RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000324659.12

NLRC3-201, Transcript of NLR family CARD domain containing 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene NLRC3, Length 3,414 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRC3-201ENST00000324659 J3QT63 122 aa10.11□□□□□ -0.79
NLRC3-201ENST00000324659 SPINK4O60575 86 aa10.11□□□□□ -0.79
NLRC3-201ENST00000324659 SP1P08047 785 aa10.11□□□□□ -0.79
NLRC3-201ENST00000324659 ARR3P36575 388 aa10.11□□□□□ -0.79
NLRC3-201ENST00000324659 MRGPRDQ8TDS7 321 aa10.11□□□□□ -0.79
NLRC3-201ENST00000324659 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP10.11□□□□□ -0.79
NLRC3-201ENST00000324659 C17orf98A8MV24 154 aa10.11□□□□□ -0.79
NLRC3-201ENST00000324659 SLC25A6P12236 298 aa10.11□□□□□ -0.79
NLRC3-201ENST00000324659 COL8A2P25067 703 aa10.11□□□□□ -0.79
NLRC3-201ENST00000324659 EDDM3BP56851 147 aa10.11□□□□□ -0.79
NLRC3-201ENST00000324659 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP10.11□□□□□ -0.79
NLRC3-201ENST00000324659 VAMP3Q15836 100 aa10.11□□□□□ -0.79
NLRC3-201ENST00000324659 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP10.11□□□□□ -0.79
NLRC3-201ENST00000324659 OR10P1Q8NGE3 313 aa10.11□□□□□ -0.79
NLRC3-201ENST00000324659 SGMS2Q8NHU3 365 aa10.11□□□□□ -0.79
NLRC3-201ENST00000324659 MPC1Q9Y5U8 109 aa10.11□□□□□ -0.79
NLRC3-201ENST00000324659 PLCE1Q9P212 2302 aa10.11□□□□□ -0.79
NLRC3-201ENST00000324659 PSPNO60542 156 aa10.11□□□□□ -0.79
NLRC3-201ENST00000324659 AGFG2O95081 481 aa10.11□□□□□ -0.79
NLRC3-201ENST00000324659 RAC2P15153 192 aa10.11□□□□□ -0.79
NLRC3-201ENST00000324659 GABRA2P47869 451 aa10.11□□□□□ -0.79
NLRC3-201ENST00000324659 FABP6P51161 128 aa10.11□□□□□ -0.79
NLRC3-201ENST00000324659 ZNF497Q6ZNH5 498 aa10.11□□□□□ -0.79
NLRC3-201ENST00000324659 OBP2BQ9NPH6 170 aa10.11□□□□□ -0.79
NLRC3-201ENST00000324659 MED13LQ71F56 2210 aa10.1□□□□□ -0.79
NLRC3-201ENST00000324659 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa10.1□□□□□ -0.79
NLRC3-201ENST00000324659 C11orf94C9JXX5 98 aa10.1□□□□□ -0.79
NLRC3-201ENST00000324659 CBLN1P23435 193 aa10.1□□□□□ -0.79
NLRC3-201ENST00000324659 PPP1CBP62140 327 aa10.1□□□□□ -0.79
NLRC3-201ENST00000324659 OR5AU1Q8NGC0 362 aa10.1□□□□□ -0.79
NLRC3-201ENST00000324659 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP10.1□□□□□ -0.79
NLRC3-201ENST00000324659 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa10.1□□□□□ -0.79
NLRC3-201ENST00000324659 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa10.1□□□□□ -0.79
NLRC3-201ENST00000324659 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP10.1□□□□□ -0.79
NLRC3-201ENST00000324659 SERF1AO75920 110 aa10.1□□□□□ -0.79
NLRC3-201ENST00000324659 ATP5G3P48201 142 aa10.1□□□□□ -0.79
NLRC3-201ENST00000324659 PDLIM4P50479 330 aa10.1□□□□□ -0.79
NLRC3-201ENST00000324659 C5orf30Q96GV9 206 aa10.1□□□□□ -0.79
NLRC3-201ENST00000324659 RTL8AQ9BWD3 113 aa10.1□□□□□ -0.79
NLRC3-201ENST00000324659 WNT10AQ9GZT5 417 aa10.1□□□□□ -0.79
NLRC3-201ENST00000324659 KCNIP1Q9NZI2 227 aa10.1□□□□□ -0.79
NLRC3-201ENST00000324659 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP10.1□□□□□ -0.79
NLRC3-201ENST00000324659 PMCHP20382 165 aa10.1□□□□□ -0.79
NLRC3-201ENST00000324659 ADMP35318 185 aa10.1□□□□□ -0.79
NLRC3-201ENST00000324659 SPATA45Q537H7 98 aa10.1□□□□□ -0.79
NLRC3-201ENST00000324659 CLEC2AQ6UVW9 174 aa10.1□□□□□ -0.79
NLRC3-201ENST00000324659 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa10.1□□□□□ -0.79
NLRC3-201ENST00000324659 LYG1Q8N1E2 194 aa10.1□□□□□ -0.79
NLRC3-201ENST00000324659 NINJ1Q92982 152 aa10.1□□□□□ -0.79
NLRC3-201ENST00000324659 LINC00470Q9BZP3 86 aa10.1□□□□□ -0.79
NLRC3-201ENST00000324659 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
NLRC3-201ENST00000324659 CRISP2P16562 243 aa10.09□□□□□ -0.79
NLRC3-201ENST00000324659 COX5AP20674 150 aa10.09□□□□□ -0.79
NLRC3-201ENST00000324659 SSTR5P35346 364 aa10.09□□□□□ -0.79
NLRC3-201ENST00000324659 THBS3P49746 956 aa10.09□□□□□ -0.79
NLRC3-201ENST00000324659 RANP62826 216 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
NLRC3-201ENST00000324659 LINC00596Q86U02 117 aa10.09□□□□□ -0.79
NLRC3-201ENST00000324659 STARD4Q96DR4 205 aa10.09□□□□□ -0.79
NLRC3-201ENST00000324659 PYGO2Q9BRQ0 406 aa10.09□□□□□ -0.79
NLRC3-201ENST00000324659 TMEM147Q9BVK8 224 aa10.09□□□□□ -0.79
NLRC3-201ENST00000324659 NPCDR1Q9BY65 106 aa10.09□□□□□ -0.79
NLRC3-201ENST00000324659 DUSP13Q9UII6 198 aa10.09□□□□□ -0.79
NLRC3-201ENST00000324659 C12orf77C9JDV5 145 aa10.09□□□□□ -0.79
NLRC3-201ENST00000324659 DIRC3C9JPN6 131 aa10.09□□□□□ -0.79
NLRC3-201ENST00000324659 SH2D1BO14796 132 aa10.09□□□□□ -0.79
NLRC3-201ENST00000324659 C1QTNF9P0C862 333 aa10.09□□□□□ -0.79
NLRC3-201ENST00000324659 TGFBR3Q03167 851 aa10.09□□□□□ -0.79
NLRC3-201ENST00000324659 MSMO1Q15800 293 aa10.09□□□□□ -0.79
NLRC3-201ENST00000324659 ATP6V1FQ16864 119 aa10.09□□□□□ -0.79
NLRC3-201ENST00000324659 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa10.09□□□□□ -0.79
NLRC3-201ENST00000324659 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa10.09□□□□□ -0.79
NLRC3-201ENST00000324659 GALMQ96C23 342 aa10.09□□□□□ -0.79
NLRC3-201ENST00000324659 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP10.09□□□□□ -0.79
NLRC3-201ENST00000324659 DCTN5Q9BTE1 182 aa10.09□□□□□ -0.79
NLRC3-201ENST00000324659 PCSK5Q92824 1860 aa10.09□□□□□ -0.79
NLRC3-201ENST00000324659 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa10.08□□□□□ -0.8
NLRC3-201ENST00000324659 LRRC30A6NM36 301 aa10.08□□□□□ -0.8
NLRC3-201ENST00000324659 NDUFB4O95168 129 aa10.08□□□□□ -0.8
NLRC3-201ENST00000324659 NPPCP23582 126 aa10.08□□□□□ -0.8
NLRC3-201ENST00000324659 C20orf144Q9BQM9 153 aa10.08□□□□□ -0.8
NLRC3-201ENST00000324659 HIPK2Q9H2X6 1198 aa10.08□□□□□ -0.8
NLRC3-201ENST00000324659 WISP2O76076 250 aa10.08□□□□□ -0.8
NLRC3-201ENST00000324659 HAND1O96004 215 aa10.08□□□□□ -0.8
NLRC3-201ENST00000324659 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP10.08□□□□□ -0.8
NLRC3-201ENST00000324659 EDDM3AQ14507 147 aa10.08□□□□□ -0.8
NLRC3-201ENST00000324659 NRN1LQ496H8 165 aa10.08□□□□□ -0.8
NLRC3-201ENST00000324659 RNFT1Q5M7Z0 435 aa10.08□□□□□ -0.8
NLRC3-201ENST00000324659 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa10.08□□□□□ -0.8
NLRC3-201ENST00000324659 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa10.08□□□□□ -0.8
NLRC3-201ENST00000324659 TMEM178AQ8NBL3 297 aa10.08□□□□□ -0.8
NLRC3-201ENST00000324659 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP10.08□□□□□ -0.8
NLRC3-201ENST00000324659 WIPI2Q9Y4P8 454 aa10.08□□□□□ -0.8
NLRC3-201ENST00000324659 NKX6-3A6NJ46 265 aa10.08□□□□□ -0.8
NLRC3-201ENST00000324659 F2Z2F3 143 aa10.08□□□□□ -0.8
NLRC3-201ENST00000324659 HBZP02008 142 aa10.08□□□□□ -0.8
NLRC3-201ENST00000324659 PKIBQ9C010 78 aa10.08□□□□□ -0.8
NLRC3-201ENST00000324659 PSG11Q9UQ72 335 aa10.08□□□□□ -0.8
NLRC3-201ENST00000324659 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa10.08□□□□□ -0.8
NLRC3-201ENST00000324659 SELENOKQ9Y6D0 94 aa10.08□□□□□ -0.8
NLRC3-201ENST00000324659 RNF212BA8MTL3 300 aa10.07□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.5 ms