RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000413251.5

GGA1-208, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 1, human

TSL 5

Gene GGA1, Length 565 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GGA1-208	ENST00000413251	RPH3AL	Q9UNE2	315 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GGA1-208	ENST00000413251	APOB	P04114	4563 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
GGA1-208	ENST00000413251	LOC102724200	A0A096LPH7	203 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
GGA1-208	ENST00000413251	IGHV1-3	A0A0C4DH29	117 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GGA1-208	ENST00000413251	SERTM2	A0A1B0GWG4	89 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GGA1-208	ENST00000413251	IZUMO1R	A6ND01	250 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GGA1-208	ENST00000413251		M0R2N4	97 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GGA1-208	ENST00000413251	ARPC3	O15145	178 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GGA1-208	ENST00000413251	ATP6V0E1	O15342	81 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GGA1-208	ENST00000413251	SPRY2	O43597	315 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GGA1-208	ENST00000413251	NRAS	P01111	189 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GGA1-208	ENST00000413251	TCRB	P04435	133 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GGA1-208	ENST00000413251	CD7	P09564	240 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GGA1-208	ENST00000413251	NCK1	P16333	377 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GGA1-208	ENST00000413251	CXCL3	P19876	107 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GGA1-208	ENST00000413251	RAB5A	P20339	215 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GGA1-208	ENST00000413251	BTC	P35070	178 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GGA1-208	ENST00000413251	REG1B	P48304	166 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GGA1-208	ENST00000413251	PPT1	P50897	306 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GGA1-208	ENST00000413251	AP3S2	P59780	193 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GGA1-208	ENST00000413251	SELENOT	P62341	195 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GGA1-208	ENST00000413251	MRPS10	P82664	201 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
GGA1-208	ENST00000413251	IL24	Q13007	206 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GGA1-208	ENST00000413251	MLLT11	Q13015	90 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
GGA1-208	ENST00000413251	EBI3	Q14213	229 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GGA1-208	ENST00000413251	JOSD1	Q15040	202 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
GGA1-208	ENST00000413251	RSU1	Q15404	277 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GGA1-208	ENST00000413251	MOGAT2	Q3SYC2	334 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GGA1-208	ENST00000413251	BCL2L15	Q5TBC7	163 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GGA1-208	ENST00000413251	OR8G2P	Q6IF36	304 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GGA1-208	ENST00000413251	TMEM88	Q6PEY1	159 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GGA1-208	ENST00000413251	TCF24	Q7RTU0	167 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GGA1-208	ENST00000413251	WFDC3	Q8IUB2	231 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GGA1-208	ENST00000413251	BAP18	Q8IXM2	172 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GGA1-208	ENST00000413251		Q8N6K4	173 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GGA1-208	ENST00000413251	OR8B12	Q8NGG6	310 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GGA1-208	ENST00000413251	OR56B1	Q8NGI3	324 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GGA1-208	ENST00000413251	OR2K2	Q8NGT1	345 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GGA1-208	ENST00000413251	OR6K6	Q8NGW6	343 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GGA1-208	ENST00000413251	OR6N2	Q8NGY6	317 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GGA1-208	ENST00000413251	GNPDA2	Q8TDQ7	276 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GGA1-208	ENST00000413251	APH1B	Q8WW43	257 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GGA1-208	ENST00000413251	THRSP	Q92748	146 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GGA1-208	ENST00000413251	ARL11	Q969Q4	196 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GGA1-208	ENST00000413251	WDR89	Q96FK6	387 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
GGA1-208	ENST00000413251	INTS14	Q96SY0	518 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GGA1-208	ENST00000413251	CNN2	Q99439	309 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
GGA1-208	ENST00000413251	FUZ	Q9BT04	418 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GGA1-208	ENST00000413251	JAM3	Q9BX67	310 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GGA1-208	ENST00000413251	PARD6G	Q9BYG4	376 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
GGA1-208	ENST00000413251	PKIB	Q9C010	78 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GGA1-208	ENST00000413251	CSTL1	Q9H114	145 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GGA1-208	ENST00000413251	TPSG1	Q9NRR2	321 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GGA1-208	ENST00000413251	MBNL3	Q9NUK0	354 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
GGA1-208	ENST00000413251	DCAF13	Q9NV06	445 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
GGA1-208	ENST00000413251	SMPX	Q9UHP9	88 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GGA1-208	ENST00000413251	TP53TG1	Q9Y2A0	90 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GGA1-208	ENST00000413251	ZFP30	Q9Y2G7	519 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GGA1-208	ENST00000413251	ODAM	A1E959	279 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GGA1-208	ENST00000413251	RNF222	A6NCQ9	220 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GGA1-208	ENST00000413251	C5orf51	A6NDU8	294 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GGA1-208	ENST00000413251	FAM90A10P	A6NDY2	464 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GGA1-208	ENST00000413251	EPM2A	B3EWF7	344 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GGA1-208	ENST00000413251	IGLL5	B9A064	214 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GGA1-208	ENST00000413251	SIRPB1	O00241	398 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GGA1-208	ENST00000413251	CCS	O14618	274 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GGA1-208	ENST00000413251	TMEM127	O75204	238 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GGA1-208	ENST00000413251	SCGB1D2	O95969	90 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GGA1-208	ENST00000413251	GCG	P01275	180 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GGA1-208	ENST00000413251	CSTB	P04080	98 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
GGA1-208	ENST00000413251	CRYGC	P07315	174 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GGA1-208	ENST00000413251	OR5AC1	P0C628	307 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GGA1-208	ENST00000413251	OR2T7	P0C7T2	308 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GGA1-208	ENST00000413251	RBMY1C	P0DJD4	496 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GGA1-208	ENST00000413251	ADCYAP1	P18509	176 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GGA1-208	ENST00000413251	IL3RA	P26951	378 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GGA1-208	ENST00000413251	CD1B	P29016	333 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GGA1-208	ENST00000413251	OR3A1	P47881	315 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GGA1-208	ENST00000413251	SNU13	P55769	128 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
GGA1-208	ENST00000413251	SYNJ2BP	P57105	145 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GGA1-208	ENST00000413251	FXYD6P3	P58550	94 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GGA1-208	ENST00000413251	TPPP2	P59282	170 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GGA1-208	ENST00000413251	ERVK11-1	P61568	191 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GGA1-208	ENST00000413251	ZNF816	Q0VGE8	651 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
GGA1-208	ENST00000413251	TPBG	Q13641	420 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GGA1-208	ENST00000413251	GAMT	Q14353	236 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GGA1-208	ENST00000413251	SURF2	Q15527	256 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
GGA1-208	ENST00000413251	MED22	Q15528	200 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GGA1-208	ENST00000413251	SSX1	Q16384	188 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GGA1-208	ENST00000413251	LTC4S	Q16873	150 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GGA1-208	ENST00000413251	TMEM241	Q24JQ0	296 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GGA1-208	ENST00000413251	LIPK	Q5VXJ0	399 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GGA1-208	ENST00000413251	CD200R1L	Q6Q8B3	271 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GGA1-208	ENST00000413251	ALKAL2	Q6UX46	152 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GGA1-208	ENST00000413251	SSX6	Q7RTT6	188 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GGA1-208	ENST00000413251	ZNF645	Q8N7E2	425 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GGA1-208	ENST00000413251	OR52J3	Q8NH60	311 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GGA1-208	ENST00000413251	CD300LF	Q8TDQ1	290 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GGA1-208	ENST00000413251	DYNLRB2	Q8TF09	96 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GGA1-208	ENST00000413251	ABHD5	Q8WTS1	349 aa		4.89	□□□□□ -1.63

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