RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480113.1

CNTN4-215, Transcript of contactin 4, human

TSL 4

Gene CNTN4, Length 575 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CNTN4-215	ENST00000480113	NUFIP1	Q9UHK0	495 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CNTN4-215	ENST00000480113	PROCR	Q9UNN8	238 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CNTN4-215	ENST00000480113	NAIP	Q13075	1403 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CNTN4-215	ENST00000480113	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CNTN4-215	ENST00000480113	TRBV20OR9-2	A0A075B6H5	130 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CNTN4-215	ENST00000480113	MEIS3P1	A6NDR6	274 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CNTN4-215	ENST00000480113	GABARAP	H6UMI1	98 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CNTN4-215	ENST00000480113		J3QQQ9	107 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CNTN4-215	ENST00000480113	DNASE2	O00115	360 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CNTN4-215	ENST00000480113	LYZL6	O75951	148 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CNTN4-215	ENST00000480113	CA7	P43166	264 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CNTN4-215	ENST00000480113	RPS11	P62280	158 aa	Known RBP eCLIP	4.87	□□□□□ -1.63
CNTN4-215	ENST00000480113	VMA21	Q3ZAQ7	101 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CNTN4-215	ENST00000480113	PRR30	Q53SZ7	412 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CNTN4-215	ENST00000480113	C9orf66	Q5T8R8	295 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CNTN4-215	ENST00000480113	TMEM244	Q5VVB8	128 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CNTN4-215	ENST00000480113	EBLN2	Q6P2I7	272 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CNTN4-215	ENST00000480113	TMUB2	Q71RG4	321 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CNTN4-215	ENST00000480113	WDR86	Q86TI4	376 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CNTN4-215	ENST00000480113	LRP11	Q86VZ4	500 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CNTN4-215	ENST00000480113	ZNF436-AS1	Q8NC38	126 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CNTN4-215	ENST00000480113	MRPL30	Q8TCC3	161 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CNTN4-215	ENST00000480113	LMX1A	Q8TE12	382 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CNTN4-215	ENST00000480113	RTN4IP1	Q8WWV3	396 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CNTN4-215	ENST00000480113	C2orf50	Q96LR7	162 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CNTN4-215	ENST00000480113	TIMM17A	Q99595	171 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CNTN4-215	ENST00000480113	SNHG12	Q9BXW3	62 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CNTN4-215	ENST00000480113	WDR61	Q9GZS3	305 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CNTN4-215	ENST00000480113	AICDA	Q9GZX7	198 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CNTN4-215	ENST00000480113	METTL1	Q9UBP6	276 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CNTN4-215	ENST00000480113	BOK	Q9UMX3	212 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CNTN4-215	ENST00000480113	TSPOAP1	O95153	1857 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CNTN4-215	ENST00000480113	FMN1	Q68DA7	1419 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CNTN4-215	ENST00000480113	DOCK3	Q8IZD9	2030 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CNTN4-215	ENST00000480113	DPRX	A6NFQ7	191 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CNTN4-215	ENST00000480113	TMEM212	A6NML5	194 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CNTN4-215	ENST00000480113	MPTX1	A8MV57	137 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CNTN4-215	ENST00000480113	UBE2L6	O14933	153 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CNTN4-215	ENST00000480113	NPFF	O15130	113 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CNTN4-215	ENST00000480113	DUSP14	O95147	198 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CNTN4-215	ENST00000480113	MT-ND4L	P03901	98 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CNTN4-215	ENST00000480113	CD48	P09326	243 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CNTN4-215	ENST00000480113	IGLC6	P0CF74	106 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CNTN4-215	ENST00000480113	FKBP2	P26885	142 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CNTN4-215	ENST00000480113	RBM11	P57052	281 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CNTN4-215	ENST00000480113	PRR4	Q16378	134 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CNTN4-215	ENST00000480113	PABPC1L2A	Q5JQF8	200 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CNTN4-215	ENST00000480113	NHLRC3	Q5JS37	347 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CNTN4-215	ENST00000480113	ZNF767P	Q75MW2	155 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CNTN4-215	ENST00000480113	C1orf174	Q8IYL3	243 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CNTN4-215	ENST00000480113	ZNF664	Q8N3J9	261 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CNTN4-215	ENST00000480113	PP6455	Q8WZ26	134 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CNTN4-215	ENST00000480113	GPX7	Q96SL4	187 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CNTN4-215	ENST00000480113	SPIN2A	Q99865	258 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CNTN4-215	ENST00000480113	SPIN2B	Q9BPZ2	258 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CNTN4-215	ENST00000480113	MRPL57	Q9BQC6	102 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CNTN4-215	ENST00000480113		Q9H3A6	140 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CNTN4-215	ENST00000480113	ADGRL1	O94910	1474 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CNTN4-215	ENST00000480113	FER1L5	A0AVI2	2057 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNTN4-215	ENST00000480113	LOC107984640	A0A0U1RRK4	108 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNTN4-215	ENST00000480113	GGT3P	A6NGU5	568 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNTN4-215	ENST00000480113	BBIP1	A8MTZ0	92 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNTN4-215	ENST00000480113	GGTLC3	B5MD39	225 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNTN4-215	ENST00000480113	KRBOX1	C9JBD0	128 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNTN4-215	ENST00000480113	LST1	O00453	97 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNTN4-215	ENST00000480113	COX7A2L	O14548	114 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNTN4-215	ENST00000480113	AMBP	P02760	352 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNTN4-215	ENST00000480113	HLA-DPB1	P04440	258 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNTN4-215	ENST00000480113		P0DMU3	169 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNTN4-215	ENST00000480113	FAM231A	P0DMU4	169 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNTN4-215	ENST00000480113	FAM231C	P0DMU5	169 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNTN4-215	ENST00000480113	ATP6V0C	P27449	155 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNTN4-215	ENST00000480113	OPRM1	P35372	400 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNTN4-215	ENST00000480113	ZNF83	P51522	516 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNTN4-215	ENST00000480113	LINC00313	P59037	77 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNTN4-215	ENST00000480113	ELOC	Q15369	112 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNTN4-215	ENST00000480113	STPG1	Q5TH74	334 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNTN4-215	ENST00000480113		Q5XG85	94 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNTN4-215	ENST00000480113	AMMECR1L	Q6DCA0	310 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNTN4-215	ENST00000480113	FAM53A	Q6NSI3	398 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CNTN4-215	ENST00000480113	LHFPL1	Q86WI0	220 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNTN4-215	ENST00000480113	PRR15	Q8IV56	129 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNTN4-215	ENST00000480113	OR4S1	Q8NGB4	309 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNTN4-215	ENST00000480113	SMIM14	Q96QK8	99 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNTN4-215	ENST00000480113	RERGL	Q9H628	205 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNTN4-215	ENST00000480113	CKLF	Q9UBR5	152 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNTN4-215	ENST00000480113		V9GYS6	101 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNTN4-215	ENST00000480113	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNTN4-215	ENST00000480113	NAV1	Q8NEY1	1877 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNTN4-215	ENST00000480113	XIRP1	Q702N8	1843 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CNTN4-215	ENST00000480113	LOC100130705	A0A1B0GUX0	176 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CNTN4-215	ENST00000480113	IZUMO1R	A6ND01	250 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CNTN4-215	ENST00000480113		A8MUN3	132 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CNTN4-215	ENST00000480113		C9JQL5	133 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CNTN4-215	ENST00000480113	GABARAP	O95166	117 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CNTN4-215	ENST00000480113	ZNF705D	P0CH99	300 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CNTN4-215	ENST00000480113	PGAM2	P15259	253 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CNTN4-215	ENST00000480113	CASP1	P29466	404 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CNTN4-215	ENST00000480113	RAB5C	P51148	216 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CNTN4-215	ENST00000480113	EGFEM1P	Q0D2K5	195 aa		4.84	□□□□□ -1.63

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