RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424089.5

POLR1A-204, Transcript of RNA polymerase I subunit A, humanhuman

TSL 3

Gene POLR1A, Length 576 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1A-204ENST00000424089 DTD1Q8TEA8 209 aa8.24□□□□□ -1.09
POLR1A-204ENST00000424089 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
POLR1A-204ENST00000424089 SH3BGRL3Q9H299 93 aa8.24□□□□□ -1.09
POLR1A-204ENST00000424089 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
POLR1A-204ENST00000424089 KPTNQ9Y664 436 aa8.24□□□□□ -1.09
POLR1A-204ENST00000424089 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa8.23□□□□□ -1.09
POLR1A-204ENST00000424089 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa8.23□□□□□ -1.09
POLR1A-204ENST00000424089 A0A1W2PPR1 153 aa8.23□□□□□ -1.09
POLR1A-204ENST00000424089 CEBPZOSA8MTT3 80 aa8.23□□□□□ -1.09
POLR1A-204ENST00000424089 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
POLR1A-204ENST00000424089 NXPH3O95157 252 aa8.23□□□□□ -1.09
POLR1A-204ENST00000424089 H2AFB1P0C5Y9 115 aa8.23□□□□□ -1.09
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POLR1A-204ENST00000424089 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
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POLR1A-204ENST00000424089 OR2B11Q5JQS5 317 aa8.23□□□□□ -1.09
POLR1A-204ENST00000424089 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
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POLR1A-204ENST00000424089 METTL15P1P0C7V9 234 aa8.22□□□□□ -1.09
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POLR1A-204ENST00000424089 NFYBP25208 207 aa8.22□□□□□ -1.09
POLR1A-204ENST00000424089 SLC38A11Q08AI6 406 aa8.22□□□□□ -1.09
POLR1A-204ENST00000424089 PMS2P11Q13670 270 aa8.22□□□□□ -1.09
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POLR1A-204ENST00000424089 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
POLR1A-204ENST00000424089 RPL39P5Q59GN2 51 aa8.22□□□□□ -1.09
POLR1A-204ENST00000424089 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa8.22□□□□□ -1.09
POLR1A-204ENST00000424089 THNSL2Q86YJ6 484 aa8.22□□□□□ -1.09
POLR1A-204ENST00000424089 LYG1Q8N1E2 194 aa8.22□□□□□ -1.09
POLR1A-204ENST00000424089 LINC00311Q8N616 119 aa8.22□□□□□ -1.09
POLR1A-204ENST00000424089 ZNF596Q8TC21 504 aa8.22□□□□□ -1.09
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POLR1A-204ENST00000424089 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
POLR1A-204ENST00000424089 KIAA1456Q9P272 454 aa8.22□□□□□ -1.09
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POLR1A-204ENST00000424089 SCO1O75880 301 aa8.21□□□□□ -1.1
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POLR1A-204ENST00000424089 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa8.21□□□□□ -1.1
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POLR1A-204ENST00000424089 ZANQ9Y493 2812 aa8.2□□□□□ -1.1
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POLR1A-204ENST00000424089 AKR1C1Q04828 323 aa8.2□□□□□ -1.1
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POLR1A-204ENST00000424089 TMEM41BQ5BJD5 291 aa8.2□□□□□ -1.1
POLR1A-204ENST00000424089 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
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POLR1A-204ENST00000424089 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
POLR1A-204ENST00000424089 RHOVQ96L33 236 aa8.2□□□□□ -1.1
POLR1A-204ENST00000424089 SCRT1Q9BWW7 348 aa8.2□□□□□ -1.1
POLR1A-204ENST00000424089 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
POLR1A-204ENST00000424089 RAB1BQ9H0U4 201 aa8.2□□□□□ -1.1
POLR1A-204ENST00000424089 SLC35B3Q9H1N7 401 aa8.2□□□□□ -1.1
POLR1A-204ENST00000424089 TMEM140Q9NV12 185 aa8.2□□□□□ -1.1
POLR1A-204ENST00000424089 DCAF16Q9NXF7 216 aa8.2□□□□□ -1.1
POLR1A-204ENST00000424089 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
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