1-211ENST00000487538 IGHV4-39P01824 125 aa8.42□□□□□ -1.06
GTPBP1-211ENST00000487538 ARG1P05089 322 aa8.42□□□□□ -1.06
GTPBP1-211ENST00000487538 MC5RP33032 325 aa8.42□□□□□ -1.06
GTPBP1-211ENST00000487538 RPP30P78346 268 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
GTPBP1-211ENST00000487538 AANATQ16613 207 aa8.42□□□□□ -1.06
GTPBP1-211ENST00000487538 SPINK9Q5DT21 86 aa8.42□□□□□ -1.06
GTPBP1-211ENST00000487538 SPNS3Q6ZMD2 512 aa8.42□□□□□ -1.06
GTPBP1-211ENST00000487538 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
GTPBP1-211ENST00000487538 HAPLN4Q86UW8 402 aa8.42□□□□□ -1.06
GTPBP1-211ENST00000487538 LILRB2Q8N423 598 aa8.42□□□□□ -1.06
GTPBP1-211ENST00000487538 PNKDQ8N490 385 aa8.42□□□□□ -1.06
GTPBP1-211ENST00000487538 ZNF525Q8N782 197 aa8.42□□□□□ -1.06
GTPBP1-211ENST00000487538 Q8N7P7 452 aa8.42□□□□□ -1.06
GTPBP1-211ENST00000487538 LHX4Q969G2 390 aa8.42□□□□□ -1.06
GTPBP1-211ENST00000487538 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
GTPBP1-211ENST00000487538 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
GTPBP1-211ENST00000487538 HARBI1Q96MB7 349 aa8.42□□□□□ -1.06
GTPBP1-211ENST00000487538 REG4Q9BYZ8 158 aa8.42□□□□□ -1.06
GTPBP1-211ENST00000487538 TMEM14BQ9NUH8 114 aa8.42□□□□□ -1.06
GTPBP1-211ENST00000487538 BET1LQ9NYM9 111 aa8.42□□□□□ -1.06
GTPBP1-211ENST00000487538 TCF19Q9Y242 345 aa8.42□□□□□ -1.06
GTPBP1-211ENST00000487538 USF3Q68DE3 2245 aa8.42□□□□□ -1.06
GTPBP1-211ENST00000487538 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa8.41□□□□□ -1.06
GTPBP1-211ENST00000487538 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
GTPBP1-211ENST00000487538 FGF2P09038 288 aa8.41□□□□□ -1.06
GTPBP1-211ENST00000487538 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
GTPBP1-211ENST00000487538 ATP6V0CP27449 155 aa8.41□□□□□ -1.06
GTPBP1-211ENST00000487538 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
GTPBP1-211ENST00000487538 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
GTPBP1-211ENST00000487538 RAB5CP51148 216 aa8.41□□□□□ -1.06
GTPBP1-211ENST00000487538 DLX1P56177 255 aa8.41□□□□□ -1.06
GTPBP1-211ENST00000487538 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
GTPBP1-211ENST00000487538 ARF6P62330 175 aa8.41□□□□□ -1.06
GTPBP1-211ENST00000487538 BLOC1S1P78537 153 aa8.41□□□□□ -1.06
GTPBP1-211ENST00000487538 SLC38A11Q08AI6 406 aa8.41□□□□□ -1.06
GTPBP1-211ENST00000487538 ARL16Q0P5N6 197 aa8.41□□□□□ -1.06
GTPBP1-211ENST00000487538 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa8.41□□□□□ -1.06
GTPBP1-211ENST00000487538 SLC25A24Q6NUK1 477 aa8.41□□□□□ -1.06
GTPBP1-211ENST00000487538 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa8.41□□□□□ -1.06
GTPBP1-211ENST00000487538 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
GTPBP1-211ENST00000487538 OR4P4Q8NGL7 312 aa8.41□□□□□ -1.06
GTPBP1-211ENST00000487538 OR4C13Q8NGP0 309 aa8.41□□□□□ -1.06
GTPBP1-211ENST00000487538 OR4A5Q8NH83 315 aa8.41□□□□□ -1.06
GTPBP1-211ENST00000487538 SCGB1C1Q8TD33 95 aa8.41□□□□□ -1.06
GTPBP1-211ENST00000487538 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
GTPBP1-211ENST00000487538 BPESC1Q9GZL8 116 aa8.41□□□□□ -1.06
GTPBP1-211ENST00000487538 SH3BGRL3Q9H299 93 aa8.41□□□□□ -1.06
GTPBP1-211ENST00000487538 HIPK2Q9H2X6 1198 aa8.41□□□□□ -1.06
GTPBP1-211ENST00000487538 FKBP11Q9NYL4 201 aa8.41□□□□□ -1.06
GTPBP1-211ENST00000487538 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa8.41□□□□□ -1.06
GTPBP1-211ENST00000487538 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa8.41□□□□□ -1.06
GTPBP1-211ENST00000487538 OR51B2Q9Y5P1 312 aa8.41□□□□□ -1.06
GTPBP1-211ENST00000487538 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
GTPBP1-211ENST00000487538 C15orf62A8K5M9 175 aa8.4□□□□□ -1.06
GTPBP1-211ENST00000487538 A8MXK9 166 aa8.4□□□□□ -1.06
GTPBP1-211ENST00000487538 NUDT19A8MXV4 375 aa8.4□□□□□ -1.06
GTPBP1-211ENST00000487538 TEX46H3BTG2 121 aa8.4□□□□□ -1.06
GTPBP1-211ENST00000487538 I3L521 148 aa8.4□□□□□ -1.06
GTPBP1-211ENST00000487538 KBTBD11O94819 623 aa8.4□□□□□ -1.06
GTPBP1-211ENST00000487538 PRTN3P24158 256 aa8.4□□□□□ -1.06
GTPBP1-211ENST00000487538 RPS16P62249 146 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
GTPBP1-211ENST00000487538 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
GTPBP1-211ENST00000487538 ATP6V1FQ16864 119 aa8.4□□□□□ -1.06
GTPBP1-211ENST00000487538 OR8G2PQ6IF36 304 aa8.4□□□□□ -1.06
GTPBP1-211ENST00000487538 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
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