RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000342084.8

PTPRR-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene PTPRR, Length 2,037 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-202ENST00000342084 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP6.01□□□□□ -1.45
PTPRR-202ENST00000342084 TGOLN2O43493 480 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRR-202ENST00000342084 FOXH1O75593 365 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRR-202ENST00000342084 TNFSF13O75888 250 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRR-202ENST00000342084 GZMBP10144 247 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRR-202ENST00000342084 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP6.01□□□□□ -1.45
PTPRR-202ENST00000342084 HTD2P86397 168 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRR-202ENST00000342084 RELBQ01201 579 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRR-202ENST00000342084 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
PTPRR-202ENST00000342084 C4orf48Q5BLP8 95 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRR-202ENST00000342084 ACTL10Q5JWF8 245 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRR-202ENST00000342084 SEM1Q6ZVN7 128 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRR-202ENST00000342084 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP6.01□□□□□ -1.45
PTPRR-202ENST00000342084 FAM90A1Q86YD7 464 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRR-202ENST00000342084 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
PTPRR-202ENST00000342084 C1orf159Q96HA4 380 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRR-202ENST00000342084 OR2V2Q96R30 315 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRR-202ENST00000342084 GGTLC1Q9BX51 225 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRR-202ENST00000342084 HINT2Q9BX68 163 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRR-202ENST00000342084 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
PTPRR-202ENST00000342084 PXMP4Q9Y6I8 212 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRR-202ENST00000342084 HCFC1P51610 2035 aa6□□□□□ -1.45
PTPRR-202ENST00000342084 A0A087X0M5 115 aa6□□□□□ -1.45
PTPRR-202ENST00000342084 A0A1B0GV90 55 aa6□□□□□ -1.45
PTPRR-202ENST00000342084 A0A1B0GX30 115 aa6□□□□□ -1.45
PTPRR-202ENST00000342084 ZNF320A2RRD8 509 aa6□□□□□ -1.45
PTPRR-202ENST00000342084 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
PTPRR-202ENST00000342084 PRR33A8MZF0 331 aa6□□□□□ -1.45
PTPRR-202ENST00000342084 SRRM5B3KS81 715 aa6□□□□□ -1.45
PTPRR-202ENST00000342084 PRSS46E5RG02 174 aa6□□□□□ -1.45
PTPRR-202ENST00000342084 GATCO43716 136 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
PTPRR-202ENST00000342084 GFRA3O60609 400 aa6□□□□□ -1.45
PTPRR-202ENST00000342084 GGCTO75223 188 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
PTPRR-202ENST00000342084 HPRT1P00492 218 aa6□□□□□ -1.45
PTPRR-202ENST00000342084 IGLV1-44P01699 117 aa6□□□□□ -1.45
PTPRR-202ENST00000342084 ADH4P08319 380 aa6□□□□□ -1.45
PTPRR-202ENST00000342084 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
PTPRR-202ENST00000342084 DDTP30046 118 aa6□□□□□ -1.45
PTPRR-202ENST00000342084 GNG10P50151 68 aa6□□□□□ -1.45
PTPRR-202ENST00000342084 LOXL3P58215 753 aa6□□□□□ -1.45
PTPRR-202ENST00000342084 DEFB109BQ30KR1 87 aa6□□□□□ -1.45
PTPRR-202ENST00000342084 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa6□□□□□ -1.45
PTPRR-202ENST00000342084 DEFB124Q8NES8 71 aa6□□□□□ -1.45
PTPRR-202ENST00000342084 DEFB108BQ8NET1 73 aa6□□□□□ -1.45
PTPRR-202ENST00000342084 STARD4Q96DR4 205 aa6□□□□□ -1.45
PTPRR-202ENST00000342084 DIRC2Q96SL1 478 aa6□□□□□ -1.45
PTPRR-202ENST00000342084 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
PTPRR-202ENST00000342084 CALYQ9NYX4 217 aa6□□□□□ -1.45
PTPRR-202ENST00000342084 DKK4Q9UBT3 224 aa6□□□□□ -1.45
PTPRR-202ENST00000342084 TCF19Q9Y242 345 aa6□□□□□ -1.45
PTPRR-202ENST00000342084 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
PTPRR-202ENST00000342084 NUPR1O60356 82 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRR-202ENST00000342084 SPCS3P61009 180 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRR-202ENST00000342084 ERVK-16P61578 105 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRR-202ENST00000342084 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
PTPRR-202ENST00000342084 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
PTPRR-202ENST00000342084 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
PTPRR-202ENST00000342084 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
PTPRR-202ENST00000342084 MOB3BQ86TA1 216 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRR-202ENST00000342084 TMEM256Q8N2U0 113 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRR-202ENST00000342084 ITLN1Q8WWA0 313 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRR-202ENST00000342084 S1PR3Q99500 378 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRR-202ENST00000342084 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
PTPRR-202ENST00000342084 DCAF16Q9NXF7 216 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRR-202ENST00000342084 JPT1Q9UK76 154 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRR-202ENST00000342084 PROCRQ9UNN8 238 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRR-202ENST00000342084 SVILO95425 2214 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRR-202ENST00000342084 DCHS1Q96JQ0 3298 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRR-202ENST00000342084 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRR-202ENST00000342084 F6UZH7 168 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRR-202ENST00000342084 MMP23AO75900 390 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRR-202ENST00000342084 ACTL6BO94805 426 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRR-202ENST00000342084 CGAP01215 116 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRR-202ENST00000342084 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
PTPRR-202ENST00000342084 OR4A8P0C604 315 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRR-202ENST00000342084 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRR-202ENST00000342084 RNF224P0DH78 156 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRR-202ENST00000342084 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
PTPRR-202ENST00000342084 SRP14P37108 136 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
PTPRR-202ENST00000342084 PKIAP61925 76 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRR-202ENST00000342084 C17orf58Q2M2W7 97 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRR-202ENST00000342084 HLA-DRB5Q30154 266 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRR-202ENST00000342084 CT45A1Q5HYN5 189 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRR-202ENST00000342084 ZNF664Q8N3J9 261 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRR-202ENST00000342084 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRR-202ENST00000342084 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
PTPRR-202ENST00000342084 CT45A3Q8NHU0 189 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRR-202ENST00000342084 IMMP2LQ96T52 175 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRR-202ENST00000342084 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRR-202ENST00000342084 KCNIP2Q9NS61 270 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRR-202ENST00000342084 SLC25A15Q9Y619 301 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRR-202ENST00000342084 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
PTPRR-202ENST00000342084 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
PTPRR-202ENST00000342084 CADP27708 2225 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRR-202ENST00000342084 GRIFINA4D1Z8 144 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRR-202ENST00000342084 AHRRA9YTQ3 701 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRR-202ENST00000342084 TSTD3H0UI37 97 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRR-202ENST00000342084 SLC17A3O00476 420 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRR-202ENST00000342084 MGST3O14880 152 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRR-202ENST00000342084 PDE6DO43924 150 aa5.98□□□□□ -1.45
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