RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466618.1

SNED1-208, Transcript of sushi, nidogen and EGF like domains 1, human

TSL 5

Gene SNED1, Length 2,198 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNED1-208	ENST00000466618	MMD	Q15546	238 aa		12.84	□□□□□ -0.35
SNED1-208	ENST00000466618	LEMD1	Q68G75	181 aa		12.84	□□□□□ -0.35
SNED1-208	ENST00000466618	TCF23	Q7RTU1	214 aa		12.84	□□□□□ -0.35
SNED1-208	ENST00000466618	STPG4	Q8N801	248 aa		12.84	□□□□□ -0.35
SNED1-208	ENST00000466618	OR2AE1	Q8NHA4	323 aa		12.84	□□□□□ -0.35
SNED1-208	ENST00000466618	VN1R17P	Q8TDU5	208 aa		12.84	□□□□□ -0.35
SNED1-208	ENST00000466618	ZNF799	Q96GE5	643 aa		12.84	□□□□□ -0.35
SNED1-208	ENST00000466618	C20orf202	A1L168	122 aa		12.84	□□□□□ -0.35
SNED1-208	ENST00000466618	CELA3B	P08861	270 aa		12.84	□□□□□ -0.35
SNED1-208	ENST00000466618	ESD	P10768	282 aa		12.84	□□□□□ -0.35
SNED1-208	ENST00000466618	MALL	Q13021	153 aa		12.84	□□□□□ -0.35
SNED1-208	ENST00000466618		Q6ZRM9	215 aa		12.84	□□□□□ -0.35
SNED1-208	ENST00000466618	OR5T1	Q8NG75	326 aa		12.84	□□□□□ -0.35
SNED1-208	ENST00000466618	LINC01560	Q8TB33	94 aa		12.84	□□□□□ -0.35
SNED1-208	ENST00000466618	POM121L2	Q96KW2	1035 aa		12.84	□□□□□ -0.35
SNED1-208	ENST00000466618	HSPB9	Q9BQS6	159 aa		12.84	□□□□□ -0.35
SNED1-208	ENST00000466618	PARD6G	Q9BYG4	376 aa	Predicted RBP	12.84	□□□□□ -0.35
SNED1-208	ENST00000466618	ZNF442	Q9H7R0	627 aa		12.84	□□□□□ -0.35
SNED1-208	ENST00000466618	HELZ2	Q9BYK8	2649 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
SNED1-208	ENST00000466618	IGHV1-18	A0A0C4DH31	117 aa		12.83	□□□□□ -0.36
SNED1-208	ENST00000466618	NPPC	P23582	126 aa		12.83	□□□□□ -0.36
SNED1-208	ENST00000466618	PLP2	Q04941	152 aa		12.83	□□□□□ -0.36
SNED1-208	ENST00000466618	CNN3	Q15417	329 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
SNED1-208	ENST00000466618	OR4C12	Q96R67	309 aa		12.83	□□□□□ -0.36
SNED1-208	ENST00000466618	SLC25A22	Q9H936	323 aa		12.83	□□□□□ -0.36
SNED1-208	ENST00000466618	HS3ST1	O14792	307 aa		12.83	□□□□□ -0.36
SNED1-208	ENST00000466618	CECR9	P0C854	216 aa		12.83	□□□□□ -0.36
SNED1-208	ENST00000466618	ACSM6	Q6P461	480 aa		12.83	□□□□□ -0.36
SNED1-208	ENST00000466618	TAF15	Q92804	592 aa	Known RBP eCLIP	12.83	□□□□□ -0.36
SNED1-208	ENST00000466618	BORCS8	Q96FH0	119 aa		12.83	□□□□□ -0.36
SNED1-208	ENST00000466618	CIB3	Q96Q77	187 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
SNED1-208	ENST00000466618	PSENEN	Q9NZ42	101 aa		12.83	□□□□□ -0.36
SNED1-208	ENST00000466618	IL36G	Q9NZH8	169 aa		12.83	□□□□□ -0.36
SNED1-208	ENST00000466618	RNF114	Q9Y508	228 aa		12.83	□□□□□ -0.36
SNED1-208	ENST00000466618		K7EP13	123 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SNED1-208	ENST00000466618	TUSC2	O75896	110 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SNED1-208	ENST00000466618	SCT	P09683	121 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SNED1-208	ENST00000466618	SLC25A6	P12236	298 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SNED1-208	ENST00000466618	CTRL	P40313	264 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SNED1-208	ENST00000466618	RBM11	P57052	281 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
SNED1-208	ENST00000466618	BPIFB3	P59826	476 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SNED1-208	ENST00000466618	YPEL3	P61236	119 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
SNED1-208	ENST00000466618		Q6ZS49	121 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SNED1-208	ENST00000466618	LHFPL2	Q6ZUX7	228 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SNED1-208	ENST00000466618	LINC01551	Q86U37	167 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SNED1-208	ENST00000466618		Q8N976	141 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SNED1-208	ENST00000466618	ORAOV1	Q8WV07	137 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SNED1-208	ENST00000466618	LRRK2	Q5S007	2527 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SNED1-208	ENST00000466618	SYNGR2	O43760	224 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SNED1-208	ENST00000466618	PGLYRP1	O75594	196 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
SNED1-208	ENST00000466618	ZNF83	P51522	516 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SNED1-208	ENST00000466618	PTTG1IP	P53801	180 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SNED1-208	ENST00000466618	KLF3	P57682	345 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
SNED1-208	ENST00000466618	WFDC8	Q8IUA0	241 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SNED1-208	ENST00000466618	OR10V1	Q8NGI7	309 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SNED1-208	ENST00000466618	NEIL1	Q96FI4	390 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
SNED1-208	ENST00000466618	CTXND1	A0A1B0GTU2	59 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SNED1-208	ENST00000466618	UBE2L5P	A0A1B0GUS4	154 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SNED1-208	ENST00000466618	SERF1A	O75920	110 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SNED1-208	ENST00000466618	OR5G3	P0C626	314 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SNED1-208	ENST00000466618	CCL2	P13500	99 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SNED1-208	ENST00000466618	CD99	P14209	185 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SNED1-208	ENST00000466618	FOXL1	Q12952	345 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SNED1-208	ENST00000466618	BTF3L4	Q96K17	158 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SNED1-208	ENST00000466618	PATZ1	Q9HBE1	687 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
SNED1-208	ENST00000466618	SLC45A2	Q9UMX9	530 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SNED1-208	ENST00000466618	C5orf49	A4QMS7	147 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SNED1-208	ENST00000466618	CLDN1	O95832	211 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SNED1-208	ENST00000466618	HBG1	P69891	147 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SNED1-208	ENST00000466618	HBG2	P69892	147 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SNED1-208	ENST00000466618	BATF2	Q8N1L9	274 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SNED1-208	ENST00000466618	SPTSSA	Q969W0	71 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SNED1-208	ENST00000466618	TECTB	Q96PL2	329 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SNED1-208	ENST00000466618	CRIM1	Q9NZV1	1036 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SNED1-208	ENST00000466618	WIPI2	Q9Y4P8	454 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SNED1-208	ENST00000466618	TIMM9	Q9Y5J7	89 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SNED1-208	ENST00000466618	IGKV1-6	A0A0C4DH72	117 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SNED1-208	ENST00000466618	DPRX	A6NFQ7	191 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SNED1-208	ENST00000466618		M0R1B8	84 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SNED1-208	ENST00000466618	PAGE4	O60829	102 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SNED1-208	ENST00000466618	OR7C1	O76099	320 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
SNED1-208	ENST00000466618	F2R	P25116	425 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SNED1-208	ENST00000466618	CD40	P25942	277 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SNED1-208	ENST00000466618	MSMO1	Q15800	293 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SNED1-208	ENST00000466618	COLCA1	Q6ZS62	124 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SNED1-208	ENST00000466618	OR4B1	Q8NGF8	309 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SNED1-208	ENST00000466618	CACNG5	Q9UF02	275 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SNED1-208	ENST00000466618	FBXL7	Q9UJT9	491 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SNED1-208	ENST00000466618	HCFC1	P51610	2035 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SNED1-208	ENST00000466618	LOC105371242	A0A075B767	164 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SNED1-208	ENST00000466618	TRAV39	A0A0B4J263	110 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SNED1-208	ENST00000466618	IGKV1-39	P01597	117 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SNED1-208	ENST00000466618	IGKV1D-39	P04432	117 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SNED1-208	ENST00000466618	PSG2	P11465	335 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SNED1-208	ENST00000466618	TBC1D28	Q2M2D7	210 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SNED1-208	ENST00000466618	TMEM42	Q69YG0	159 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SNED1-208	ENST00000466618	ETFRF1	Q6IPR1	90 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SNED1-208	ENST00000466618	TMEM108	Q6UXF1	575 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SNED1-208	ENST00000466618	OR5AU1	Q8NGC0	362 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SNED1-208	ENST00000466618	OR1L6	Q8NGR2	347 aa		12.79	□□□□□ -0.36

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