RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373166.7

TRAPPC3-204, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC3, Length 1,265 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-204ENST00000373166 SORL1Q92673 2214 aa14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC3-204ENST00000373166 H3BUA1 57 aa14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC3-204ENST00000373166 TNFSF12O43508 249 aa14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC3-204ENST00000373166 ACTL6BO94805 426 aa14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC3-204ENST00000373166 PMP2P02689 132 aa14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC3-204ENST00000373166 TRGV3P03979 118 aa14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC3-204ENST00000373166 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC3-204ENST00000373166 NAT1P18440 290 aa14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC3-204ENST00000373166 SLURP1P55000 103 aa14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC3-204ENST00000373166 DYRK1AQ13627 763 aa14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC3-204ENST00000373166 POC5Q8NA72 575 aa14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC3-204ENST00000373166 VSTM2AQ8TAG5 236 aa14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC3-204ENST00000373166 MS4A10Q96PG2 267 aa14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC3-204ENST00000373166 HYDINQ4G0P3 5121 aa14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC3-204ENST00000373166 MPPED1O15442 326 aa14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC3-204ENST00000373166 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC3-204ENST00000373166 MMD2Q8IY49 270 aa14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC3-204ENST00000373166 OR5T1Q8NG75 326 aa14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC3-204ENST00000373166 GPX8Q8TED1 209 aa14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC3-204ENST00000373166 OR4C12Q96R67 309 aa14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC3-204ENST00000373166 GPHA2Q96T91 129 aa14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC3-204ENST00000373166 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC3-204ENST00000373166 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC3-204ENST00000373166 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC3-204ENST00000373166 RCVRNP35243 200 aa14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC3-204ENST00000373166 HRH1P35367 487 aa14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC3-204ENST00000373166 RFX2P48378 723 aa14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC3-204ENST00000373166 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC3-204ENST00000373166 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC3-204ENST00000373166 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC3-204ENST00000373166 MOB3AQ96BX8 217 aa14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC3-204ENST00000373166 ADAM30Q9UKF2 790 aa14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC3-204ENST00000373166 SULT1C2O00338 296 aa14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC3-204ENST00000373166 NOL3O60936 208 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC3-204ENST00000373166 KBTBD11O94819 623 aa14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC3-204ENST00000373166 OR2A4O95047 310 aa14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC3-204ENST00000373166 HRASP01112 189 aa14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC3-204ENST00000373166 IGHV3-11P01762 117 aa14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC3-204ENST00000373166 HLA-DMAP28067 261 aa14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC3-204ENST00000373166 AADACL3Q5VUY0 350 aa14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC3-204ENST00000373166 DHRS11Q6UWP2 260 aa14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC3-204ENST00000373166 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC3-204ENST00000373166 SGPP2Q8IWX5 399 aa14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC3-204ENST00000373166 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC3-204ENST00000373166 SPAG16Q8N0X2 631 aa14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC3-204ENST00000373166 RAB2BQ8WUD1 216 aa14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC3-204ENST00000373166 OR2A7Q96R45 310 aa14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC3-204ENST00000373166 COA4Q9NYJ1 87 aa14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC3-204ENST00000373166 EXTL2Q9UBQ6 330 aa14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC3-204ENST00000373166 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC3-204ENST00000373166 MSGN1A6NI15 193 aa14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC3-204ENST00000373166 A8MZ25 164 aa14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC3-204ENST00000373166 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC3-204ENST00000373166 JTBO76095 146 aa14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC3-204ENST00000373166 BRWD1-AS2P59051 145 aa14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC3-204ENST00000373166 SPCS2Q15005 226 aa14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC3-204ENST00000373166 Q8N1Y9 231 aa14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC3-204ENST00000373166 OR6F1Q8NGZ6 308 aa14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC3-204ENST00000373166 OR51H1Q8NH63 302 aa14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC3-204ENST00000373166 RHOVQ96L33 236 aa14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC3-204ENST00000373166 SPIN2AQ99865 258 aa14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC3-204ENST00000373166 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC3-204ENST00000373166 SPATA25Q9BR10 227 aa14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC3-204ENST00000373166 AIFM2Q9BRQ8 373 aa14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC3-204ENST00000373166 C19orf73Q9NVV2 129 aa14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC3-204ENST00000373166 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC3-204ENST00000373166 A0A087WW49 117 aa14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC3-204ENST00000373166 A0A0G2JLM5 398 aa14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC3-204ENST00000373166 OR9G9P0C7N8 305 aa14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC3-204ENST00000373166 APELAP0DMC3 54 aa14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC3-204ENST00000373166 TSPAN5P62079 268 aa14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC3-204ENST00000373166 LYSMD2Q8IV50 215 aa14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC3-204ENST00000373166 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC3-204ENST00000373166 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC3-204ENST00000373166 BCL7BQ9BQE9 202 aa14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC3-204ENST00000373166 ELOVL1Q9BW60 279 aa14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC3-204ENST00000373166 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC3-204ENST00000373166 FXYD6Q9H0Q3 95 aa14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC3-204ENST00000373166 RGS5O15539 181 aa14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC3-204ENST00000373166 BRI3O95415 125 aa14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC3-204ENST00000373166 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC3-204ENST00000373166 GNRHRP30968 328 aa14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC3-204ENST00000373166 RPL5P46777 297 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC3-204ENST00000373166 TMBIM6P55061 237 aa14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC3-204ENST00000373166 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC3-204ENST00000373166 C10orf55Q5SWW7 151 aa14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC3-204ENST00000373166 SSX9Q7RTT3 188 aa14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC3-204ENST00000373166 CMTM1Q8IZ96 169 aa14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC3-204ENST00000373166 CD300LFQ8TDQ1 290 aa14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC3-204ENST00000373166 C15orf40Q8WUR7 153 aa14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC3-204ENST00000373166 TPPPO94811 219 aa14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC3-204ENST00000373166 HPRT1P00492 218 aa14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC3-204ENST00000373166 RLN1P04808 185 aa14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC3-204ENST00000373166 IFNA6P05013 189 aa14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC3-204ENST00000373166 MAS1LP35410 378 aa14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC3-204ENST00000373166 TAS2R31P59538 309 aa14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC3-204ENST00000373166 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC3-204ENST00000373166 OR4A5Q8NH83 315 aa14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC3-204ENST00000373166 HRASLSQ9HDD0 168 aa14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC3-204ENST00000373166 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.6 ms