RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417536.5

SH3BP1-202, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,858 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-202ENST00000417536 IGKV3-15P01624 115 aa15.5■□□□□ 0.07
SH3BP1-202ENST00000417536 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa15.5■□□□□ 0.07
SH3BP1-202ENST00000417536 FAM78BQ5VT40 261 aa15.5■□□□□ 0.07
SH3BP1-202ENST00000417536 WDR31Q8NA23 367 aa15.5■□□□□ 0.07
SH3BP1-202ENST00000417536 LRRC29Q8WV35 223 aa15.5■□□□□ 0.07
SH3BP1-202ENST00000417536 GNG12Q9UBI6 72 aa15.5■□□□□ 0.07
SH3BP1-202ENST00000417536 COL12A1Q99715 3063 aa15.49■□□□□ 0.07
SH3BP1-202ENST00000417536 C15orf65H3BRN8 121 aa15.49■□□□□ 0.07
SH3BP1-202ENST00000417536 GGCTO75223 188 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
SH3BP1-202ENST00000417536 NDUFB4O95168 129 aa15.49■□□□□ 0.07
SH3BP1-202ENST00000417536 CECR9P0C854 216 aa15.49■□□□□ 0.07
SH3BP1-202ENST00000417536 DUTP33316 252 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
SH3BP1-202ENST00000417536 ACTL10Q5JWF8 245 aa15.49■□□□□ 0.07
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SH3BP1-202ENST00000417536 RRHO14718 337 aa15.47■□□□□ 0.07
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SH3BP1-202ENST00000417536 C1QTNF9P0C862 333 aa15.47■□□□□ 0.07
SH3BP1-202ENST00000417536 Q8TCH9 128 aa15.47■□□□□ 0.07
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SH3BP1-202ENST00000417536 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF718Q3SXZ3 478 aa15.47■□□□□ 0.07
SH3BP1-202ENST00000417536 RPL39P5Q59GN2 51 aa15.47■□□□□ 0.07
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SH3BP1-202ENST00000417536 HTD2P86397 168 aa15.46■□□□□ 0.07
SH3BP1-202ENST00000417536 TREML4Q6UXN2 200 aa15.46■□□□□ 0.07
SH3BP1-202ENST00000417536 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
SH3BP1-202ENST00000417536 WFIKKN1Q96NZ8 548 aa15.46■□□□□ 0.07
SH3BP1-202ENST00000417536 TRAV3A0A0B4J244 114 aa15.46■□□□□ 0.07
SH3BP1-202ENST00000417536 A0A1B0GV90 55 aa15.46■□□□□ 0.07
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SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF320A2RRD8 509 aa15.46■□□□□ 0.06
SH3BP1-202ENST00000417536 ARL14EPLP0DKL9 152 aa15.46■□□□□ 0.06
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SH3BP1-202ENST00000417536 ABHD12Q8N2K0 398 aa15.46■□□□□ 0.06
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SH3BP1-202ENST00000417536 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.06
SH3BP1-202ENST00000417536 IGHG3P01860 377 aa15.45■□□□□ 0.06
SH3BP1-202ENST00000417536 TYMSP04818 313 aa15.45■□□□□ 0.06
SH3BP1-202ENST00000417536 SPCS3P61009 180 aa15.45■□□□□ 0.06
SH3BP1-202ENST00000417536 MORN2Q502X0 79 aa15.45■□□□□ 0.06
SH3BP1-202ENST00000417536 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF664Q8N3J9 261 aa15.45■□□□□ 0.06
SH3BP1-202ENST00000417536 ABHD17AQ96GS6 310 aa15.45■□□□□ 0.06
SH3BP1-202ENST00000417536 MS4A5Q9H3V2 200 aa15.45■□□□□ 0.06
SH3BP1-202ENST00000417536 DUSP13Q9UII6 198 aa15.45■□□□□ 0.06
SH3BP1-202ENST00000417536 PKDREJQ9NTG1 2253 aa15.45■□□□□ 0.06
SH3BP1-202ENST00000417536 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa15.45■□□□□ 0.06
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SH3BP1-202ENST00000417536 PDLIM4P50479 330 aa15.45■□□□□ 0.06
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SH3BP1-202ENST00000417536 RAB1CQ92928 201 aa15.44■□□□□ 0.06
SH3BP1-202ENST00000417536 PXMP4Q9Y6I8 212 aa15.44■□□□□ 0.06
SH3BP1-202ENST00000417536 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa15.44■□□□□ 0.06
SH3BP1-202ENST00000417536 CEACAM4O75871 244 aa15.44■□□□□ 0.06
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF134P52741 427 aa15.44■□□□□ 0.06
SH3BP1-202ENST00000417536 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa15.44■□□□□ 0.06
SH3BP1-202ENST00000417536 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa15.43■□□□□ 0.06
SH3BP1-202ENST00000417536 CNN1P51911 297 aaKnown RBP15.43■□□□□ 0.06
SH3BP1-202ENST00000417536 ERVK-16P61578 105 aa15.43■□□□□ 0.06
SH3BP1-202ENST00000417536 RPP30P78346 268 aaKnown RBP15.43■□□□□ 0.06
SH3BP1-202ENST00000417536 TRAT1Q6PIZ9 186 aa15.43■□□□□ 0.06
SH3BP1-202ENST00000417536 SPACA3Q8IXA5 215 aa15.43■□□□□ 0.06
SH3BP1-202ENST00000417536 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP15.43■□□□□ 0.06
SH3BP1-202ENST00000417536 SSMEM1Q8WWF3 244 aa15.43■□□□□ 0.06
SH3BP1-202ENST00000417536 ITPR1Q14643 2758 aa15.43■□□□□ 0.06
SH3BP1-202ENST00000417536 LRBAP50851 2863 aa15.43■□□□□ 0.06
SH3BP1-202ENST00000417536 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa15.43■□□□□ 0.06
SH3BP1-202ENST00000417536 TMPRSS2O15393 492 aa15.43■□□□□ 0.06
SH3BP1-202ENST00000417536 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP15.43■□□□□ 0.06
SH3BP1-202ENST00000417536 SOX15O60248 233 aa15.43■□□□□ 0.06
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