RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476784.5

TTC3-215, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 3, humanhuman

TSL 2

Gene TTC3, Length 7,425 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC3-215ENST00000476784 TOLLIPQ9H0E2 274 aa5.69□□□□□ -1.5
TTC3-215ENST00000476784 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa5.69□□□□□ -1.5
TTC3-215ENST00000476784 TIAF1O95411 115 aa5.69□□□□□ -1.5
TTC3-215ENST00000476784 RBM11P57052 281 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
TTC3-215ENST00000476784 RHOGP84095 191 aa5.69□□□□□ -1.5
TTC3-215ENST00000476784 RTN4RL2Q86UN3 420 aa5.69□□□□□ -1.5
TTC3-215ENST00000476784 C10orf111Q8N326 155 aa5.69□□□□□ -1.5
TTC3-215ENST00000476784 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa5.69□□□□□ -1.5
TTC3-215ENST00000476784 ZFPL1O95159 310 aa5.69□□□□□ -1.5
TTC3-215ENST00000476784 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
TTC3-215ENST00000476784 TMEM86BQ8N661 226 aa5.69□□□□□ -1.5
TTC3-215ENST00000476784 C9orf106Q8NAJ2 232 aa5.69□□□□□ -1.5
TTC3-215ENST00000476784 RCHY1Q96PM5 261 aa5.69□□□□□ -1.5
TTC3-215ENST00000476784 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
TTC3-215ENST00000476784 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
TTC3-215ENST00000476784 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
TTC3-215ENST00000476784 CFHR5Q9BXR6 569 aa5.69□□□□□ -1.5
TTC3-215ENST00000476784 OR51M1Q9H341 326 aa5.69□□□□□ -1.5
TTC3-215ENST00000476784 AKAP6Q13023 2319 aa5.68□□□□□ -1.5
TTC3-215ENST00000476784 ZNF831Q5JPB2 1677 aa5.68□□□□□ -1.5
TTC3-215ENST00000476784 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa5.68□□□□□ -1.5
TTC3-215ENST00000476784 C17orf100A8MU93 164 aa5.68□□□□□ -1.5
TTC3-215ENST00000476784 TMEM250H0YL14 139 aa5.68□□□□□ -1.5
TTC3-215ENST00000476784 CFDP00746 253 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
TTC3-215ENST00000476784 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
TTC3-215ENST00000476784 KLRD1Q13241 179 aa5.68□□□□□ -1.5
TTC3-215ENST00000476784 BSXQ3C1V8 233 aa5.68□□□□□ -1.5
TTC3-215ENST00000476784 C11orf87Q6NUJ2 197 aa5.68□□□□□ -1.5
TTC3-215ENST00000476784 ZNF525Q8N782 197 aa5.68□□□□□ -1.5
TTC3-215ENST00000476784 LINC01465Q8N7H1 131 aa5.68□□□□□ -1.5
TTC3-215ENST00000476784 C18orf15Q96N68 181 aa5.68□□□□□ -1.5
TTC3-215ENST00000476784 NTN4Q9HB63 628 aa5.68□□□□□ -1.5
TTC3-215ENST00000476784 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa5.68□□□□□ -1.5
TTC3-215ENST00000476784 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
TTC3-215ENST00000476784 G6PC2Q9NQR9 355 aa5.68□□□□□ -1.5
TTC3-215ENST00000476784 NPIPB8E9PQR5 432 aa5.68□□□□□ -1.5
TTC3-215ENST00000476784 NPIPB9F8W1W9 429 aa5.68□□□□□ -1.5
TTC3-215ENST00000476784 NPIPB7O75200 414 aa5.68□□□□□ -1.5
TTC3-215ENST00000476784 SCTP09683 121 aa5.68□□□□□ -1.5
TTC3-215ENST00000476784 SEC11BP0C7V7 166 aa5.68□□□□□ -1.5
TTC3-215ENST00000476784 SPTBP11277 2137 aa5.68□□□□□ -1.5
TTC3-215ENST00000476784 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa5.68□□□□□ -1.5
TTC3-215ENST00000476784 LINC00305Q7Z4B0 112 aa5.68□□□□□ -1.5
TTC3-215ENST00000476784 C10orf35Q96D05 121 aa5.68□□□□□ -1.5
TTC3-215ENST00000476784 DLL3Q9NYJ7 618 aa5.68□□□□□ -1.5
TTC3-215ENST00000476784 JKAMPQ9P055 326 aa5.68□□□□□ -1.5
TTC3-215ENST00000476784 LTBP4Q8N2S1 1624 aa5.68□□□□□ -1.5
TTC3-215ENST00000476784 RICTORQ6R327 1708 aa5.68□□□□□ -1.5
TTC3-215ENST00000476784 TRAV20A0A0B4J274 112 aa5.68□□□□□ -1.5
TTC3-215ENST00000476784 UCP1P25874 307 aa5.68□□□□□ -1.5
TTC3-215ENST00000476784 RAE1P78406 368 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
TTC3-215ENST00000476784 RPL39P5Q59GN2 51 aa5.68□□□□□ -1.5
TTC3-215ENST00000476784 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa5.68□□□□□ -1.5
TTC3-215ENST00000476784 GRIFINA4D1Z8 144 aa5.68□□□□□ -1.5
TTC3-215ENST00000476784 FOXS1O43638 330 aa5.68□□□□□ -1.5
TTC3-215ENST00000476784 RAMP1O60894 148 aa5.68□□□□□ -1.5
TTC3-215ENST00000476784 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
TTC3-215ENST00000476784 MIC13Q5XKP0 118 aa5.68□□□□□ -1.5
TTC3-215ENST00000476784 M0R143 59 aa5.68□□□□□ -1.5
TTC3-215ENST00000476784 BCL2L11O43521 198 aa5.68□□□□□ -1.5
TTC3-215ENST00000476784 PAX1P15863 534 aa5.68□□□□□ -1.5
TTC3-215ENST00000476784 INSL4Q14641 139 aa5.68□□□□□ -1.5
TTC3-215ENST00000476784 C4orf48Q5BLP8 95 aa5.68□□□□□ -1.5
TTC3-215ENST00000476784 TEX38Q6PEX7 206 aa5.68□□□□□ -1.5
TTC3-215ENST00000476784 GATD1Q8NB37 220 aa5.68□□□□□ -1.5
TTC3-215ENST00000476784 CRYGNQ8WXF5 182 aa5.68□□□□□ -1.5
TTC3-215ENST00000476784 Q9HAA7 133 aa5.68□□□□□ -1.5
TTC3-215ENST00000476784 DTX4Q9Y2E6 619 aa5.68□□□□□ -1.5
TTC3-215ENST00000476784 FHITP49789 147 aa5.68□□□□□ -1.5
TTC3-215ENST00000476784 APOC4P55056 127 aa5.68□□□□□ -1.5
TTC3-215ENST00000476784 CR1LQ2VPA4 569 aa5.68□□□□□ -1.5
TTC3-215ENST00000476784 LYZL2Q7Z4W2 148 aa5.68□□□□□ -1.5
TTC3-215ENST00000476784 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP5.68□□□□□ -1.5
TTC3-215ENST00000476784 LRRC3BQ96PB8 259 aa5.68□□□□□ -1.5
TTC3-215ENST00000476784 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
TTC3-215ENST00000476784 PILRAQ9UKJ1 303 aa5.68□□□□□ -1.5
TTC3-215ENST00000476784 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
TTC3-215ENST00000476784 SMCHD1A6NHR9 2005 aa5.68□□□□□ -1.5
TTC3-215ENST00000476784 CLDN34H7C241 214 aa5.67□□□□□ -1.5
TTC3-215ENST00000476784 CTAG2O75638 210 aa5.67□□□□□ -1.5
TTC3-215ENST00000476784 MMP9P14780 707 aa5.67□□□□□ -1.5
TTC3-215ENST00000476784 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
TTC3-215ENST00000476784 NPC2P61916 151 aa5.67□□□□□ -1.5
TTC3-215ENST00000476784 RFLNBQ8N5W9 214 aa5.67□□□□□ -1.5
TTC3-215ENST00000476784 OR10S1Q8NGN2 331 aa5.67□□□□□ -1.5
TTC3-215ENST00000476784 ABHD1Q96SE0 405 aa5.67□□□□□ -1.5
TTC3-215ENST00000476784 GPHA2Q96T91 129 aa5.67□□□□□ -1.5
TTC3-215ENST00000476784 MMP26Q9NRE1 261 aa5.67□□□□□ -1.5
TTC3-215ENST00000476784 SDK2Q58EX2 2172 aa5.67□□□□□ -1.5
TTC3-215ENST00000476784 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa5.67□□□□□ -1.5
TTC3-215ENST00000476784 ERVH48-1M5A8F1 160 aa5.67□□□□□ -1.5
TTC3-215ENST00000476784 RFPL3SP0C7P2 107 aa5.67□□□□□ -1.5
TTC3-215ENST00000476784 ZNF883P0CG24 379 aa5.67□□□□□ -1.5
TTC3-215ENST00000476784 HOXA5P20719 270 aa5.67□□□□□ -1.5
TTC3-215ENST00000476784 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
TTC3-215ENST00000476784 TCF15Q12870 199 aa5.67□□□□□ -1.5
TTC3-215ENST00000476784 DUSP21Q9H596 190 aa5.67□□□□□ -1.5
TTC3-215ENST00000476784 CCL3L1P16619 93 aa5.67□□□□□ -1.5
TTC3-215ENST00000476784 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
TTC3-215ENST00000476784 WFIKKN1Q96NZ8 548 aa5.67□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.8 ms