RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472032.1

BBX-222, Transcript of BBX, HMG-box containing, human

TSL 4

Gene BBX, Length 549 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBX-222	ENST00000472032	HSBP1L1	C9JCN9	74 aa		3.39	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	C17orf112	F2Z3M2	114 aa		3.39	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	ANKHD1-EIF4EBP3	H7C0V5	636 aa	Predicted RBP	3.39	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	SIRPB1	O00241	398 aa		3.39	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	SH2D1B	O14796	132 aa		3.39	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	HMGB3	O15347	200 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	CIDEA	O60543	219 aa		3.39	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	ZNF324	O75467	553 aa	Predicted RBP	3.39	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	WISP2	O76076	250 aa		3.39	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	S1PR2	O95136	353 aa		3.39	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	NDUFB4	O95168	129 aa		3.39	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	CLDN1	O95832	211 aa		3.39	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	CA2	P00918	260 aa		3.39	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	IGHE	P01854	428 aa		3.39	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	CRYAA	P02489	173 aa		3.39	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	C3orf79	P0CE67	100 aa		3.39	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	CD38	P28907	300 aa		3.39	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	SRD5A2	P31213	254 aa		3.39	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	AMT	P48728	403 aa		3.39	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	PRRX1	P54821	245 aa		3.39	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	GFER	P55789	205 aa		3.39	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	SUMO2	P61956	95 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	RPL19	P84098	196 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	ZNF90	Q03938	601 aa		3.39	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	TFF3	Q07654	80 aa		3.39	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	PSG7	Q13046	419 aa		3.39	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	IL11RA	Q14626	422 aa		3.39	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	PMCHL1	Q16048	86 aa		3.39	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	IZUMO4	Q1ZYL8	232 aa		3.39	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	RSPO4	Q2I0M5	234 aa	Predicted RBP	3.39	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	RNF151	Q2KHN1	245 aa		3.39	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	ZNF585B	Q52M93	769 aa		3.39	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	OCIAD2	Q56VL3	154 aa		3.39	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	LRRC10	Q5BKY1	277 aa		3.39	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	SPANXN5	Q5MJ07	72 aa		3.39	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	DCAF12	Q5T6F0	453 aa		3.39	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	FAM27B	Q5VT28	67 aa		3.39	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	WDR74	Q6RFH5	385 aa	Predicted RBP	3.39	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	MOB1B	Q7L9L4	216 aa		3.39	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	TIPARP	Q7Z3E1	657 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	NIT1	Q86X76	327 aa		3.39	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	MUC15	Q8N387	334 aa		3.39	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032		Q8N7P7	452 aa		3.39	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	C12orf76	Q8N812	135 aa	Predicted RBP	3.39	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	ZNF611	Q8N823	705 aa		3.39	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	NFAM1	Q8NET5	270 aa	Predicted RBP	3.39	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	OR5T1	Q8NG75	326 aa		3.39	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	OR4F17	Q8NGA8	305 aa		3.39	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	OR1K1	Q8NGR3	316 aa		3.39	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	OR51H1	Q8NH63	302 aa		3.39	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	OR1F12	Q8NHA8	337 aa		3.39	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	APOBEC3D	Q96AK3	386 aa	Predicted RBP	3.39	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	CLDN23	Q96B33	292 aa		3.39	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	SMIM12	Q96EX1	92 aa		3.39	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	DERL1	Q9BUN8	251 aa		3.39	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	LRRC61	Q9BV99	259 aa		3.39	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	NPCDR1	Q9BY65	106 aa		3.39	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	PLA2G2F	Q9BZM2	168 aa		3.39	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	MTIF3	Q9H2K0	278 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	CST9L	Q9H4G1	147 aa		3.39	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	HES4	Q9HCC6	221 aa		3.39	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	TUBG2	Q9NRH3	451 aa		3.39	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	DOCK7	Q96N67	2140 aa		3.38	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	UTRN	P46939	3433 aa		3.38	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	TRAV9-2	A0A087WT02	112 aa		3.38	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	LOC102723996	A0A087X1L8	192 aa		3.38	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	SPTY2D1-AS1	A0A0U1RR47	76 aa		3.38	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	MBD3L2B	A0A1B0GVZ6	204 aa	Predicted RBP	3.38	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032		A0A1B0GX78	115 aa		3.38	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	SCO2	A0A1W2PP80	73 aa		3.38	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032		A0A1W2PRS3	328 aa		3.38	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032		A0A1W2PRX2	142 aa		3.38	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032		A0A1W2PS18	150 aa		3.38	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032		A4D1N5	150 aa		3.38	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	DPRX	A6NFQ7	191 aa		3.38	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	NPIPB5	A8MRT5	1133 aa		3.38	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	SNURFL	B1AK76	121 aa		3.38	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	C5orf67	F2Z3F1	127 aa		3.38	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032		J3QR06	171 aa		3.38	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032		M0QZ24	198 aa		3.38	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	FCN1	O00602	326 aa		3.38	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	RAMP3	O60896	148 aa		3.38	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	VAMP5	O95183	116 aa		3.38	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	IGLV2-14	P01704	120 aa		3.38	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	HLA-DQA1	P01909	254 aa		3.38	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	OR10J4	P0C629	311 aa		3.38	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	PMCH	P20382	165 aa		3.38	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	BCL3	P20749	454 aa		3.38	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	PLA2G5	P39877	138 aa		3.38	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	GATA4	P43694	442 aa		3.38	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	IER3	P46695	156 aa		3.38	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	HINT1	P49773	126 aa	Predicted RBP	3.38	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	ZNF83	P51522	516 aa		3.38	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	FOXL2	P58012	376 aa		3.38	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	MLF1	P58340	268 aa		3.38	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	ARF6	P62330	175 aa		3.38	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	PMP22	Q01453	160 aa		3.38	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	TGFBR3	Q03167	851 aa		3.38	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	TFF2	Q03403	129 aa		3.38	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	C1orf61	Q13536	156 aa		3.38	□□□□□ -1.87

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