RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283628.9

UBP1-201, Transcript of upstream binding protein 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene UBP1, Length 2,074 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBP1-201ENST00000283628 TNFSF13O75888 250 aa23.17■■□□□ 1.3
UBP1-201ENST00000283628 CST9LP1Q5W188 147 aa23.17■■□□□ 1.3
UBP1-201ENST00000283628 RRHO14718 337 aa23.16■■□□□ 1.3
UBP1-201ENST00000283628 CGAP01215 116 aa23.16■■□□□ 1.3
UBP1-201ENST00000283628 SLC25A15Q9Y619 301 aa23.16■■□□□ 1.3
UBP1-201ENST00000283628 ATP5G3P48201 142 aa23.15■■□□□ 1.3
UBP1-201ENST00000283628 RPL39P5Q59GN2 51 aa23.15■■□□□ 1.3
UBP1-201ENST00000283628 STARD4Q96DR4 205 aa23.15■■□□□ 1.3
UBP1-201ENST00000283628 GGTLC1Q9BX51 225 aa23.15■■□□□ 1.3
UBP1-201ENST00000283628 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
UBP1-201ENST00000283628 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa23.15■■□□□ 1.3
UBP1-201ENST00000283628 RAB9BQ9NP90 201 aa23.15■■□□□ 1.3
UBP1-201ENST00000283628 TMEM140Q9NV12 185 aa23.15■■□□□ 1.3
UBP1-201ENST00000283628 STAG3L2P0CL84 134 aa23.15■■□□□ 1.3
UBP1-201ENST00000283628 STAG3L3P0CL85 134 aa23.15■■□□□ 1.3
UBP1-201ENST00000283628 RAB7AP51149 207 aa23.15■■□□□ 1.3
UBP1-201ENST00000283628 GCSAMQ8N6F7 178 aa23.15■■□□□ 1.3
UBP1-201ENST00000283628 MGST2Q99735 147 aa23.15■■□□□ 1.3
UBP1-201ENST00000283628 PXMP4Q9Y6I8 212 aa23.15■■□□□ 1.3
UBP1-201ENST00000283628 CXorf1O96002 111 aa23.14■■□□□ 1.29
UBP1-201ENST00000283628 CRYAAP02489 173 aa23.14■■□□□ 1.29
UBP1-201ENST00000283628 UBE2G2P60604 165 aa23.14■■□□□ 1.29
UBP1-201ENST00000283628 OR4S2Q8NH73 311 aa23.14■■□□□ 1.29
UBP1-201ENST00000283628 DDB2Q92466 427 aa23.14■■□□□ 1.29
UBP1-201ENST00000283628 PLPPR2Q96GM1 343 aa23.14■■□□□ 1.29
UBP1-201ENST00000283628 MS4A5Q9H3V2 200 aa23.14■■□□□ 1.29
UBP1-201ENST00000283628 NDUFB4O95168 129 aa23.13■■□□□ 1.29
UBP1-201ENST00000283628 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
UBP1-201ENST00000283628 ZNF134P52741 427 aa23.13■■□□□ 1.29
UBP1-201ENST00000283628 FAM234AQ9H0X4 552 aa23.13■■□□□ 1.29
UBP1-201ENST00000283628 CHODLQ9H9P2 273 aa23.13■■□□□ 1.29
UBP1-201ENST00000283628 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
UBP1-201ENST00000283628 FUT9Q9Y231 359 aa23.13■■□□□ 1.29
UBP1-201ENST00000283628 CHRNA7P36544 502 aa23.13■■□□□ 1.29
UBP1-201ENST00000283628 CLEC12BQ2HXU8 276 aa23.13■■□□□ 1.29
UBP1-201ENST00000283628 DEFB109BQ30KR1 87 aa23.13■■□□□ 1.29
UBP1-201ENST00000283628 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa23.13■■□□□ 1.29
UBP1-201ENST00000283628 MEGF10Q96KG7 1140 aa23.13■■□□□ 1.29
UBP1-201ENST00000283628 CALYQ9NYX4 217 aa23.13■■□□□ 1.29
UBP1-201ENST00000283628 DKK4Q9UBT3 224 aa23.13■■□□□ 1.29
UBP1-201ENST00000283628 TCF19Q9Y242 345 aa23.13■■□□□ 1.29
UBP1-201ENST00000283628 ARL14EPLP0DKL9 152 aa23.12■■□□□ 1.29
UBP1-201ENST00000283628 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
UBP1-201ENST00000283628 CEACAM4O75871 244 aa23.12■■□□□ 1.29
UBP1-201ENST00000283628 IGHV3-13P01766 116 aa23.12■■□□□ 1.29
UBP1-201ENST00000283628 FOXL1Q12952 345 aa23.12■■□□□ 1.29
UBP1-201ENST00000283628 OR5T1Q8NG75 326 aa23.12■■□□□ 1.29
UBP1-201ENST00000283628 NPVFQ9HCQ7 196 aa23.12■■□□□ 1.29
UBP1-201ENST00000283628 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
UBP1-201ENST00000283628 GZMBP10144 247 aa23.11■■□□□ 1.29
UBP1-201ENST00000283628 DDTP30046 118 aa23.11■■□□□ 1.29
UBP1-201ENST00000283628 TMEM144Q7Z5S9 345 aa23.11■■□□□ 1.29
UBP1-201ENST00000283628 OR2V2Q96R30 315 aa23.11■■□□□ 1.29
UBP1-201ENST00000283628 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa23.1■■□□□ 1.29
UBP1-201ENST00000283628 C15orf61A6NNL5 157 aa23.1■■□□□ 1.29
UBP1-201ENST00000283628 GCGP01275 180 aa23.1■■□□□ 1.29
UBP1-201ENST00000283628 MSMPQ1L6U9 139 aa23.1■■□□□ 1.29
UBP1-201ENST00000283628 FAM78BQ5VT40 261 aa23.1■■□□□ 1.29
UBP1-201ENST00000283628 LRP11Q86VZ4 500 aa23.1■■□□□ 1.29
UBP1-201ENST00000283628 ZNRF1Q8ND25 227 aa23.1■■□□□ 1.29
UBP1-201ENST00000283628 TMEM37Q8WXS4 190 aa23.1■■□□□ 1.29
UBP1-201ENST00000283628 URB1O60287 2271 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
UBP1-201ENST00000283628 TRAV3A0A0B4J244 114 aa23.1■■□□□ 1.29
UBP1-201ENST00000283628 LHBP01229 141 aa23.1■■□□□ 1.29
UBP1-201ENST00000283628 CGB3P0DN86 165 aa23.1■■□□□ 1.29
UBP1-201ENST00000283628 CGB7P0DN87 165 aa23.1■■□□□ 1.29
UBP1-201ENST00000283628 IL3RAP26951 378 aa23.1■■□□□ 1.29
UBP1-201ENST00000283628 MIC13Q5XKP0 118 aa23.1■■□□□ 1.29
UBP1-201ENST00000283628 ABHD12Q8N2K0 398 aa23.1■■□□□ 1.29
UBP1-201ENST00000283628 C14orf144Q96I85 54 aa23.1■■□□□ 1.29
UBP1-201ENST00000283628 DERL1Q9BUN8 251 aa23.1■■□□□ 1.29
UBP1-201ENST00000283628 PAX1P15863 534 aa23.09■■□□□ 1.29
UBP1-201ENST00000283628 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
UBP1-201ENST00000283628 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
UBP1-201ENST00000283628 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
UBP1-201ENST00000283628 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
UBP1-201ENST00000283628 MOGAT3Q86VF5 341 aa23.09■■□□□ 1.29
UBP1-201ENST00000283628 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
UBP1-201ENST00000283628 SFRP2Q96HF1 295 aa23.09■■□□□ 1.29
UBP1-201ENST00000283628 TMEM204Q9BSN7 226 aa23.09■■□□□ 1.29
UBP1-201ENST00000283628 REC114Q7Z4M0 266 aa23.08■■□□□ 1.29
UBP1-201ENST00000283628 TMEM18Q96B42 140 aa23.08■■□□□ 1.29
UBP1-201ENST00000283628 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.28
UBP1-201ENST00000283628 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
UBP1-201ENST00000283628 BMP5P22003 454 aa23.07■■□□□ 1.28
UBP1-201ENST00000283628 THBS3P49746 956 aa23.07■■□□□ 1.28
UBP1-201ENST00000283628 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
UBP1-201ENST00000283628 RPL15P61313 204 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
UBP1-201ENST00000283628 SDSLQ96GA7 329 aa23.07■■□□□ 1.28
UBP1-201ENST00000283628 TMEM14BQ9NUH8 114 aa23.07■■□□□ 1.28
UBP1-201ENST00000283628 PRR14LQ5THK1 2151 aa23.07■■□□□ 1.28
UBP1-201ENST00000283628 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa23.07■■□□□ 1.28
UBP1-201ENST00000283628 MKRN2OSH3BPM6 223 aa23.07■■□□□ 1.28
UBP1-201ENST00000283628 SLC31A2O15432 143 aa23.07■■□□□ 1.28
UBP1-201ENST00000283628 CNN1P51911 297 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
UBP1-201ENST00000283628 C17orf58Q2M2W7 97 aa23.07■■□□□ 1.28
UBP1-201ENST00000283628 C3orf36Q3SXR2 165 aa23.07■■□□□ 1.28
UBP1-201ENST00000283628 TEPPQ6URK8 271 aa23.07■■□□□ 1.28
UBP1-201ENST00000283628 LRFN3Q9BTN0 628 aa23.07■■□□□ 1.28
UBP1-201ENST00000283628 C1QTNF9P0C862 333 aa23.06■■□□□ 1.28
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