RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484547.7

RABGEF1-207, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RABGEF1, Length 1,596 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-207ENST00000484547 HSF4Q9ULV5 492 aa9.37□□□□□ -0.91
RABGEF1-207ENST00000484547 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa9.37□□□□□ -0.91
RABGEF1-207ENST00000484547 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa9.36□□□□□ -0.91
RABGEF1-207ENST00000484547 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP9.36□□□□□ -0.91
RABGEF1-207ENST00000484547 WRBO00258 174 aa9.36□□□□□ -0.91
RABGEF1-207ENST00000484547 FABP1P07148 127 aa9.36□□□□□ -0.91
RABGEF1-207ENST00000484547 ZNF44P15621 663 aa9.36□□□□□ -0.91
RABGEF1-207ENST00000484547 DTYMKP23919 212 aa9.36□□□□□ -0.91
RABGEF1-207ENST00000484547 P2RY1P47900 373 aa9.36□□□□□ -0.91
RABGEF1-207ENST00000484547 AKR1C2P52895 323 aa9.36□□□□□ -0.91
RABGEF1-207ENST00000484547 UCP3P55916 312 aa9.36□□□□□ -0.91
RABGEF1-207ENST00000484547 AKR1C1Q04828 323 aa9.36□□□□□ -0.91
RABGEF1-207ENST00000484547 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP9.36□□□□□ -0.91
RABGEF1-207ENST00000484547 ABCA11PQ4W5N1 156 aa9.36□□□□□ -0.91
RABGEF1-207ENST00000484547 MINOS1Q5TGZ0 78 aa9.36□□□□□ -0.91
RABGEF1-207ENST00000484547 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP9.36□□□□□ -0.91
RABGEF1-207ENST00000484547 TCF23Q7RTU1 214 aa9.36□□□□□ -0.91
RABGEF1-207ENST00000484547 SGPP2Q8IWX5 399 aa9.36□□□□□ -0.91
RABGEF1-207ENST00000484547 LINC00469Q8N7U9 141 aa9.36□□□□□ -0.91
RABGEF1-207ENST00000484547 OR13C9Q8NGT0 318 aa9.36□□□□□ -0.91
RABGEF1-207ENST00000484547 ZNF714Q96N38 554 aa9.36□□□□□ -0.91
RABGEF1-207ENST00000484547 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa9.36□□□□□ -0.91
RABGEF1-207ENST00000484547 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa9.36□□□□□ -0.91
RABGEF1-207ENST00000484547 A0A087WWC5 75 aa9.35□□□□□ -0.91
RABGEF1-207ENST00000484547 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa9.35□□□□□ -0.91
RABGEF1-207ENST00000484547 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa9.35□□□□□ -0.91
RABGEF1-207ENST00000484547 TGOLN2O43493 480 aa9.35□□□□□ -0.91
RABGEF1-207ENST00000484547 ZNF737O75373 536 aa9.35□□□□□ -0.91
RABGEF1-207ENST00000484547 ADAP1O75689 374 aa9.35□□□□□ -0.91
RABGEF1-207ENST00000484547 EDDM3AQ14507 147 aa9.35□□□□□ -0.91
RABGEF1-207ENST00000484547 SLC22A6Q4U2R8 563 aa9.35□□□□□ -0.91
RABGEF1-207ENST00000484547 Q6ZRG5 221 aa9.35□□□□□ -0.91
RABGEF1-207ENST00000484547 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP9.35□□□□□ -0.91
RABGEF1-207ENST00000484547 OR14K1Q8NGZ2 314 aa9.35□□□□□ -0.91
RABGEF1-207ENST00000484547 AKR1E2Q96JD6 320 aa9.35□□□□□ -0.91
RABGEF1-207ENST00000484547 S100A13Q99584 98 aa9.35□□□□□ -0.91
RABGEF1-207ENST00000484547 GPR61Q9BZJ8 451 aa9.35□□□□□ -0.91
RABGEF1-207ENST00000484547 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa9.35□□□□□ -0.91
RABGEF1-207ENST00000484547 TMED3Q9Y3Q3 217 aa9.35□□□□□ -0.91
RABGEF1-207ENST00000484547 V9GYS6 101 aa9.35□□□□□ -0.91
RABGEF1-207ENST00000484547 CXorf65A6NEN9 183 aa9.34□□□□□ -0.91
RABGEF1-207ENST00000484547 UMAD1C9J7I0 102 aa9.34□□□□□ -0.91
RABGEF1-207ENST00000484547 AP4M1O00189 453 aa9.34□□□□□ -0.91
RABGEF1-207ENST00000484547 SOCS1O15524 211 aa9.34□□□□□ -0.91
RABGEF1-207ENST00000484547 DHRS3O75911 302 aa9.34□□□□□ -0.91
RABGEF1-207ENST00000484547 RAB5AP20339 215 aa9.34□□□□□ -0.91
RABGEF1-207ENST00000484547 FCGR2CP31995 323 aa9.34□□□□□ -0.91
RABGEF1-207ENST00000484547 SNU13P55769 128 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.91
RABGEF1-207ENST00000484547 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.91
RABGEF1-207ENST00000484547 ARFRP1Q13795 201 aa9.34□□□□□ -0.91
RABGEF1-207ENST00000484547 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP9.34□□□□□ -0.91
RABGEF1-207ENST00000484547 C16orf82Q7Z2V1 217 aa9.34□□□□□ -0.91
RABGEF1-207ENST00000484547 RNF144BQ7Z419 303 aa9.34□□□□□ -0.91
RABGEF1-207ENST00000484547 TPRX1Q8N7U7 411 aa9.34□□□□□ -0.91
RABGEF1-207ENST00000484547 NICN1Q9BSH3 213 aa9.34□□□□□ -0.91
RABGEF1-207ENST00000484547 SLC25A33Q9BSK2 321 aa9.34□□□□□ -0.91
RABGEF1-207ENST00000484547 CLEC7AQ9BXN2 247 aa9.34□□□□□ -0.91
RABGEF1-207ENST00000484547 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa9.34□□□□□ -0.91
RABGEF1-207ENST00000484547 FBXL17Q9UF56 701 aa9.34□□□□□ -0.91
RABGEF1-207ENST00000484547 hADV38S2A0JD32 116 aa9.33□□□□□ -0.92
RABGEF1-207ENST00000484547 C7orf77A4D0Y5 90 aa9.33□□□□□ -0.92
RABGEF1-207ENST00000484547 H3BSH0 61 aa9.33□□□□□ -0.92
RABGEF1-207ENST00000484547 IFNA17P01571 189 aa9.33□□□□□ -0.92
RABGEF1-207ENST00000484547 NFYBP25208 207 aa9.33□□□□□ -0.92
RABGEF1-207ENST00000484547 HTR1DP28221 377 aa9.33□□□□□ -0.92
RABGEF1-207ENST00000484547 ERVK11-1P61568 191 aa9.33□□□□□ -0.92
RABGEF1-207ENST00000484547 SRPXP78539 464 aa9.33□□□□□ -0.92
RABGEF1-207ENST00000484547 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP9.33□□□□□ -0.92
RABGEF1-207ENST00000484547 GUK1Q16774 197 aa9.33□□□□□ -0.92
RABGEF1-207ENST00000484547 C9orf152Q5JTZ5 239 aa9.33□□□□□ -0.92
RABGEF1-207ENST00000484547 ETV3LQ6ZN32 361 aa9.33□□□□□ -0.92
RABGEF1-207ENST00000484547 TMEM104Q8NE00 496 aa9.33□□□□□ -0.92
RABGEF1-207ENST00000484547 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa9.33□□□□□ -0.92
RABGEF1-207ENST00000484547 YPEL4Q96NS1 127 aa9.33□□□□□ -0.92
RABGEF1-207ENST00000484547 PECRQ9BY49 303 aa9.33□□□□□ -0.92
RABGEF1-207ENST00000484547 SLC35B3Q9H1N7 401 aa9.33□□□□□ -0.92
RABGEF1-207ENST00000484547 TMEM133Q9H2Q1 129 aa9.33□□□□□ -0.92
RABGEF1-207ENST00000484547 EHFQ9NZC4 300 aa9.33□□□□□ -0.92
RABGEF1-207ENST00000484547 U3KQK5 164 aa9.33□□□□□ -0.92
RABGEF1-207ENST00000484547 SORL1Q92673 2214 aa9.33□□□□□ -0.92
RABGEF1-207ENST00000484547 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa9.33□□□□□ -0.92
RABGEF1-207ENST00000484547 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
RABGEF1-207ENST00000484547 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP9.33□□□□□ -0.92
RABGEF1-207ENST00000484547 TMEM42Q69YG0 159 aa9.33□□□□□ -0.92
RABGEF1-207ENST00000484547 ASCL4Q6XD76 172 aa9.33□□□□□ -0.92
RABGEF1-207ENST00000484547 OR4P4Q8NGL7 312 aa9.33□□□□□ -0.92
RABGEF1-207ENST00000484547 CLCC1Q96S66 551 aa9.33□□□□□ -0.92
RABGEF1-207ENST00000484547 CHST5Q9GZS9 411 aa9.33□□□□□ -0.92
RABGEF1-207ENST00000484547 OR2S2Q9NQN1 319 aa9.33□□□□□ -0.92
RABGEF1-207ENST00000484547 DMRT1Q9Y5R6 373 aa9.33□□□□□ -0.92
RABGEF1-207ENST00000484547 RYR2Q92736 4967 aa9.33□□□□□ -0.92
RABGEF1-207ENST00000484547 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa9.32□□□□□ -0.92
RABGEF1-207ENST00000484547 MMP23AO75900 390 aa9.32□□□□□ -0.92
RABGEF1-207ENST00000484547 AMY1AP04745 511 aa9.32□□□□□ -0.92
RABGEF1-207ENST00000484547 BRS3P32247 399 aa9.32□□□□□ -0.92
RABGEF1-207ENST00000484547 OR3A4PP47883 348 aa9.32□□□□□ -0.92
RABGEF1-207ENST00000484547 IL24Q13007 206 aa9.32□□□□□ -0.92
RABGEF1-207ENST00000484547 KISS1Q15726 138 aa9.32□□□□□ -0.92
RABGEF1-207ENST00000484547 DPPA3Q6W0C5 159 aa9.32□□□□□ -0.92
RABGEF1-207ENST00000484547 OR10G4Q8NGN3 311 aa9.32□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.4 ms