RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461017.1

RABGEF1-206, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene RABGEF1, Length 711 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP5.41□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa5.41□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 GON7Q9BXV9 100 aa5.41□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP5.41□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 EXTL2Q9UBQ6 330 aa5.41□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 SCOCQ9UIL1 159 aa5.41□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 ADAM30Q9UKF2 790 aa5.41□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 VSIG4Q9Y279 399 aa5.41□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP5.41□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 TEX22C9J3V5 150 aa5.4□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 H3BMQ9 156 aa5.4□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP5.4□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 SLC22A5O76082 557 aa5.4□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 S1PR2O95136 353 aa5.4□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 CNIH1O95406 144 aa5.4□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 IGKV1-39P01597 117 aa5.4□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 TRBV12-3P01733 135 aa5.4□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 IGKV1D-39P04432 117 aa5.4□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 RPA2P15927 270 aa5.4□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 RPL5P46777 297 aaKnown RBP5.4□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 RAB25P57735 213 aa5.4□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 DGCR2P98153 550 aa5.4□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 RUNX1Q01196 453 aa5.4□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF45Q02386 682 aa5.4□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 TNXAQ16473 311 aa5.4□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 VMA21Q3ZAQ7 101 aa5.4□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 AADACL3Q5VUY0 350 aa5.4□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF66Q6ZN08 573 aa5.4□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 SPAG16Q8N0X2 631 aa5.4□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 OR1N2Q8NGR9 330 aa5.4□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 OR5H2Q8NGV7 314 aa5.4□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 OR51H1Q8NH63 302 aa5.4□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP5.4□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP5.4□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 DCUN1D4Q92564 292 aa5.4□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP5.4□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 MRGPRFQ96AM1 343 aa5.4□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 ISOC1Q96CN7 298 aa5.4□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP5.4□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP5.4□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 SOSTQ9BQB4 213 aa5.4□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP5.4□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP5.4□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa5.39□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 OR2A4O95047 310 aa5.39□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 TRGV3P03979 118 aa5.39□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 CD3DP04234 171 aa5.39□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 OR9G9P0C7N8 305 aa5.39□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF735P0CB33 412 aa5.39□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 TMBIM6P55061 237 aa5.39□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 TPPP2P59282 170 aa5.39□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa5.39□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 MSMO1Q15800 293 aa5.39□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 PHLDA2Q53GA4 152 aa5.39□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 FAAP20Q6NZ36 180 aa5.39□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 TMEM65Q6PI78 240 aa5.39□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 LHFPL1Q86WI0 220 aa5.39□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 ZBTB34Q8NCN2 500 aa5.39□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 OR5M8Q8NGP6 311 aa5.39□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 OR4S2Q8NH73 311 aa5.39□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa5.39□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 RAB2BQ8WUD1 216 aa5.39□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 FCAMRQ8WWV6 532 aa5.39□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 OR2A7Q96R45 310 aa5.39□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 SCPEP1Q9HB40 452 aa5.39□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 MTFP1Q9UDX5 166 aa5.39□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa5.39□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa5.38□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 ANKRD34BA5PLL1 514 aa5.38□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 DBX1A6NMT0 343 aa5.38□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 UPK2O00526 184 aa5.38□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 RGS5O15539 181 aa5.38□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 KBTBD11O94819 623 aa5.38□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 HPRT1P00492 218 aa5.38□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 RLN1P04808 185 aa5.38□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 REG1AP05451 166 aa5.38□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP5.38□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 AREGP15514 252 aa5.38□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 PI3P19957 117 aa5.38□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 SLC6A1P30531 599 aa5.38□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 RCVRNP35243 200 aa5.38□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 LPAR6P43657 344 aa5.38□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 HERV-K104P61576 105 aa5.38□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF616Q08AN1 781 aa5.38□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 CBX3Q13185 183 aa5.38□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 POU2AF1Q16633 256 aa5.38□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 VAX1Q5SQQ9 334 aa5.38□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 OR4A47Q6IF82 309 aa5.38□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 REC114Q7Z4M0 266 aa5.38□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 HAPLN4Q86UW8 402 aa5.38□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 MMD2Q8IY49 270 aa5.38□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 TTC9CQ8N5M4 171 aa5.38□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa5.38□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 POC5Q8NA72 575 aa5.38□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 OR6F1Q8NGZ6 308 aa5.38□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 MRAPQ8TCY5 172 aa5.38□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 FANCD2OSQ96PS1 177 aa5.38□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.7 ms