RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000403441.1

PRAME-204, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene PRAME, Length 567 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-204ENST00000403441 RPS16P62249 146 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
PRAME-204ENST00000403441 DYRK1AQ13627 763 aa9.42□□□□□ -0.9
PRAME-204ENST00000403441 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP9.42□□□□□ -0.9
PRAME-204ENST00000403441 RTL8BQ17RB0 113 aa9.42□□□□□ -0.9
PRAME-204ENST00000403441 MZT2AQ6P582 158 aa9.42□□□□□ -0.9
PRAME-204ENST00000403441 ZNF66Q6ZN08 573 aa9.42□□□□□ -0.9
PRAME-204ENST00000403441 LYSMD2Q8IV50 215 aa9.42□□□□□ -0.9
PRAME-204ENST00000403441 IL17DQ8TAD2 202 aa9.42□□□□□ -0.9
PRAME-204ENST00000403441 HARBI1Q96MB7 349 aa9.42□□□□□ -0.9
PRAME-204ENST00000403441 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
PRAME-204ENST00000403441 MIXL1Q9H2W2 232 aa9.42□□□□□ -0.9
PRAME-204ENST00000403441 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
PRAME-204ENST00000403441 SACSQ9NZJ4 4579 aa9.42□□□□□ -0.9
PRAME-204ENST00000403441 STARD9Q9P2P6 4700 aa9.41□□□□□ -0.9
PRAME-204ENST00000403441 BRI3O95415 125 aa9.41□□□□□ -0.9
PRAME-204ENST00000403441 SYNJ2BPP57105 145 aa9.41□□□□□ -0.9
PRAME-204ENST00000403441 TAS2R46P59540 309 aa9.41□□□□□ -0.9
PRAME-204ENST00000403441 TATDN3Q17R31 274 aa9.41□□□□□ -0.9
PRAME-204ENST00000403441 KCTD9Q7L273 389 aa9.41□□□□□ -0.9
PRAME-204ENST00000403441 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP9.41□□□□□ -0.9
PRAME-204ENST00000403441 Q8N402 240 aa9.41□□□□□ -0.9
PRAME-204ENST00000403441 TEX45Q8NA69 505 aa9.41□□□□□ -0.9
PRAME-204ENST00000403441 ZBTB34Q8NCN2 500 aa9.41□□□□□ -0.9
PRAME-204ENST00000403441 OR5T1Q8NG75 326 aa9.41□□□□□ -0.9
PRAME-204ENST00000403441 IFT46Q9NQC8 304 aa9.41□□□□□ -0.9
PRAME-204ENST00000403441 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP9.41□□□□□ -0.9
PRAME-204ENST00000403441 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa9.4□□□□□ -0.9
PRAME-204ENST00000403441 H3BMQ9 156 aa9.4□□□□□ -0.9
PRAME-204ENST00000403441 SHOXO15266 292 aa9.4□□□□□ -0.9
PRAME-204ENST00000403441 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP9.4□□□□□ -0.9
PRAME-204ENST00000403441 CRYZL1O95825 349 aa9.4□□□□□ -0.9
PRAME-204ENST00000403441 PJVKQ0ZLH3 352 aa9.4□□□□□ -0.9
PRAME-204ENST00000403441 CBX3Q13185 183 aa9.4□□□□□ -0.9
PRAME-204ENST00000403441 RPEL1Q2QD12 228 aa9.4□□□□□ -0.9
PRAME-204ENST00000403441 MFSD4AQ8N468 514 aa9.4□□□□□ -0.9
PRAME-204ENST00000403441 MOB3AQ96BX8 217 aa9.4□□□□□ -0.9
PRAME-204ENST00000403441 TMEM68Q96MH6 324 aa9.4□□□□□ -0.9
PRAME-204ENST00000403441 CCL28Q9NRJ3 127 aa9.4□□□□□ -0.9
PRAME-204ENST00000403441 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
PRAME-204ENST00000403441 OR2A4O95047 310 aa9.39□□□□□ -0.91
PRAME-204ENST00000403441 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
PRAME-204ENST00000403441 GNRHRP30968 328 aa9.39□□□□□ -0.91
PRAME-204ENST00000403441 RCVRNP35243 200 aa9.39□□□□□ -0.91
PRAME-204ENST00000403441 RFX2P48378 723 aa9.39□□□□□ -0.91
PRAME-204ENST00000403441 POU2AF1Q16633 256 aa9.39□□□□□ -0.91
PRAME-204ENST00000403441 IL34Q6ZMJ4 242 aa9.39□□□□□ -0.91
PRAME-204ENST00000403441 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa9.39□□□□□ -0.91
PRAME-204ENST00000403441 LAX1Q8IWV1 398 aa9.39□□□□□ -0.91
PRAME-204ENST00000403441 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
PRAME-204ENST00000403441 SECTM1Q8WVN6 248 aa9.39□□□□□ -0.91
PRAME-204ENST00000403441 USMG5Q96IX5 58 aa9.39□□□□□ -0.91
PRAME-204ENST00000403441 ABHD1Q96SE0 405 aa9.39□□□□□ -0.91
PRAME-204ENST00000403441 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
PRAME-204ENST00000403441 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
PRAME-204ENST00000403441 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
PRAME-204ENST00000403441 FXYD6Q9H0Q3 95 aa9.39□□□□□ -0.91
PRAME-204ENST00000403441 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
PRAME-204ENST00000403441 COA4Q9NYJ1 87 aa9.39□□□□□ -0.91
PRAME-204ENST00000403441 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa9.39□□□□□ -0.91
PRAME-204ENST00000403441 EHFQ9NZC4 300 aa9.39□□□□□ -0.91
PRAME-204ENST00000403441 PEMTQ9UBM1 199 aa9.39□□□□□ -0.91
PRAME-204ENST00000403441 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
PRAME-204ENST00000403441 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa9.39□□□□□ -0.91
PRAME-204ENST00000403441 CEPT1Q9Y6K0 416 aa9.39□□□□□ -0.91
PRAME-204ENST00000403441 DNAH1Q9P2D7 4330 aa9.38□□□□□ -0.91
PRAME-204ENST00000403441 J3QRK9 145 aa9.38□□□□□ -0.91
PRAME-204ENST00000403441 CTDSP2O14595 271 aa9.38□□□□□ -0.91
PRAME-204ENST00000403441 FCGR3BO75015 233 aa9.38□□□□□ -0.91
PRAME-204ENST00000403441 FCER2P06734 321 aa9.38□□□□□ -0.91
PRAME-204ENST00000403441 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP9.38□□□□□ -0.91
PRAME-204ENST00000403441 HRH1P35367 487 aa9.38□□□□□ -0.91
PRAME-204ENST00000403441 KIR2DS2P43631 304 aa9.38□□□□□ -0.91
PRAME-204ENST00000403441 PRSS8Q16651 343 aa9.38□□□□□ -0.91
PRAME-204ENST00000403441 VMA21Q3ZAQ7 101 aa9.38□□□□□ -0.91
PRAME-204ENST00000403441 ZNF343Q6P1L6 599 aa9.38□□□□□ -0.91
PRAME-204ENST00000403441 SNX29P2Q8IUI4 249 aa9.38□□□□□ -0.91
PRAME-204ENST00000403441 OR2K2Q8NGT1 345 aa9.38□□□□□ -0.91
PRAME-204ENST00000403441 OR5H2Q8NGV7 314 aa9.38□□□□□ -0.91
PRAME-204ENST00000403441 OR4S2Q8NH73 311 aa9.38□□□□□ -0.91
PRAME-204ENST00000403441 BORCS5Q969J3 196 aa9.38□□□□□ -0.91
PRAME-204ENST00000403441 PHB2Q99623 299 aa9.38□□□□□ -0.91
PRAME-204ENST00000403441 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP9.38□□□□□ -0.91
PRAME-204ENST00000403441 SLC5A7Q9GZV3 580 aa9.38□□□□□ -0.91
PRAME-204ENST00000403441 TAS2R8Q9NYW2 309 aa9.38□□□□□ -0.91
PRAME-204ENST00000403441 EXTL2Q9UBQ6 330 aa9.38□□□□□ -0.91
PRAME-204ENST00000403441 MTFP1Q9UDX5 166 aa9.38□□□□□ -0.91
PRAME-204ENST00000403441 PMP2P02689 132 aa9.37□□□□□ -0.91
PRAME-204ENST00000403441 CSN3P07498 182 aa9.37□□□□□ -0.91
PRAME-204ENST00000403441 FGF2P09038 288 aa9.37□□□□□ -0.91
PRAME-204ENST00000403441 DEFA5Q01523 94 aa9.37□□□□□ -0.91
PRAME-204ENST00000403441 AADACL3Q5VUY0 350 aa9.37□□□□□ -0.91
PRAME-204ENST00000403441 LHFPL1Q86WI0 220 aa9.37□□□□□ -0.91
PRAME-204ENST00000403441 CADM3Q8N126 398 aa9.37□□□□□ -0.91
PRAME-204ENST00000403441 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa9.37□□□□□ -0.91
PRAME-204ENST00000403441 C15orf40Q8WUR7 153 aa9.37□□□□□ -0.91
PRAME-204ENST00000403441 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa9.37□□□□□ -0.91
PRAME-204ENST00000403441 GPHA2Q96T91 129 aa9.37□□□□□ -0.91
PRAME-204ENST00000403441 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP9.37□□□□□ -0.91
PRAME-204ENST00000403441 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP9.37□□□□□ -0.91
PRAME-204ENST00000403441 PLEKHA3Q9HB20 300 aa9.37□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.8 ms