RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462712.5

NABP1-208, Transcript of nucleic acid binding protein 1, human

TSL 2

Gene NABP1, Length 961 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NABP1-208	ENST00000462712	TMED4	Q7Z7H5	227 aa		13.77	□□□□□ -0.21
NABP1-208	ENST00000462712	SGPP2	Q8IWX5	399 aa		13.77	□□□□□ -0.21
NABP1-208	ENST00000462712	ADAD2	Q8NCV1	583 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
NABP1-208	ENST00000462712	GRPEL2	Q8TAA5	225 aa		13.77	□□□□□ -0.21
NABP1-208	ENST00000462712	WIPF2	Q8TF74	440 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
NABP1-208	ENST00000462712	ZNF430	Q9H8G1	570 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
NABP1-208	ENST00000462712	BET1L	Q9NYM9	111 aa		13.77	□□□□□ -0.21
NABP1-208	ENST00000462712	WSB1	Q9Y6I7	421 aa		13.77	□□□□□ -0.21
NABP1-208	ENST00000462712	TRAV41	A0A0B4J266	112 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NABP1-208	ENST00000462712	MARCH11	A6NNE9	402 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NABP1-208	ENST00000462712	ARPC1B	O15143	372 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
NABP1-208	ENST00000462712	FBXO24	O75426	580 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NABP1-208	ENST00000462712	UPK1B	O75841	260 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NABP1-208	ENST00000462712	NDUFB6	O95139	128 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NABP1-208	ENST00000462712	KRAS	P01116	189 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NABP1-208	ENST00000462712	AKR1C4	P17516	323 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NABP1-208	ENST00000462712	MRGPRG-AS1	Q2M3A8	158 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NABP1-208	ENST00000462712	TRIM16L	Q309B1	348 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NABP1-208	ENST00000462712	ZNF329	Q86UD4	541 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NABP1-208	ENST00000462712	CITED1	Q99966	193 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NABP1-208	ENST00000462712	TMEM140	Q9NV12	185 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NABP1-208	ENST00000462712	KCNIP3	Q9Y2W7	256 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NABP1-208	ENST00000462712	ATG12	O94817	140 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NABP1-208	ENST00000462712	OR5AC1	P0C628	307 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NABP1-208	ENST00000462712	EGR2	P11161	476 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
NABP1-208	ENST00000462712	UCP1	P25874	307 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NABP1-208	ENST00000462712	MAS1L	P35410	378 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NABP1-208	ENST00000462712	G6PC	P35575	357 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NABP1-208	ENST00000462712	DHODH	Q02127	395 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NABP1-208	ENST00000462712	TMEM267	Q0VDI3	215 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
NABP1-208	ENST00000462712	ECSCR	Q19T08	205 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NABP1-208	ENST00000462712	C11orf44	Q8N8P7	122 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NABP1-208	ENST00000462712	OR4X2	Q8NGF9	303 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NABP1-208	ENST00000462712	SGMS2	Q8NHU3	365 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NABP1-208	ENST00000462712	TMEM230	Q96A57	120 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NABP1-208	ENST00000462712	FAM103A1	Q9BTL3	118 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
NABP1-208	ENST00000462712	FBXO7	Q9Y3I1	522 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NABP1-208	ENST00000462712		G3V318	75 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NABP1-208	ENST00000462712	UPK2	O00526	184 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NABP1-208	ENST00000462712	SNAPC5	O75971	98 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NABP1-208	ENST00000462712	CD28	P10747	220 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NABP1-208	ENST00000462712	BTC	P35070	178 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NABP1-208	ENST00000462712	CRIP2	P52943	208 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
NABP1-208	ENST00000462712	RPL8	P62917	257 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
NABP1-208	ENST00000462712	SSBP2	P81877	361 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
NABP1-208	ENST00000462712	MZT2B	Q6NZ67	158 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NABP1-208	ENST00000462712	UNQ5815/PRO19632	Q6UWF5	114 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NABP1-208	ENST00000462712	C10orf99	Q6UWK7	81 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NABP1-208	ENST00000462712	H2BFWT	Q7Z2G1	175 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NABP1-208	ENST00000462712	CADM3	Q8N126	398 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NABP1-208	ENST00000462712	CENPS	Q8N2Z9	138 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NABP1-208	ENST00000462712	COMMD1	Q8N668	190 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NABP1-208	ENST00000462712	TMEM222	Q9H0R3	208 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NABP1-208	ENST00000462712	NUBP2	Q9Y5Y2	271 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NABP1-208	ENST00000462712	IGKV1-39	P01597	117 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NABP1-208	ENST00000462712	IGKV1D-39	P04432	117 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NABP1-208	ENST00000462712	IL6R	P08887	468 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
NABP1-208	ENST00000462712	ANXA3	P12429	323 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NABP1-208	ENST00000462712	HLA-G	P17693	338 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NABP1-208	ENST00000462712	TEX38	Q6PEX7	206 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NABP1-208	ENST00000462712	LFNG	Q8NES3	379 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NABP1-208	ENST00000462712	GLYATL2	Q8WU03	294 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NABP1-208	ENST00000462712	SRSF12	Q8WXF0	261 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
NABP1-208	ENST00000462712	GALNT14	Q96FL9	552 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NABP1-208	ENST00000462712	SEC22A	Q96IW7	307 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NABP1-208	ENST00000462712	PHB2	Q99623	299 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NABP1-208	ENST00000462712	TRAV3	A0A0B4J244	114 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NABP1-208	ENST00000462712	TCRBV4S1A1T	A0A5B7	111 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NABP1-208	ENST00000462712	MSGN1	A6NI15	193 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NABP1-208	ENST00000462712	RPL27A	P46776	148 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
NABP1-208	ENST00000462712	AKR1C2	P52895	323 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NABP1-208	ENST00000462712	CFHR3	Q02985	330 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NABP1-208	ENST00000462712	ASAH1	Q13510	395 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NABP1-208	ENST00000462712	AKIRIN2	Q53H80	203 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NABP1-208	ENST00000462712	TMEM128	Q5BJH2	165 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NABP1-208	ENST00000462712	C19orf54	Q5BKX5	351 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NABP1-208	ENST00000462712	ZNF695	Q8IW36	515 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NABP1-208	ENST00000462712	TSC22D3	Q99576	134 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NABP1-208	ENST00000462712	SPIN2A	Q99865	258 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NABP1-208	ENST00000462712	SPIN2B	Q9BPZ2	258 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NABP1-208	ENST00000462712	TBC1D24	Q9ULP9	559 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NABP1-208	ENST00000462712	FOXA2	Q9Y261	457 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
NABP1-208	ENST00000462712	STAB1	Q9NY15	2570 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NABP1-208	ENST00000462712		A0A1W2PN81	502 aa		13.71	□□□□□ -0.21
NABP1-208	ENST00000462712	PLXNB1	O43157	2135 aa		13.71	□□□□□ -0.21
NABP1-208	ENST00000462712	CDS2	O95674	445 aa		13.71	□□□□□ -0.21
NABP1-208	ENST00000462712	IGHG4	P01861	327 aa		13.71	□□□□□ -0.21
NABP1-208	ENST00000462712	OPN1MW	P04001	364 aa		13.71	□□□□□ -0.21
NABP1-208	ENST00000462712	FGF2	P09038	288 aa		13.71	□□□□□ -0.21
NABP1-208	ENST00000462712	OPN1MW2	P0DN77	364 aa		13.71	□□□□□ -0.21
NABP1-208	ENST00000462712	OPN1MW3	P0DN78	364 aa		13.71	□□□□□ -0.21
NABP1-208	ENST00000462712	VAMP1	P23763	118 aa		13.71	□□□□□ -0.21
NABP1-208	ENST00000462712	PPIF	P30405	207 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
NABP1-208	ENST00000462712	SLC6A1	P30531	599 aa		13.71	□□□□□ -0.21
NABP1-208	ENST00000462712	CHRNA7	P36544	502 aa		13.71	□□□□□ -0.21
NABP1-208	ENST00000462712	SUPT4H1	P63272	117 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
NABP1-208	ENST00000462712	CD83	Q01151	205 aa		13.71	□□□□□ -0.21
NABP1-208	ENST00000462712	FOXE3	Q13461	319 aa		13.71	□□□□□ -0.21
NABP1-208	ENST00000462712	TMEM187	Q14656	261 aa		13.71	□□□□□ -0.21
NABP1-208	ENST00000462712	C10orf55	Q5SWW7	151 aa		13.71	□□□□□ -0.21

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.9 ms