RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000336070.11

FRMD1-202, Transcript of FERM domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene FRMD1, Length 1,600 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD1-202ENST00000336070 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa14.68□□□□□ -0.06
FRMD1-202ENST00000336070 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
FRMD1-202ENST00000336070 HSPB7Q9UBY9 170 aa14.68□□□□□ -0.06
FRMD1-202ENST00000336070 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa14.67□□□□□ -0.06
FRMD1-202ENST00000336070 MED6O75586 246 aa14.67□□□□□ -0.06
FRMD1-202ENST00000336070 KBTBD11O94819 623 aa14.67□□□□□ -0.06
FRMD1-202ENST00000336070 OR9G9P0C7N8 305 aa14.67□□□□□ -0.06
FRMD1-202ENST00000336070 LYL1P12980 280 aa14.67□□□□□ -0.06
FRMD1-202ENST00000336070 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
FRMD1-202ENST00000336070 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
FRMD1-202ENST00000336070 SPNS3Q6ZMD2 512 aa14.67□□□□□ -0.06
FRMD1-202ENST00000336070 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
FRMD1-202ENST00000336070 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa14.67□□□□□ -0.06
FRMD1-202ENST00000336070 ABCA1O95477 2261 aa14.67□□□□□ -0.06
FRMD1-202ENST00000336070 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa14.66□□□□□ -0.06
FRMD1-202ENST00000336070 A0A0U1RQK1 487 aa14.66□□□□□ -0.06
FRMD1-202ENST00000336070 C15orf61A6NNL5 157 aa14.66□□□□□ -0.06
FRMD1-202ENST00000336070 SMLR1H3BR10 107 aa14.66□□□□□ -0.06
FRMD1-202ENST00000336070 K7EPK0 472 aa14.66□□□□□ -0.06
FRMD1-202ENST00000336070 DEDDO75618 318 aa14.66□□□□□ -0.06
FRMD1-202ENST00000336070 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
FRMD1-202ENST00000336070 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
FRMD1-202ENST00000336070 TNFRSF9Q07011 255 aa14.66□□□□□ -0.06
FRMD1-202ENST00000336070 HES1Q14469 280 aa14.66□□□□□ -0.06
FRMD1-202ENST00000336070 PSG5Q15238 335 aa14.66□□□□□ -0.06
FRMD1-202ENST00000336070 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa14.66□□□□□ -0.06
FRMD1-202ENST00000336070 RITA1Q96K30 269 aa14.66□□□□□ -0.06
FRMD1-202ENST00000336070 RNF126Q9BV68 326 aa14.66□□□□□ -0.06
FRMD1-202ENST00000336070 TMEM14BQ9NUH8 114 aa14.66□□□□□ -0.06
FRMD1-202ENST00000336070 C1RLQ9NZP8 487 aa14.66□□□□□ -0.06
FRMD1-202ENST00000336070 ITPR3Q14573 2671 aa14.66□□□□□ -0.06
FRMD1-202ENST00000336070 WRBO00258 174 aa14.66□□□□□ -0.06
FRMD1-202ENST00000336070 NDUFA3O95167 84 aa14.66□□□□□ -0.06
FRMD1-202ENST00000336070 SCGB1D2O95969 90 aa14.66□□□□□ -0.06
FRMD1-202ENST00000336070 CRYGBP07316 175 aa14.66□□□□□ -0.06
FRMD1-202ENST00000336070 S100A10P60903 97 aa14.66□□□□□ -0.06
FRMD1-202ENST00000336070 SPCS3P61009 180 aa14.66□□□□□ -0.06
FRMD1-202ENST00000336070 Q8N6K4 173 aa14.66□□□□□ -0.06
FRMD1-202ENST00000336070 OR5B3Q8NH48 314 aa14.66□□□□□ -0.06
FRMD1-202ENST00000336070 RAB40CQ96S21 281 aa14.66□□□□□ -0.06
FRMD1-202ENST00000336070 KIAA1456Q9P272 454 aa14.66□□□□□ -0.06
FRMD1-202ENST00000336070 E5RGE8 158 aa14.65□□□□□ -0.06
FRMD1-202ENST00000336070 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa14.65□□□□□ -0.06
FRMD1-202ENST00000336070 NBR2O15453 112 aa14.65□□□□□ -0.06
FRMD1-202ENST00000336070 SYNGR2O43760 224 aa14.65□□□□□ -0.06
FRMD1-202ENST00000336070 MAS1LP35410 378 aa14.65□□□□□ -0.06
FRMD1-202ENST00000336070 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
FRMD1-202ENST00000336070 RPL8P62917 257 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
FRMD1-202ENST00000336070 ZNF546Q86UE3 836 aa14.65□□□□□ -0.06
FRMD1-202ENST00000336070 PPP1R27Q86WC6 154 aa14.65□□□□□ -0.06
FRMD1-202ENST00000336070 MMD2Q8IY49 270 aa14.65□□□□□ -0.06
FRMD1-202ENST00000336070 OR11H4Q8NGC9 324 aa14.65□□□□□ -0.06
FRMD1-202ENST00000336070 NSG2Q9Y328 171 aa14.65□□□□□ -0.06
FRMD1-202ENST00000336070 SIGLEC9Q9Y336 463 aa14.65□□□□□ -0.06
FRMD1-202ENST00000336070 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
FRMD1-202ENST00000336070 H0YIZ8 118 aa14.64□□□□□ -0.07
FRMD1-202ENST00000336070 RRHO14718 337 aa14.64□□□□□ -0.07
FRMD1-202ENST00000336070 SLC25A17O43808 307 aa14.64□□□□□ -0.07
FRMD1-202ENST00000336070 IFNA17P01571 189 aa14.64□□□□□ -0.07
FRMD1-202ENST00000336070 TMEM11P17152 192 aa14.64□□□□□ -0.07
FRMD1-202ENST00000336070 PAX6P26367 422 aa14.64□□□□□ -0.07
FRMD1-202ENST00000336070 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
FRMD1-202ENST00000336070 TAS2R30P59541 319 aa14.64□□□□□ -0.07
FRMD1-202ENST00000336070 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP14.64□□□□□ -0.07
FRMD1-202ENST00000336070 KRTAP1-1Q07627 177 aa14.64□□□□□ -0.07
FRMD1-202ENST00000336070 MMDQ15546 238 aa14.64□□□□□ -0.07
FRMD1-202ENST00000336070 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
FRMD1-202ENST00000336070 TMEM160Q9NX00 188 aa14.64□□□□□ -0.07
FRMD1-202ENST00000336070 MBD2Q9UBB5 411 aa14.64□□□□□ -0.07
FRMD1-202ENST00000336070 TRAV3A0A0B4J244 114 aa14.63□□□□□ -0.07
FRMD1-202ENST00000336070 CHST1O43916 411 aa14.63□□□□□ -0.07
FRMD1-202ENST00000336070 FOSL1P15407 271 aa14.63□□□□□ -0.07
FRMD1-202ENST00000336070 LRRC75BQ2VPJ9 315 aa14.63□□□□□ -0.07
FRMD1-202ENST00000336070 SSX3Q99909 188 aa14.63□□□□□ -0.07
FRMD1-202ENST00000336070 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
FRMD1-202ENST00000336070 COMMD5Q9GZQ3 224 aa14.63□□□□□ -0.07
FRMD1-202ENST00000336070 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
FRMD1-202ENST00000336070 WSB1Q9Y6I7 421 aa14.63□□□□□ -0.07
FRMD1-202ENST00000336070 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa14.63□□□□□ -0.07
FRMD1-202ENST00000336070 GPR137BO60478 399 aa14.63□□□□□ -0.07
FRMD1-202ENST00000336070 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
FRMD1-202ENST00000336070 F2RL1P55085 397 aa14.63□□□□□ -0.07
FRMD1-202ENST00000336070 HNF4GQ14541 408 aa14.63□□□□□ -0.07
FRMD1-202ENST00000336070 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
FRMD1-202ENST00000336070 PLSCR3Q9NRY6 295 aa14.63□□□□□ -0.07
FRMD1-202ENST00000336070 PITPNC1Q9UKF7 332 aa14.63□□□□□ -0.07
FRMD1-202ENST00000336070 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
FRMD1-202ENST00000336070 OR51B2Q9Y5P1 312 aa14.63□□□□□ -0.07
FRMD1-202ENST00000336070 SVEP1Q4LDE5 3571 aa14.62□□□□□ -0.07
FRMD1-202ENST00000336070 L7N2F9 121 aa14.62□□□□□ -0.07
FRMD1-202ENST00000336070 ACTL6BO94805 426 aa14.62□□□□□ -0.07
FRMD1-202ENST00000336070 CD24P25063 80 aa14.62□□□□□ -0.07
FRMD1-202ENST00000336070 P2RY1P47900 373 aa14.62□□□□□ -0.07
FRMD1-202ENST00000336070 OR2B8PP59922 312 aa14.62□□□□□ -0.07
FRMD1-202ENST00000336070 VAMP2P63027 116 aa14.62□□□□□ -0.07
FRMD1-202ENST00000336070 PRSS8Q16651 343 aa14.62□□□□□ -0.07
FRMD1-202ENST00000336070 PIFOQ8TCI5 191 aa14.62□□□□□ -0.07
FRMD1-202ENST00000336070 DCUN1D4Q92564 292 aa14.62□□□□□ -0.07
FRMD1-202ENST00000336070 SMIM8Q96KF7 97 aa14.62□□□□□ -0.07
FRMD1-202ENST00000336070 PRDM13Q9H4Q3 707 aa14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.7 ms