RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379615.3

PGGT1B-202, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 903 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-202ENST00000379615 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa12.06□□□□□ -0.48
PGGT1B-202ENST00000379615 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP12.06□□□□□ -0.48
PGGT1B-202ENST00000379615 GDPD1Q8N9F7 314 aa12.06□□□□□ -0.48
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PGGT1B-202ENST00000379615 OR4C16Q8NGL9 310 aa12.06□□□□□ -0.48
PGGT1B-202ENST00000379615 OR5M8Q8NGP6 311 aa12.06□□□□□ -0.48
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PGGT1B-202ENST00000379615 SPIN2AQ99865 258 aa12.06□□□□□ -0.48
PGGT1B-202ENST00000379615 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa12.06□□□□□ -0.48
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP12.06□□□□□ -0.48
PGGT1B-202ENST00000379615 HRASLSQ9HDD0 168 aa12.06□□□□□ -0.48
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PGGT1B-202ENST00000379615 BET1LQ9NYM9 111 aa12.06□□□□□ -0.48
PGGT1B-202ENST00000379615 COPZ2Q9P299 210 aa12.06□□□□□ -0.48
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PGGT1B-202ENST00000379615 A0A1W2PN81 502 aa12.05□□□□□ -0.48
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PGGT1B-202ENST00000379615 TSPAN15O95858 294 aa12.05□□□□□ -0.48
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PGGT1B-202ENST00000379615 SERPINE2P07093 398 aa12.05□□□□□ -0.48
PGGT1B-202ENST00000379615 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP12.05□□□□□ -0.48
PGGT1B-202ENST00000379615 PSMB8P28062 276 aa12.05□□□□□ -0.48
PGGT1B-202ENST00000379615 CHRNA7P36544 502 aa12.05□□□□□ -0.48
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PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF79Q15937 498 aa12.05□□□□□ -0.48
PGGT1B-202ENST00000379615 POU2AF1Q16633 256 aa12.05□□□□□ -0.48
PGGT1B-202ENST00000379615 SSX9Q7RTT3 188 aa12.05□□□□□ -0.48
PGGT1B-202ENST00000379615 DMBX1Q8NFW5 382 aa12.05□□□□□ -0.48
PGGT1B-202ENST00000379615 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP12.05□□□□□ -0.48
PGGT1B-202ENST00000379615 MCUBQ9NWR8 336 aa12.05□□□□□ -0.48
PGGT1B-202ENST00000379615 SLC2A8Q9NY64 477 aa12.05□□□□□ -0.48
PGGT1B-202ENST00000379615 FBXO7Q9Y3I1 522 aa12.05□□□□□ -0.48
PGGT1B-202ENST00000379615 MSGN1A6NI15 193 aa12.04□□□□□ -0.48
PGGT1B-202ENST00000379615 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP12.04□□□□□ -0.48
PGGT1B-202ENST00000379615 B3GALNT1O75752 331 aa12.04□□□□□ -0.48
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PGGT1B-202ENST00000379615 S1PR2O95136 353 aa12.04□□□□□ -0.48
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PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF45Q02386 682 aa12.04□□□□□ -0.48
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PGGT1B-202ENST00000379615 OR4A47Q6IF82 309 aa12.04□□□□□ -0.48
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PGGT1B-202ENST00000379615 PI3P19957 117 aa12.03□□□□□ -0.48
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PGGT1B-202ENST00000379615 UBE2E2Q96LR5 201 aa12.03□□□□□ -0.48
PGGT1B-202ENST00000379615 SRRQ9GZT4 340 aa12.03□□□□□ -0.48
PGGT1B-202ENST00000379615 SLA2Q9H6Q3 261 aa12.03□□□□□ -0.48
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa12.03□□□□□ -0.48
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PGGT1B-202ENST00000379615 SNAPC5O75971 98 aa12.02□□□□□ -0.49
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PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF585BQ52M93 769 aa12.02□□□□□ -0.49
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PGGT1B-202ENST00000379615 TSC22D3Q99576 134 aa12.02□□□□□ -0.49
PGGT1B-202ENST00000379615 COMMD5Q9GZQ3 224 aa12.02□□□□□ -0.49
PGGT1B-202ENST00000379615 VSIG4Q9Y279 399 aa12.02□□□□□ -0.49
PGGT1B-202ENST00000379615 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP12.01□□□□□ -0.49
PGGT1B-202ENST00000379615 UPK2O00526 184 aa12.01□□□□□ -0.49
PGGT1B-202ENST00000379615 KRASP01116 189 aa12.01□□□□□ -0.49
PGGT1B-202ENST00000379615 OR5T1Q8NG75 326 aa12.01□□□□□ -0.49
PGGT1B-202ENST00000379615 MYOZ3Q8TDC0 251 aa12.01□□□□□ -0.49
PGGT1B-202ENST00000379615 C4orf3Q8WVX3 66 aa12.01□□□□□ -0.49
PGGT1B-202ENST00000379615 KLK15Q9H2R5 256 aa12.01□□□□□ -0.49
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PGGT1B-202ENST00000379615 SOX15O60248 233 aa12□□□□□ -0.49
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