RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296026.4

CXCL3-201, Transcript of C-X-C motif chemokine ligand 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CXCL3, Length 1,075 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3-201ENST00000296026 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
CXCL3-201ENST00000296026 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
CXCL3-201ENST00000296026 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
CXCL3-201ENST00000296026 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa14.81□□□□□ -0.04
CXCL3-201ENST00000296026 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
CXCL3-201ENST00000296026 TAS2R8Q9NYW2 309 aa14.81□□□□□ -0.04
CXCL3-201ENST00000296026 DAPK2Q9UIK4 370 aa14.81□□□□□ -0.04
CXCL3-201ENST00000296026 ANXA10Q9UJ72 324 aa14.81□□□□□ -0.04
CXCL3-201ENST00000296026 C2orf70A6NJV1 201 aa14.8□□□□□ -0.04
CXCL3-201ENST00000296026 NPIPB5A8MRT5 1133 aa14.8□□□□□ -0.04
CXCL3-201ENST00000296026 E7EUB6 86 aa14.8□□□□□ -0.04
CXCL3-201ENST00000296026 GGCTO75223 188 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
CXCL3-201ENST00000296026 SCGNO76038 276 aa14.8□□□□□ -0.04
CXCL3-201ENST00000296026 FOLR2P14207 255 aa14.8□□□□□ -0.04
CXCL3-201ENST00000296026 KIR2DS2P43631 304 aa14.8□□□□□ -0.04
CXCL3-201ENST00000296026 BRWD1-AS2P59051 145 aa14.8□□□□□ -0.04
CXCL3-201ENST00000296026 GABARAPL2P60520 117 aa14.8□□□□□ -0.04
CXCL3-201ENST00000296026 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
CXCL3-201ENST00000296026 GUCA2BQ16661 112 aa14.8□□□□□ -0.04
CXCL3-201ENST00000296026 UBE2UQ5VVX9 321 aa14.8□□□□□ -0.04
CXCL3-201ENST00000296026 MFSD4AQ8N468 514 aa14.8□□□□□ -0.04
CXCL3-201ENST00000296026 DEFB125Q8N687 156 aa14.8□□□□□ -0.04
CXCL3-201ENST00000296026 FAM110AQ9BQ89 295 aa14.8□□□□□ -0.04
CXCL3-201ENST00000296026 SLC2A9Q9NRM0 540 aa14.8□□□□□ -0.04
CXCL3-201ENST00000296026 RAB26Q9ULW5 256 aa14.8□□□□□ -0.04
CXCL3-201ENST00000296026 LGALS9O00182 355 aa14.79□□□□□ -0.04
CXCL3-201ENST00000296026 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
CXCL3-201ENST00000296026 IGHV3-23P01764 117 aa14.79□□□□□ -0.04
CXCL3-201ENST00000296026 ZNF735P0CB33 412 aa14.79□□□□□ -0.04
CXCL3-201ENST00000296026 PSMB9P28065 219 aa14.79□□□□□ -0.04
CXCL3-201ENST00000296026 MAS1LP35410 378 aa14.79□□□□□ -0.04
CXCL3-201ENST00000296026 ZNF66Q6ZN08 573 aa14.79□□□□□ -0.04
CXCL3-201ENST00000296026 TPRA1Q86W33 373 aa14.79□□□□□ -0.04
CXCL3-201ENST00000296026 LGALS14Q8TCE9 139 aa14.79□□□□□ -0.04
CXCL3-201ENST00000296026 GPHA2Q96T91 129 aa14.79□□□□□ -0.04
CXCL3-201ENST00000296026 WFDC10AQ9H1F0 79 aa14.79□□□□□ -0.04
CXCL3-201ENST00000296026 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
CXCL3-201ENST00000296026 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
CXCL3-201ENST00000296026 S4R3C0 116 aa14.79□□□□□ -0.04
CXCL3-201ENST00000296026 A0A1B0GW64 132 aa14.78□□□□□ -0.04
CXCL3-201ENST00000296026 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
CXCL3-201ENST00000296026 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
CXCL3-201ENST00000296026 OR11H12B2RN74 326 aa14.78□□□□□ -0.04
CXCL3-201ENST00000296026 NDUFB8O95169 186 aa14.78□□□□□ -0.04
CXCL3-201ENST00000296026 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
CXCL3-201ENST00000296026 AREGP15514 252 aa14.78□□□□□ -0.04
CXCL3-201ENST00000296026 ARL3P36405 182 aa14.78□□□□□ -0.04
CXCL3-201ENST00000296026 SFXN4Q6P4A7 337 aa14.78□□□□□ -0.04
CXCL3-201ENST00000296026 SSX9Q7RTT3 188 aa14.78□□□□□ -0.04
CXCL3-201ENST00000296026 SPARTQ8N0X7 666 aa14.78□□□□□ -0.04
CXCL3-201ENST00000296026 CCDC140Q96MF4 163 aa14.78□□□□□ -0.04
CXCL3-201ENST00000296026 FANCD2OSQ96PS1 177 aa14.78□□□□□ -0.04
CXCL3-201ENST00000296026 SRD5A3Q9H8P0 318 aa14.78□□□□□ -0.04
CXCL3-201ENST00000296026 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa14.78□□□□□ -0.04
CXCL3-201ENST00000296026 SACSQ9NZJ4 4579 aa14.77□□□□□ -0.04
CXCL3-201ENST00000296026 HRASP01112 189 aa14.77□□□□□ -0.05
CXCL3-201ENST00000296026 CRYGCP07315 174 aa14.77□□□□□ -0.05
CXCL3-201ENST00000296026 PSMB6P28072 239 aa14.77□□□□□ -0.05
CXCL3-201ENST00000296026 CLEC19AQ6UXS0 136 aa14.77□□□□□ -0.05
CXCL3-201ENST00000296026 GPHB5Q86YW7 130 aa14.77□□□□□ -0.05
CXCL3-201ENST00000296026 CACNG8Q8WXS5 425 aa14.77□□□□□ -0.05
CXCL3-201ENST00000296026 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
CXCL3-201ENST00000296026 RHBDL2Q9NX52 303 aa14.77□□□□□ -0.05
CXCL3-201ENST00000296026 SSR3Q9UNL2 185 aa14.77□□□□□ -0.05
CXCL3-201ENST00000296026 TNFSF12O43508 249 aa14.76□□□□□ -0.05
CXCL3-201ENST00000296026 DHFRP00374 187 aa14.76□□□□□ -0.05
CXCL3-201ENST00000296026 MYOD1P15172 320 aa14.76□□□□□ -0.05
CXCL3-201ENST00000296026 CBLN1P23435 193 aa14.76□□□□□ -0.05
CXCL3-201ENST00000296026 ARPC4P59998 168 aa14.76□□□□□ -0.05
CXCL3-201ENST00000296026 RPL8P62917 257 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
CXCL3-201ENST00000296026 BEST4Q8NFU0 473 aa14.76□□□□□ -0.05
CXCL3-201ENST00000296026 IL17DQ8TAD2 202 aa14.76□□□□□ -0.05
CXCL3-201ENST00000296026 SECTM1Q8WVN6 248 aa14.76□□□□□ -0.05
CXCL3-201ENST00000296026 CCL28Q9NRJ3 127 aa14.76□□□□□ -0.05
CXCL3-201ENST00000296026 SELENOKQ9Y6D0 94 aa14.76□□□□□ -0.05
CXCL3-201ENST00000296026 CSMD3Q7Z407 3707 aa14.75□□□□□ -0.05
CXCL3-201ENST00000296026 PTHLHP12272 177 aa14.75□□□□□ -0.05
CXCL3-201ENST00000296026 CTRB1P17538 263 aa14.75□□□□□ -0.05
CXCL3-201ENST00000296026 FCGR2CP31995 323 aa14.75□□□□□ -0.05
CXCL3-201ENST00000296026 FAM106AQ4KMX7 169 aa14.75□□□□□ -0.05
CXCL3-201ENST00000296026 CTRB2Q6GPI1 263 aa14.75□□□□□ -0.05
CXCL3-201ENST00000296026 FCGR1BQ92637 280 aa14.75□□□□□ -0.05
CXCL3-201ENST00000296026 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa14.75□□□□□ -0.05
CXCL3-201ENST00000296026 TRAV18A0A075B6X5 111 aa14.74□□□□□ -0.05
CXCL3-201ENST00000296026 ZNF320A2RRD8 509 aa14.74□□□□□ -0.05
CXCL3-201ENST00000296026 REG1AP05451 166 aa14.74□□□□□ -0.05
CXCL3-201ENST00000296026 DEFA4P12838 97 aa14.74□□□□□ -0.05
CXCL3-201ENST00000296026 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
CXCL3-201ENST00000296026 HLA-GP17693 338 aa14.74□□□□□ -0.05
CXCL3-201ENST00000296026 SDC2P34741 201 aa14.74□□□□□ -0.05
CXCL3-201ENST00000296026 MXD1Q05195 221 aa14.74□□□□□ -0.05
CXCL3-201ENST00000296026 KLK9Q2XQG4 91 aa14.74□□□□□ -0.05
CXCL3-201ENST00000296026 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa14.74□□□□□ -0.05
CXCL3-201ENST00000296026 OR4A47Q6IF82 309 aa14.74□□□□□ -0.05
CXCL3-201ENST00000296026 SPAG16Q8N0X2 631 aa14.74□□□□□ -0.05
CXCL3-201ENST00000296026 GVQW1Q8N7I0 195 aa14.74□□□□□ -0.05
CXCL3-201ENST00000296026 OR13F1Q8NGS4 319 aa14.74□□□□□ -0.05
CXCL3-201ENST00000296026 HRASLSQ9HDD0 168 aa14.74□□□□□ -0.05
CXCL3-201ENST00000296026 BET1LQ9NYM9 111 aa14.74□□□□□ -0.05
CXCL3-201ENST00000296026 KLK9Q9UKQ9 250 aa14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.1 ms