RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480099.1

PKDCC-206, Transcript of protein kinase domain containing, cytoplasmic, human

TSL 5

Gene PKDCC, Length 787 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PKDCC-206	ENST00000480099	IFITM3	Q01628	133 aa		12.82	□□□□□ -0.36
PKDCC-206	ENST00000480099	POU2AF1	Q16633	256 aa		12.82	□□□□□ -0.36
PKDCC-206	ENST00000480099	H2BFWT	Q7Z2G1	175 aa		12.82	□□□□□ -0.36
PKDCC-206	ENST00000480099	CENPV	Q7Z7K6	275 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
PKDCC-206	ENST00000480099	ZNF695	Q8IW36	515 aa		12.82	□□□□□ -0.36
PKDCC-206	ENST00000480099	PUSL1	Q8N0Z8	303 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
PKDCC-206	ENST00000480099	KLHDC1	Q8N7A1	406 aa		12.82	□□□□□ -0.36
PKDCC-206	ENST00000480099	OR4A5	Q8NH83	315 aa		12.82	□□□□□ -0.36
PKDCC-206	ENST00000480099	GRPEL2	Q8TAA5	225 aa		12.82	□□□□□ -0.36
PKDCC-206	ENST00000480099	ARPC1A	Q92747	370 aa		12.82	□□□□□ -0.36
PKDCC-206	ENST00000480099	PHB2	Q99623	299 aa		12.82	□□□□□ -0.36
PKDCC-206	ENST00000480099	MDFI	Q99750	246 aa		12.82	□□□□□ -0.36
PKDCC-206	ENST00000480099	TMEM222	Q9H0R3	208 aa		12.82	□□□□□ -0.36
PKDCC-206	ENST00000480099	ZNF430	Q9H8G1	570 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
PKDCC-206	ENST00000480099	BET1L	Q9NYM9	111 aa		12.82	□□□□□ -0.36
PKDCC-206	ENST00000480099	LINC00527	Q9UJ94	153 aa		12.82	□□□□□ -0.36
PKDCC-206	ENST00000480099	FLVCR2	Q9UPI3	526 aa		12.82	□□□□□ -0.36
PKDCC-206	ENST00000480099	TRAV6	A0A075B6T7	132 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PKDCC-206	ENST00000480099	ATP6V0E1	O15342	81 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PKDCC-206	ENST00000480099	SNAPC5	O75971	98 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PKDCC-206	ENST00000480099	TCRB	P04435	133 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PKDCC-206	ENST00000480099	SLC6A1	P30531	599 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PKDCC-206	ENST00000480099	COMP	P49747	757 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
PKDCC-206	ENST00000480099	SLC35B1	P78383	322 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PKDCC-206	ENST00000480099	PJVK	Q0ZLH3	352 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PKDCC-206	ENST00000480099	FXYD3	Q14802	87 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PKDCC-206	ENST00000480099	PRSS8	Q16651	343 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PKDCC-206	ENST00000480099	ECSCR	Q19T08	205 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PKDCC-206	ENST00000480099	ZNF562	Q6V9R5	426 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PKDCC-206	ENST00000480099	SLC25A42	Q86VD7	318 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PKDCC-206	ENST00000480099	C3orf56	Q8N813	242 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PKDCC-206	ENST00000480099	TMEM167A	Q8TBQ9	72 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PKDCC-206	ENST00000480099	CHPT1	Q8WUD6	406 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PKDCC-206	ENST00000480099	RRNAD1	Q96FB5	475 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
PKDCC-206	ENST00000480099	GALNT14	Q96FL9	552 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PKDCC-206	ENST00000480099	NOL4L	Q96MY1	436 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
PKDCC-206	ENST00000480099	GON7	Q9BXV9	100 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PKDCC-206	ENST00000480099	FBN1	P35555	2871 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
PKDCC-206	ENST00000480099	PSMB11	A5LHX3	300 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PKDCC-206	ENST00000480099	LINC01548	A6NM66	108 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PKDCC-206	ENST00000480099	PROK1	P58294	105 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PKDCC-206	ENST00000480099	UBE2M	P61081	183 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
PKDCC-206	ENST00000480099	RPL8	P62917	257 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
PKDCC-206	ENST00000480099	SRPX	P78539	464 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PKDCC-206	ENST00000480099	C4orf46	Q504U0	113 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PKDCC-206	ENST00000480099	TMEM268	Q5VZI3	342 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PKDCC-206	ENST00000480099	STPG2	Q8N412	459 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PKDCC-206	ENST00000480099	GLYATL2	Q8WU03	294 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PKDCC-206	ENST00000480099	RBPMS	Q93062	196 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
PKDCC-206	ENST00000480099	FAM103A1	Q9BTL3	118 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
PKDCC-206	ENST00000480099	NUDT15	Q9NV35	164 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PKDCC-206	ENST00000480099	NUBP2	Q9Y5Y2	271 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PKDCC-206	ENST00000480099	PIGBOS1	A0A0B4J2F0	54 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PKDCC-206	ENST00000480099	UPK2	O00526	184 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PKDCC-206	ENST00000480099	RBMXL2	O75526	392 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
PKDCC-206	ENST00000480099	IGKV1-39	P01597	117 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PKDCC-206	ENST00000480099	HLA-A	P01891	365 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
PKDCC-206	ENST00000480099	IGKV1D-39	P04432	117 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PKDCC-206	ENST00000480099	H2AFB2	P0C5Z0	115 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PKDCC-206	ENST00000480099	ANXA7	P20073	488 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
PKDCC-206	ENST00000480099	MAS1L	P35410	378 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PKDCC-206	ENST00000480099	RAB25	P57735	213 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PKDCC-206	ENST00000480099	SUPT4H1	P63272	117 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
PKDCC-206	ENST00000480099	NDP	Q00604	133 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PKDCC-206	ENST00000480099	TMEM267	Q0VDI3	215 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
PKDCC-206	ENST00000480099	PPP1R1A	Q13522	171 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PKDCC-206	ENST00000480099	TMEM187	Q14656	261 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PKDCC-206	ENST00000480099	LGI3	Q8N145	548 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PKDCC-206	ENST00000480099	OR4A16	Q8NH70	328 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PKDCC-206	ENST00000480099	CASTOR1	Q8WTX7	329 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PKDCC-206	ENST00000480099	SEC22A	Q96IW7	307 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PKDCC-206	ENST00000480099	PRR13	Q9NZ81	148 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PKDCC-206	ENST00000480099	WSB1	Q9Y6I7	421 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PKDCC-206	ENST00000480099	TRAV41	A0A0B4J266	112 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PKDCC-206	ENST00000480099	SFT2D2	O95562	160 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PKDCC-206	ENST00000480099	CDS2	O95674	445 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PKDCC-206	ENST00000480099	IGF1	P05019	195 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PKDCC-206	ENST00000480099	OR4E1	P0C645	316 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PKDCC-206	ENST00000480099	HLA-G	P17693	338 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PKDCC-206	ENST00000480099	RPL27A	P46776	148 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
PKDCC-206	ENST00000480099	UNQ5815/PRO19632	Q6UWF5	114 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PKDCC-206	ENST00000480099	SELENOH	Q8IZQ5	122 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
PKDCC-206	ENST00000480099	OR4X2	Q8NGF9	303 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PKDCC-206	ENST00000480099	SGMS2	Q8NHU3	365 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PKDCC-206	ENST00000480099	WFDC12	Q8WWY7	111 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PKDCC-206	ENST00000480099	SRSF12	Q8WXF0	261 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
PKDCC-206	ENST00000480099	COMMD5	Q9GZQ3	224 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PKDCC-206	ENST00000480099	TRAV3	A0A0B4J244	114 aa		12.77	□□□□□ -0.37
PKDCC-206	ENST00000480099	OPN1MW	P04001	364 aa		12.77	□□□□□ -0.37
PKDCC-206	ENST00000480099	OR9G9	P0C7N8	305 aa		12.77	□□□□□ -0.37
PKDCC-206	ENST00000480099	OPN1MW2	P0DN77	364 aa		12.77	□□□□□ -0.37
PKDCC-206	ENST00000480099	OPN1MW3	P0DN78	364 aa		12.77	□□□□□ -0.37
PKDCC-206	ENST00000480099	OR2B8P	P59922	312 aa		12.77	□□□□□ -0.37
PKDCC-206	ENST00000480099	C10orf55	Q5SWW7	151 aa		12.77	□□□□□ -0.37
PKDCC-206	ENST00000480099	PLET1	Q6UQ28	207 aa		12.77	□□□□□ -0.37
PKDCC-206	ENST00000480099	NRARP	Q7Z6K4	114 aa		12.77	□□□□□ -0.37
PKDCC-206	ENST00000480099	ZNF329	Q86UD4	541 aa		12.77	□□□□□ -0.37
PKDCC-206	ENST00000480099	LFNG	Q8NES3	379 aa		12.77	□□□□□ -0.37
PKDCC-206	ENST00000480099	OR5AU1	Q8NGC0	362 aa		12.77	□□□□□ -0.37
PKDCC-206	ENST00000480099	LHFPL5	Q8TAF8	219 aa		12.77	□□□□□ -0.37

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.7 ms