RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368205.7

PTPRK-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRK, Length 662 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-202ENST00000368205 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa2.7□□□□□ -1.98
PTPRK-202ENST00000368205 NMSQ5H8A3 153 aa2.7□□□□□ -1.98
PTPRK-202ENST00000368205 OR2T2Q6IF00 324 aa2.7□□□□□ -1.98
PTPRK-202ENST00000368205 RHBDD2Q6NTF9 364 aa2.7□□□□□ -1.98
PTPRK-202ENST00000368205 DPPA3Q6W0C5 159 aa2.7□□□□□ -1.98
PTPRK-202ENST00000368205 Q6ZS49 121 aa2.7□□□□□ -1.98
PTPRK-202ENST00000368205 Q6ZS52 159 aa2.7□□□□□ -1.98
PTPRK-202ENST00000368205 RABEPKQ7Z6M1 372 aa2.7□□□□□ -1.98
PTPRK-202ENST00000368205 DPPA2Q7Z7J5 298 aa2.7□□□□□ -1.98
PTPRK-202ENST00000368205 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP2.7□□□□□ -1.98
PTPRK-202ENST00000368205 ZNF100Q8IYN0 542 aa2.7□□□□□ -1.98
PTPRK-202ENST00000368205 OSR2Q8N2R0 312 aa2.7□□□□□ -1.98
PTPRK-202ENST00000368205 SLC25A45Q8N413 288 aa2.7□□□□□ -1.98
PTPRK-202ENST00000368205 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa2.7□□□□□ -1.98
PTPRK-202ENST00000368205 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa2.7□□□□□ -1.98
PTPRK-202ENST00000368205 OR10G3Q8NGC4 313 aa2.7□□□□□ -1.98
PTPRK-202ENST00000368205 OR5C1Q8NGR4 320 aa2.7□□□□□ -1.98
PTPRK-202ENST00000368205 OR2AE1Q8NHA4 323 aa2.7□□□□□ -1.98
PTPRK-202ENST00000368205 OR1F12Q8NHA8 337 aa2.7□□□□□ -1.98
PTPRK-202ENST00000368205 M1APQ8TC57 530 aa2.7□□□□□ -1.98
PTPRK-202ENST00000368205 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa2.7□□□□□ -1.98
PTPRK-202ENST00000368205 SPSB1Q96BD6 273 aa2.7□□□□□ -1.98
PTPRK-202ENST00000368205 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP2.7□□□□□ -1.98
PTPRK-202ENST00000368205 ZNF799Q96GE5 643 aa2.7□□□□□ -1.98
PTPRK-202ENST00000368205 FAM210BQ96KR6 192 aa2.7□□□□□ -1.98
PTPRK-202ENST00000368205 MAGT1Q9H0U3 335 aa2.7□□□□□ -1.98
PTPRK-202ENST00000368205 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP2.7□□□□□ -1.98
PTPRK-202ENST00000368205 PRO1933Q9H354 126 aa2.7□□□□□ -1.98
PTPRK-202ENST00000368205 METTL7AQ9H8H3 244 aa2.7□□□□□ -1.98
PTPRK-202ENST00000368205 CDH20Q9HBT6 801 aa2.7□□□□□ -1.98
PTPRK-202ENST00000368205 PROK2Q9HC23 129 aa2.7□□□□□ -1.98
PTPRK-202ENST00000368205 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP2.7□□□□□ -1.98
PTPRK-202ENST00000368205 UFSP2Q9NUQ7 469 aa2.7□□□□□ -1.98
PTPRK-202ENST00000368205 TMEM242Q9NWH2 141 aa2.7□□□□□ -1.98
PTPRK-202ENST00000368205 IL36GQ9NZH8 169 aa2.7□□□□□ -1.98
PTPRK-202ENST00000368205 KLRF1Q9NZS2 232 aa2.7□□□□□ -1.98
PTPRK-202ENST00000368205 DKKL1Q9UK85 242 aa2.7□□□□□ -1.98
PTPRK-202ENST00000368205 SLC7A11Q9UPY5 501 aa2.7□□□□□ -1.98
PTPRK-202ENST00000368205 RNF115Q9Y4L5 304 aa2.7□□□□□ -1.98
PTPRK-202ENST00000368205 MTCH2Q9Y6C9 303 aa2.7□□□□□ -1.98
PTPRK-202ENST00000368205 WSB1Q9Y6I7 421 aa2.7□□□□□ -1.98
PTPRK-202ENST00000368205 UNC13CQ8NB66 2214 aa2.7□□□□□ -1.98
PTPRK-202ENST00000368205 KNL1Q8NG31 2342 aa2.7□□□□□ -1.98
PTPRK-202ENST00000368205 SHANK1Q9Y566 2161 aa2.7□□□□□ -1.98
PTPRK-202ENST00000368205 ASXL3Q9C0F0 2248 aa2.69□□□□□ -1.98
PTPRK-202ENST00000368205 CHD7Q9P2D1 2997 aa2.69□□□□□ -1.98
PTPRK-202ENST00000368205 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa2.69□□□□□ -1.98
PTPRK-202ENST00000368205 A0A087WZY1 265 aa2.69□□□□□ -1.98
PTPRK-202ENST00000368205 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa2.69□□□□□ -1.98
PTPRK-202ENST00000368205 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa2.69□□□□□ -1.98
PTPRK-202ENST00000368205 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa2.69□□□□□ -1.98
PTPRK-202ENST00000368205 A0A0G2JRQ6 117 aa2.69□□□□□ -1.98
PTPRK-202ENST00000368205 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa2.69□□□□□ -1.98
PTPRK-202ENST00000368205 OR6C6A6NF89 314 aa2.69□□□□□ -1.98
PTPRK-202ENST00000368205 SLC22A20A6NK97 555 aa2.69□□□□□ -1.98
PTPRK-202ENST00000368205 OR5H1A6NKK0 313 aa2.69□□□□□ -1.98
PTPRK-202ENST00000368205 C9J4A7 227 aa2.69□□□□□ -1.98
PTPRK-202ENST00000368205 CLDN34H7C241 214 aa2.69□□□□□ -1.98
PTPRK-202ENST00000368205 PPP1R2P9O14990 202 aa2.69□□□□□ -1.98
PTPRK-202ENST00000368205 SLC31A2O15432 143 aa2.69□□□□□ -1.98
PTPRK-202ENST00000368205 CYB5BO43169 146 aa2.69□□□□□ -1.98
PTPRK-202ENST00000368205 DUX1O43812 170 aa2.69□□□□□ -1.98
PTPRK-202ENST00000368205 SSSCA1O60232 199 aa2.69□□□□□ -1.98
PTPRK-202ENST00000368205 CST7O76096 145 aa2.69□□□□□ -1.98
PTPRK-202ENST00000368205 VAMP5O95183 116 aa2.69□□□□□ -1.98
PTPRK-202ENST00000368205 NAPSAO96009 420 aa2.69□□□□□ -1.98
PTPRK-202ENST00000368205 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP2.69□□□□□ -1.98
PTPRK-202ENST00000368205 HBE1P02100 147 aa2.69□□□□□ -1.98
PTPRK-202ENST00000368205 PFN1P07737 140 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
PTPRK-202ENST00000368205 WNT2P09544 360 aa2.69□□□□□ -1.98
PTPRK-202ENST00000368205 SCTP09683 121 aa2.69□□□□□ -1.98
PTPRK-202ENST00000368205 PGA5P0DJD9 388 aa2.69□□□□□ -1.98
PTPRK-202ENST00000368205 IGKV1-13P0DP09 117 aa2.69□□□□□ -1.98
PTPRK-202ENST00000368205 NR2C1P13056 603 aa2.69□□□□□ -1.98
PTPRK-202ENST00000368205 ZNF32P17041 273 aa2.69□□□□□ -1.98
PTPRK-202ENST00000368205 UCP1P25874 307 aa2.69□□□□□ -1.98
PTPRK-202ENST00000368205 DDTP30046 118 aa2.69□□□□□ -1.98
PTPRK-202ENST00000368205 IL2RGP31785 369 aa2.69□□□□□ -1.98
PTPRK-202ENST00000368205 CEACAM6P40199 344 aa2.69□□□□□ -1.98
PTPRK-202ENST00000368205 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP2.69□□□□□ -1.98
PTPRK-202ENST00000368205 CEBPGP53567 150 aa2.69□□□□□ -1.98
PTPRK-202ENST00000368205 RBM11P57052 281 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
PTPRK-202ENST00000368205 TAS2R60P59551 318 aa2.69□□□□□ -1.98
PTPRK-202ENST00000368205 ERVK-16P61578 105 aa2.69□□□□□ -1.98
PTPRK-202ENST00000368205 SRPXP78539 464 aa2.69□□□□□ -1.98
PTPRK-202ENST00000368205 RUNX1Q01196 453 aa2.69□□□□□ -1.98
PTPRK-202ENST00000368205 ZNF92Q03936 586 aa2.69□□□□□ -1.98
PTPRK-202ENST00000368205 TLE4Q04727 773 aa2.69□□□□□ -1.98
PTPRK-202ENST00000368205 ZNF154Q13106 437 aa2.69□□□□□ -1.98
PTPRK-202ENST00000368205 ZNF266Q14584 549 aa2.69□□□□□ -1.98
PTPRK-202ENST00000368205 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP2.69□□□□□ -1.98
PTPRK-202ENST00000368205 RAB35Q15286 201 aa2.69□□□□□ -1.98
PTPRK-202ENST00000368205 ZNF726P1Q15940 193 aa2.69□□□□□ -1.98
PTPRK-202ENST00000368205 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP2.69□□□□□ -1.98
PTPRK-202ENST00000368205 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
PTPRK-202ENST00000368205 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa2.69□□□□□ -1.98
PTPRK-202ENST00000368205 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP2.69□□□□□ -1.98
PTPRK-202ENST00000368205 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa2.69□□□□□ -1.98
PTPRK-202ENST00000368205 SSX7Q7RTT5 188 aa2.69□□□□□ -1.98
PTPRK-202ENST00000368205 ZNF695Q8IW36 515 aa2.69□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.9 ms