RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438888.5

PRAME-208, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 4

Gene PRAME, Length 566 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-208ENST00000438888 TMEM187Q14656 261 aa9.87□□□□□ -0.83
PRAME-208ENST00000438888 ANKRD55Q3KP44 614 aa9.87□□□□□ -0.83
PRAME-208ENST00000438888 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa9.87□□□□□ -0.83
PRAME-208ENST00000438888 PDPNQ86YL7 162 aa9.87□□□□□ -0.83
PRAME-208ENST00000438888 OR5AU1Q8NGC0 362 aa9.87□□□□□ -0.83
PRAME-208ENST00000438888 OR4S2Q8NH73 311 aa9.87□□□□□ -0.83
PRAME-208ENST00000438888 COQ8AQ8NI60 647 aa9.87□□□□□ -0.83
PRAME-208ENST00000438888 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
PRAME-208ENST00000438888 GLYATL2Q8WU03 294 aa9.87□□□□□ -0.83
PRAME-208ENST00000438888 MITD1Q8WV92 249 aa9.87□□□□□ -0.83
PRAME-208ENST00000438888 PHB2Q99623 299 aa9.87□□□□□ -0.83
PRAME-208ENST00000438888 OR51J1Q9H342 316 aa9.87□□□□□ -0.83
PRAME-208ENST00000438888 PRR13Q9NZ81 148 aa9.87□□□□□ -0.83
PRAME-208ENST00000438888 WASHC3Q9Y3C0 194 aa9.87□□□□□ -0.83
PRAME-208ENST00000438888 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa9.86□□□□□ -0.83
PRAME-208ENST00000438888 A0A0B4J2A0 478 aa9.86□□□□□ -0.83
PRAME-208ENST00000438888 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
PRAME-208ENST00000438888 RAMP3O60896 148 aa9.86□□□□□ -0.83
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PRAME-208ENST00000438888 CD1BP29016 333 aa9.86□□□□□ -0.83
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PRAME-208ENST00000438888 LPAR6P43657 344 aa9.86□□□□□ -0.83
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PRAME-208ENST00000438888 ZNF585BQ52M93 769 aa9.86□□□□□ -0.83
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PRAME-208ENST00000438888 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
PRAME-208ENST00000438888 SHPKQ9UHJ6 478 aa9.86□□□□□ -0.83
PRAME-208ENST00000438888 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa9.85□□□□□ -0.83
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PRAME-208ENST00000438888 CDS2O95674 445 aa9.85□□□□□ -0.83
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PRAME-208ENST00000438888 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
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PRAME-208ENST00000438888 PLEKHA2Q9HB19 425 aa9.85□□□□□ -0.83
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PRAME-208ENST00000438888 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa9.85□□□□□ -0.83
PRAME-208ENST00000438888 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa9.84□□□□□ -0.83
PRAME-208ENST00000438888 A0A1B0GVG6 124 aa9.84□□□□□ -0.83
PRAME-208ENST00000438888 K7EIL1 84 aa9.84□□□□□ -0.83
PRAME-208ENST00000438888 ATG12O94817 140 aa9.84□□□□□ -0.83
PRAME-208ENST00000438888 IGKV1-16P04430 117 aa9.84□□□□□ -0.83
PRAME-208ENST00000438888 CD83Q01151 205 aa9.84□□□□□ -0.83
PRAME-208ENST00000438888 TMEM177Q53S58 311 aa9.84□□□□□ -0.83
PRAME-208ENST00000438888 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa9.84□□□□□ -0.83
PRAME-208ENST00000438888 C9orf152Q5JTZ5 239 aa9.84□□□□□ -0.83
PRAME-208ENST00000438888 C11orf87Q6NUJ2 197 aa9.84□□□□□ -0.83
PRAME-208ENST00000438888 C10orf99Q6UWK7 81 aa9.84□□□□□ -0.83
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PRAME-208ENST00000438888 SLC25A33Q9BSK2 321 aa9.84□□□□□ -0.83
PRAME-208ENST00000438888 MED28Q9H204 178 aa9.84□□□□□ -0.83
PRAME-208ENST00000438888 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa9.83□□□□□ -0.84
PRAME-208ENST00000438888 DBX1A6NMT0 343 aa9.83□□□□□ -0.84
PRAME-208ENST00000438888 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa9.83□□□□□ -0.84
PRAME-208ENST00000438888 SHOXO15266 292 aa9.83□□□□□ -0.84
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PRAME-208ENST00000438888 IGKV1-33P01594 117 aa9.83□□□□□ -0.84
PRAME-208ENST00000438888 IGKV1-39P01597 117 aa9.83□□□□□ -0.84
PRAME-208ENST00000438888 IGKV1D-39P04432 117 aa9.83□□□□□ -0.84
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PRAME-208ENST00000438888 DEFB121Q5J5C9 76 aa9.83□□□□□ -0.84
PRAME-208ENST00000438888 SLC35G3Q8N808 338 aa9.83□□□□□ -0.84
PRAME-208ENST00000438888 OR2T10Q8NGZ9 312 aa9.83□□□□□ -0.84
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PRAME-208ENST00000438888 HARBI1Q96MB7 349 aa9.83□□□□□ -0.84
PRAME-208ENST00000438888 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
PRAME-208ENST00000438888 MARCH11A6NNE9 402 aa9.82□□□□□ -0.84
PRAME-208ENST00000438888 MOSP00540 346 aa9.82□□□□□ -0.84
PRAME-208ENST00000438888 KRASP01116 189 aa9.82□□□□□ -0.84
PRAME-208ENST00000438888 HOXB5P09067 269 aa9.82□□□□□ -0.84
PRAME-208ENST00000438888 FAM106CPP0CH98 169 aa9.82□□□□□ -0.84
PRAME-208ENST00000438888 VDAC1P21796 283 aa9.82□□□□□ -0.84
PRAME-208ENST00000438888 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
PRAME-208ENST00000438888 G6PCP35575 357 aa9.82□□□□□ -0.84
PRAME-208ENST00000438888 AKR1C2P52895 323 aa9.82□□□□□ -0.84
PRAME-208ENST00000438888 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
PRAME-208ENST00000438888 EBI3Q14213 229 aa9.82□□□□□ -0.84
PRAME-208ENST00000438888 HES1Q14469 280 aa9.82□□□□□ -0.84
PRAME-208ENST00000438888 LYZL2Q7Z4W2 148 aa9.82□□□□□ -0.84
PRAME-208ENST00000438888 THNSL2Q86YJ6 484 aa9.82□□□□□ -0.84
PRAME-208ENST00000438888 WFDC9Q8NEX5 89 aa9.82□□□□□ -0.84
PRAME-208ENST00000438888 OR4X2Q8NGF9 303 aa9.82□□□□□ -0.84
PRAME-208ENST00000438888 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
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