RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000410856.1

RNU2-38P-201, Transcript of RNA, U2 small nuclear 38, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU2-38P, Length 79 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU2-38P-201ENST00000410856 SDHAF2Q9NX18 166 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU2-38P-201ENST00000410856 JMJD1CQ15652 2540 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU2-38P-201ENST00000410856 ESPL1Q14674 2120 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU2-38P-201ENST00000410856 ATRQ13535 2644 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU2-38P-201ENST00000410856 NUP160Q12769 1436 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU2-38P-201ENST00000410856 MYO15BQ96JP2 1530 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU2-38P-201ENST00000410856 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU2-38P-201ENST00000410856 FXYD1O00168 92 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU2-38P-201ENST00000410856 MSNP26038 577 aaKnown RBP-1.64□□□□□ -2.67
RNU2-38P-201ENST00000410856 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP-1.64□□□□□ -2.67
RNU2-38P-201ENST00000410856 BTN3A2P78410 334 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU2-38P-201ENST00000410856 SBSNQ6UWP8 590 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU2-38P-201ENST00000410856 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP-1.64□□□□□ -2.67
RNU2-38P-201ENST00000410856 BAP18Q8IXM2 172 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU2-38P-201ENST00000410856 CLECL1Q8IZS7 167 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU2-38P-201ENST00000410856 PXT1Q8NFP0 134 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU2-38P-201ENST00000410856 OR2AG1Q9H205 316 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU2-38P-201ENST00000410856 AUNIPQ9H7T9 357 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU2-38P-201ENST00000410856 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU2-38P-201ENST00000410856 MRPL22Q9NWU5 206 aaKnown RBP-1.64□□□□□ -2.67
RNU2-38P-201ENST00000410856 FANCMQ8IYD8 2048 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU2-38P-201ENST00000410856 TVP23AA6NH52 213 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU2-38P-201ENST00000410856 FADS1O60427 444 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU2-38P-201ENST00000410856 C1QAP02745 245 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU2-38P-201ENST00000410856 MSMBP08118 114 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU2-38P-201ENST00000410856 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP-1.65□□□□□ -2.67
RNU2-38P-201ENST00000410856 FXYD2P54710 66 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU2-38P-201ENST00000410856 KCNJ8Q15842 424 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU2-38P-201ENST00000410856 OOSP2Q86WS3 158 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU2-38P-201ENST00000410856 PRR15Q8IV56 129 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU2-38P-201ENST00000410856 C10orf67Q8IYJ2 551 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU2-38P-201ENST00000410856 OR51L1Q8NGJ5 315 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU2-38P-201ENST00000410856 MITD1Q8WV92 249 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU2-38P-201ENST00000410856 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP-1.65□□□□□ -2.67
RNU2-38P-201ENST00000410856 OR51E2Q9H255 320 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU2-38P-201ENST00000410856 AHSPQ9NZD4 102 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU2-38P-201ENST00000410856 VAPAQ9P0L0 249 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU2-38P-201ENST00000410856 CD300AQ9UGN4 299 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU2-38P-201ENST00000410856 SIPA1L1O43166 1804 aa-1.66□□□□□ -2.67
RNU2-38P-201ENST00000410856 SPAG17Q6Q759 2223 aa-1.66□□□□□ -2.67
RNU2-38P-201ENST00000410856 LAMA3Q16787 3333 aa-1.66□□□□□ -2.67
RNU2-38P-201ENST00000410856 DSPP15924 2871 aaKnown RBP-1.66□□□□□ -2.67
RNU2-38P-201ENST00000410856 CHD8Q9HCK8 2581 aa-1.66□□□□□ -2.67
RNU2-38P-201ENST00000410856 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa-1.66□□□□□ -2.68
RNU2-38P-201ENST00000410856 C5orf67F2Z3F1 127 aa-1.66□□□□□ -2.68
RNU2-38P-201ENST00000410856 KCNK1O00180 336 aa-1.66□□□□□ -2.68
RNU2-38P-201ENST00000410856 OR1I1O60431 355 aa-1.66□□□□□ -2.68
RNU2-38P-201ENST00000410856 OR5F1O95221 314 aa-1.66□□□□□ -2.68
RNU2-38P-201ENST00000410856 VAPBO95292 243 aa-1.66□□□□□ -2.68
RNU2-38P-201ENST00000410856 GIMD1P0DJR0 217 aa-1.66□□□□□ -2.68
RNU2-38P-201ENST00000410856 PDE6HQ13956 83 aa-1.66□□□□□ -2.68
RNU2-38P-201ENST00000410856 SPRNQ5BIV9 151 aa-1.66□□□□□ -2.68
RNU2-38P-201ENST00000410856 HBMQ6B0K9 141 aa-1.66□□□□□ -2.68
RNU2-38P-201ENST00000410856 PLPP5Q8NEB5 264 aa-1.66□□□□□ -2.68
RNU2-38P-201ENST00000410856 CDKL2Q92772 493 aa-1.66□□□□□ -2.68
RNU2-38P-201ENST00000410856 NMNAT3Q96T66 252 aa-1.66□□□□□ -2.68
RNU2-38P-201ENST00000410856 DMAC2Q9NW81 257 aa-1.66□□□□□ -2.68
RNU2-38P-201ENST00000410856 SPTBP11277 2137 aa-1.66□□□□□ -2.68
RNU2-38P-201ENST00000410856 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP-1.66□□□□□ -2.68
RNU2-38P-201ENST00000410856 ABCA13Q86UQ4 5058 aa-1.67□□□□□ -2.68
RNU2-38P-201ENST00000410856 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP-1.67□□□□□ -2.68
RNU2-38P-201ENST00000410856 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP-1.67□□□□□ -2.68
RNU2-38P-201ENST00000410856 C2orf70A6NJV1 201 aa-1.67□□□□□ -2.68
RNU2-38P-201ENST00000410856 CCL25O15444 150 aa-1.67□□□□□ -2.68
RNU2-38P-201ENST00000410856 PTMAP06454 111 aaKnown RBP-1.67□□□□□ -2.68
RNU2-38P-201ENST00000410856 TFPTP0C1Z6 253 aa-1.67□□□□□ -2.68
RNU2-38P-201ENST00000410856 OR10J1P30954 320 aa-1.67□□□□□ -2.68
RNU2-38P-201ENST00000410856 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP-1.67□□□□□ -2.68
RNU2-38P-201ENST00000410856 TBPL1P62380 186 aa-1.67□□□□□ -2.68
RNU2-38P-201ENST00000410856 OFCC1Q8IZS5 231 aa-1.67□□□□□ -2.68
RNU2-38P-201ENST00000410856 LINC00311Q8N616 119 aa-1.67□□□□□ -2.68
RNU2-38P-201ENST00000410856 PACRGLQ8N7B6 248 aa-1.67□□□□□ -2.68
RNU2-38P-201ENST00000410856 Q96NJ1 140 aa-1.67□□□□□ -2.68
RNU2-38P-201ENST00000410856 BPIFA3Q9BQP9 254 aa-1.67□□□□□ -2.68
RNU2-38P-201ENST00000410856 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP-1.67□□□□□ -2.68
RNU2-38P-201ENST00000410856 RASL12Q9NYN1 266 aa-1.67□□□□□ -2.68
RNU2-38P-201ENST00000410856 CFAP45Q9UL16 551 aa-1.67□□□□□ -2.68
RNU2-38P-201ENST00000410856 SCN3AQ9NY46 2000 aa-1.67□□□□□ -2.68
RNU2-38P-201ENST00000410856 TRAV25A0A0B4J276 109 aa-1.68□□□□□ -2.68
RNU2-38P-201ENST00000410856 ENSAO43768 121 aaKnown RBP-1.68□□□□□ -2.68
RNU2-38P-201ENST00000410856 DNAL4O96015 105 aa-1.68□□□□□ -2.68
RNU2-38P-201ENST00000410856 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP-1.68□□□□□ -2.68
RNU2-38P-201ENST00000410856 RPS5P46782 204 aaKnown RBP-1.68□□□□□ -2.68
RNU2-38P-201ENST00000410856 C4orf26Q17RF5 130 aa-1.68□□□□□ -2.68
RNU2-38P-201ENST00000410856 KLK9Q2XQG4 91 aa-1.68□□□□□ -2.68
RNU2-38P-201ENST00000410856 AADACL4Q5VUY2 407 aa-1.68□□□□□ -2.68
RNU2-38P-201ENST00000410856 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP-1.68□□□□□ -2.68
RNU2-38P-201ENST00000410856 AAED1Q7RTV5 226 aa-1.68□□□□□ -2.68
RNU2-38P-201ENST00000410856 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP-1.68□□□□□ -2.68
RNU2-38P-201ENST00000410856 LRRC34Q8IZ02 419 aa-1.68□□□□□ -2.68
RNU2-38P-201ENST00000410856 SLC30A7Q8NEW0 376 aa-1.68□□□□□ -2.68
RNU2-38P-201ENST00000410856 OR2AE1Q8NHA4 323 aa-1.68□□□□□ -2.68
RNU2-38P-201ENST00000410856 TMEM239Q8WW34 195 aa-1.68□□□□□ -2.68
RNU2-38P-201ENST00000410856 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP-1.68□□□□□ -2.68
RNU2-38P-201ENST00000410856 CCDC77Q9BR77 488 aa-1.68□□□□□ -2.68
RNU2-38P-201ENST00000410856 COMMD5Q9GZQ3 224 aa-1.68□□□□□ -2.68
RNU2-38P-201ENST00000410856 MAT2BQ9NZL9 334 aa-1.68□□□□□ -2.68
RNU2-38P-201ENST00000410856 SNX10Q9Y5X0 201 aa-1.68□□□□□ -2.68
RNU2-38P-201ENST00000410856 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa-1.68□□□□□ -2.68
RNU2-38P-201ENST00000410856 HEATR5AQ86XA9 2040 aa-1.68□□□□□ -2.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41 ms