RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362832.1

RNU6-170P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 170, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-170P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-170P-201ENST00000362832 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-170P-201ENST00000362832 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-170P-201ENST00000362832 OR6C6A6NF89 314 aa-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-170P-201ENST00000362832 C9JCJ5 164 aa-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-170P-201ENST00000362832 FAAHO00519 579 aa-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-170P-201ENST00000362832 MRASO14807 208 aa-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-170P-201ENST00000362832 PRM1P04553 51 aa-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-170P-201ENST00000362832 CD2P06729 351 aa-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-170P-201ENST00000362832 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-170P-201ENST00000362832 MIFP14174 115 aa-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-170P-201ENST00000362832 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-170P-201ENST00000362832 HERVK_113P63121 156 aa-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-170P-201ENST00000362832 STX4Q12846 297 aa-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-170P-201ENST00000362832 RCN1Q15293 331 aa-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-170P-201ENST00000362832 AADACL4Q5VUY2 407 aa-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-170P-201ENST00000362832 ULK3Q6PHR2 472 aa-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-170P-201ENST00000362832 AAED1Q7RTV5 226 aa-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-170P-201ENST00000362832 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-170P-201ENST00000362832 SFT2D1Q8WV19 159 aa-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-170P-201ENST00000362832 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-170P-201ENST00000362832 TPD52L3Q96J77 140 aa-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-170P-201ENST00000362832 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-170P-201ENST00000362832 MED29Q9NX70 200 aa-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-170P-201ENST00000362832 BLOC1S6Q9UL45 172 aa-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-170P-201ENST00000362832 TNFSF18Q9UNG2 199 aa-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-170P-201ENST00000362832 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-170P-201ENST00000362832 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa-1.07□□□□□ -2.58
RNU6-170P-201ENST00000362832 MAP3K19Q56UN5 1328 aa-1.07□□□□□ -2.58
RNU6-170P-201ENST00000362832 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa-1.07□□□□□ -2.58
RNU6-170P-201ENST00000362832 TMEM269A0A1B0GVZ9 245 aa-1.07□□□□□ -2.58
RNU6-170P-201ENST00000362832 A0A1B0GX12 115 aa-1.07□□□□□ -2.58
RNU6-170P-201ENST00000362832 MGAT4DA6NG13 374 aa-1.07□□□□□ -2.58
RNU6-170P-201ENST00000362832 K7ERQ8 282 aa-1.07□□□□□ -2.58
RNU6-170P-201ENST00000362832 M0QYV0 167 aa-1.07□□□□□ -2.58
RNU6-170P-201ENST00000362832 ENSAO43768 121 aaKnown RBP-1.07□□□□□ -2.58
RNU6-170P-201ENST00000362832 CIB2O75838 187 aa-1.07□□□□□ -2.58
RNU6-170P-201ENST00000362832 SULT1A3P0DMM9 295 aa-1.07□□□□□ -2.58
RNU6-170P-201ENST00000362832 SULT1A4P0DMN0 295 aa-1.07□□□□□ -2.58
RNU6-170P-201ENST00000362832 F8A1P23610 371 aa-1.07□□□□□ -2.58
RNU6-170P-201ENST00000362832 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP-1.07□□□□□ -2.58
RNU6-170P-201ENST00000362832 SSR2P43308 183 aa-1.07□□□□□ -2.58
RNU6-170P-201ENST00000362832 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP-1.07□□□□□ -2.58
RNU6-170P-201ENST00000362832 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP-1.07□□□□□ -2.58
RNU6-170P-201ENST00000362832 OR4D1Q15615 310 aa-1.07□□□□□ -2.58
RNU6-170P-201ENST00000362832 SPANXN2Q5MJ10 180 aa-1.07□□□□□ -2.58
RNU6-170P-201ENST00000362832 FAHD1Q6P587 224 aa-1.07□□□□□ -2.58
RNU6-170P-201ENST00000362832 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP-1.07□□□□□ -2.58
RNU6-170P-201ENST00000362832 VMO1Q7Z5L0 202 aa-1.07□□□□□ -2.58
RNU6-170P-201ENST00000362832 SPATA24Q86W54 205 aa-1.07□□□□□ -2.58
RNU6-170P-201ENST00000362832 GPHB5Q86YW7 130 aa-1.07□□□□□ -2.58
RNU6-170P-201ENST00000362832 OR5B17Q8NGF7 314 aa-1.07□□□□□ -2.58
RNU6-170P-201ENST00000362832 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa-1.07□□□□□ -2.58
RNU6-170P-201ENST00000362832 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP-1.07□□□□□ -2.58
RNU6-170P-201ENST00000362832 TMEM239Q8WW34 195 aa-1.07□□□□□ -2.58
RNU6-170P-201ENST00000362832 PSMF1Q92530 271 aa-1.07□□□□□ -2.58
RNU6-170P-201ENST00000362832 OR8D2Q9GZM6 311 aa-1.07□□□□□ -2.58
RNU6-170P-201ENST00000362832 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa-1.07□□□□□ -2.58
RNU6-170P-201ENST00000362832 DMAC2Q9NW81 257 aa-1.07□□□□□ -2.58
RNU6-170P-201ENST00000362832 SDHAF2Q9NX18 166 aa-1.07□□□□□ -2.58
RNU6-170P-201ENST00000362832 TAS2R13Q9NYV9 303 aa-1.07□□□□□ -2.58
RNU6-170P-201ENST00000362832 ACANP16112 2415 aa-1.07□□□□□ -2.58
RNU6-170P-201ENST00000362832 CHD9Q3L8U1 2897 aa-1.07□□□□□ -2.58
RNU6-170P-201ENST00000362832 STAB2Q8WWQ8 2551 aa-1.08□□□□□ -2.58
RNU6-170P-201ENST00000362832 CCL16O15467 120 aa-1.08□□□□□ -2.58
RNU6-170P-201ENST00000362832 CYTH3O43739 400 aa-1.08□□□□□ -2.58
RNU6-170P-201ENST00000362832 NUPR1O60356 82 aa-1.08□□□□□ -2.58
RNU6-170P-201ENST00000362832 LYZL6O75951 148 aa-1.08□□□□□ -2.58
RNU6-170P-201ENST00000362832 UBL3O95164 117 aa-1.08□□□□□ -2.58
RNU6-170P-201ENST00000362832 VAPBO95292 243 aa-1.08□□□□□ -2.58
RNU6-170P-201ENST00000362832 NSA2O95478 260 aaKnown RBP-1.08□□□□□ -2.58
RNU6-170P-201ENST00000362832 KRT7P08729 469 aa-1.08□□□□□ -2.58
RNU6-170P-201ENST00000362832 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP-1.08□□□□□ -2.58
RNU6-170P-201ENST00000362832 DESP17661 470 aa-1.08□□□□□ -2.58
RNU6-170P-201ENST00000362832 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP-1.08□□□□□ -2.58
RNU6-170P-201ENST00000362832 HLA-DMBP28068 263 aa-1.08□□□□□ -2.58
RNU6-170P-201ENST00000362832 CD40LGP29965 261 aa-1.08□□□□□ -2.58
RNU6-170P-201ENST00000362832 UGT2B10P36537 528 aa-1.08□□□□□ -2.58
RNU6-170P-201ENST00000362832 ARR3P36575 388 aa-1.08□□□□□ -2.58
RNU6-170P-201ENST00000362832 RPS5P46782 204 aaKnown RBP-1.08□□□□□ -2.58
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP-1.08□□□□□ -2.58
RNU6-170P-201ENST00000362832 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP-1.08□□□□□ -2.58
RNU6-170P-201ENST00000362832 BTN3A2P78410 334 aa-1.08□□□□□ -2.58
RNU6-170P-201ENST00000362832 HLA-DRB3P79483 266 aa-1.08□□□□□ -2.58
RNU6-170P-201ENST00000362832 RHOGP84095 191 aa-1.08□□□□□ -2.58
RNU6-170P-201ENST00000362832 LINC01554Q52M75 96 aa-1.08□□□□□ -2.58
RNU6-170P-201ENST00000362832 CDKL4Q5MAI5 379 aa-1.08□□□□□ -2.58
RNU6-170P-201ENST00000362832 FAM74A1Q5RGS3 127 aa-1.08□□□□□ -2.58
RNU6-170P-201ENST00000362832 HBMQ6B0K9 141 aa-1.08□□□□□ -2.58
RNU6-170P-201ENST00000362832 Q6ZQT0 140 aa-1.08□□□□□ -2.58
RNU6-170P-201ENST00000362832 OR4D11Q8NGI4 311 aa-1.08□□□□□ -2.58
RNU6-170P-201ENST00000362832 OR52K2Q8NGK3 314 aa-1.08□□□□□ -2.58
RNU6-170P-201ENST00000362832 C4orf3Q8WVX3 66 aa-1.08□□□□□ -2.58
RNU6-170P-201ENST00000362832 CDKL2Q92772 493 aa-1.08□□□□□ -2.58
RNU6-170P-201ENST00000362832 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP-1.08□□□□□ -2.58
RNU6-170P-201ENST00000362832 LZTFL1Q9NQ48 299 aa-1.08□□□□□ -2.58
RNU6-170P-201ENST00000362832 CHD5Q8TDI0 1954 aa-1.08□□□□□ -2.58
RNU6-170P-201ENST00000362832 FAT2Q9NYQ8 4349 aa-1.08□□□□□ -2.58
RNU6-170P-201ENST00000362832 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa-1.09□□□□□ -2.58
RNU6-170P-201ENST00000362832 M0R381 172 aa-1.09□□□□□ -2.58
RNU6-170P-201ENST00000362832 LEPROTO15243 131 aa-1.09□□□□□ -2.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 153.5 ms