RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262460.4

GINS1-201, Transcript of GINS complex subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GINS1, Length 3,249 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS1-201ENST00000262460 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP7.17□□□□□ -1.26
GINS1-201ENST00000262460 TMEM241Q24JQ0 296 aa7.17□□□□□ -1.26
GINS1-201ENST00000262460 ZNF66Q6ZN08 573 aa7.17□□□□□ -1.26
GINS1-201ENST00000262460 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
GINS1-201ENST00000262460 SLC35E3Q7Z769 313 aa7.17□□□□□ -1.26
GINS1-201ENST00000262460 HES4Q9HCC6 221 aa7.17□□□□□ -1.26
GINS1-201ENST00000262460 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
GINS1-201ENST00000262460 PTPRBP23467 1997 aa7.16□□□□□ -1.26
GINS1-201ENST00000262460 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa7.16□□□□□ -1.26
GINS1-201ENST00000262460 A0A1B0GW64 132 aa7.16□□□□□ -1.26
GINS1-201ENST00000262460 GRIFINA4D1Z8 144 aa7.16□□□□□ -1.26
GINS1-201ENST00000262460 BTBD17A6NE02 478 aa7.16□□□□□ -1.26
GINS1-201ENST00000262460 PHOX2AO14813 284 aa7.16□□□□□ -1.26
GINS1-201ENST00000262460 IGHV2-70P01814 119 aa7.16□□□□□ -1.26
GINS1-201ENST00000262460 PSMB3P49720 205 aa7.16□□□□□ -1.26
GINS1-201ENST00000262460 GNB1P62873 340 aa7.16□□□□□ -1.26
GINS1-201ENST00000262460 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
GINS1-201ENST00000262460 SMIM21Q3B7S5 101 aa7.16□□□□□ -1.26
GINS1-201ENST00000262460 MORN2Q502X0 79 aa7.16□□□□□ -1.26
GINS1-201ENST00000262460 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
GINS1-201ENST00000262460 MRGPRGQ86SM5 289 aa7.16□□□□□ -1.26
GINS1-201ENST00000262460 Q8IYB0 196 aa7.16□□□□□ -1.26
GINS1-201ENST00000262460 OR13D1Q8NGV5 346 aa7.16□□□□□ -1.26
GINS1-201ENST00000262460 OR4A16Q8NH70 328 aa7.16□□□□□ -1.26
GINS1-201ENST00000262460 MBD3L1Q8WWY6 194 aa7.16□□□□□ -1.26
GINS1-201ENST00000262460 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
GINS1-201ENST00000262460 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
GINS1-201ENST00000262460 PROCRQ9UNN8 238 aa7.16□□□□□ -1.26
GINS1-201ENST00000262460 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa7.16□□□□□ -1.26
GINS1-201ENST00000262460 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
GINS1-201ENST00000262460 SCO2A0A1W2PP80 73 aa7.16□□□□□ -1.26
GINS1-201ENST00000262460 H7BYZ3 331 aa7.16□□□□□ -1.26
GINS1-201ENST00000262460 SPINT2O43291 252 aa7.16□□□□□ -1.26
GINS1-201ENST00000262460 NUPR1O60356 82 aa7.16□□□□□ -1.26
GINS1-201ENST00000262460 S100A8P05109 93 aa7.16□□□□□ -1.26
GINS1-201ENST00000262460 CD1BP29016 333 aa7.16□□□□□ -1.26
GINS1-201ENST00000262460 CATR1Q13166 79 aa7.16□□□□□ -1.26
GINS1-201ENST00000262460 OR5I1Q13606 314 aa7.16□□□□□ -1.26
GINS1-201ENST00000262460 MSMO1Q15800 293 aa7.16□□□□□ -1.26
GINS1-201ENST00000262460 MOB1BQ7L9L4 216 aa7.16□□□□□ -1.26
GINS1-201ENST00000262460 Q8N7P7 452 aa7.16□□□□□ -1.26
GINS1-201ENST00000262460 NHLRC2Q8NBF2 726 aa7.16□□□□□ -1.26
GINS1-201ENST00000262460 OR10W1Q8NGF6 305 aa7.16□□□□□ -1.26
GINS1-201ENST00000262460 FAM216AQ8WUB2 273 aa7.16□□□□□ -1.26
GINS1-201ENST00000262460 SGK494Q96LW2 274 aa7.16□□□□□ -1.26
GINS1-201ENST00000262460 TMEM147Q9BVK8 224 aa7.16□□□□□ -1.26
GINS1-201ENST00000262460 ASCL3Q9NQ33 180 aa7.16□□□□□ -1.26
GINS1-201ENST00000262460 TMEM140Q9NV12 185 aa7.16□□□□□ -1.26
GINS1-201ENST00000262460 DYSFO75923 2080 aa7.16□□□□□ -1.26
GINS1-201ENST00000262460 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP7.16□□□□□ -1.266e-7■■■■□ 24
GINS1-201ENST00000262460 OR10J4P0C629 311 aa7.16□□□□□ -1.26
GINS1-201ENST00000262460 P0C879 139 aa7.16□□□□□ -1.26
GINS1-201ENST00000262460 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
GINS1-201ENST00000262460 CT45A1Q5HYN5 189 aa7.16□□□□□ -1.26
GINS1-201ENST00000262460 SLC35E4Q6ICL7 350 aa7.16□□□□□ -1.26
GINS1-201ENST00000262460 CT45A3Q8NHU0 189 aa7.16□□□□□ -1.26
GINS1-201ENST00000262460 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
GINS1-201ENST00000262460 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
GINS1-201ENST00000262460 CSMD2Q7Z408 3487 aa7.15□□□□□ -1.26
GINS1-201ENST00000262460 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa7.15□□□□□ -1.26
GINS1-201ENST00000262460 DVL1O14640 695 aa7.15□□□□□ -1.26
GINS1-201ENST00000262460 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
GINS1-201ENST00000262460 NDUFB7P17568 137 aa7.15□□□□□ -1.26
GINS1-201ENST00000262460 FAM90A1Q86YD7 464 aa7.15□□□□□ -1.26
GINS1-201ENST00000262460 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
GINS1-201ENST00000262460 MGST2Q99735 147 aa7.15□□□□□ -1.26
GINS1-201ENST00000262460 HIST1H2BLQ99880 126 aa7.15□□□□□ -1.26
GINS1-201ENST00000262460 OR51M1Q9H341 326 aa7.15□□□□□ -1.26
GINS1-201ENST00000262460 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa7.15□□□□□ -1.27
GINS1-201ENST00000262460 A0A1W2PPV4 95 aa7.15□□□□□ -1.27
GINS1-201ENST00000262460 XKRY2A2RUG3 117 aa7.15□□□□□ -1.27
GINS1-201ENST00000262460 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.27
GINS1-201ENST00000262460 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa7.15□□□□□ -1.27
GINS1-201ENST00000262460 CCL3L1P16619 93 aa7.15□□□□□ -1.27
GINS1-201ENST00000262460 HLA-DRB5Q30154 266 aa7.15□□□□□ -1.27
GINS1-201ENST00000262460 C10orf55Q5SWW7 151 aa7.15□□□□□ -1.27
GINS1-201ENST00000262460 TREML4Q6UXN2 200 aa7.15□□□□□ -1.27
GINS1-201ENST00000262460 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.27
GINS1-201ENST00000262460 MALSU1Q96EH3 234 aa7.15□□□□□ -1.27
GINS1-201ENST00000262460 C1orf159Q96HA4 380 aa7.15□□□□□ -1.27
GINS1-201ENST00000262460 IFI27L2Q9H2X8 130 aa7.15□□□□□ -1.27
GINS1-201ENST00000262460 FAM215AQ9Y5M1 114 aa7.15□□□□□ -1.27
GINS1-201ENST00000262460 SEC14L6B5MCN3 397 aa7.14□□□□□ -1.27
GINS1-201ENST00000262460 TMPRSS2O15393 492 aa7.14□□□□□ -1.27
GINS1-201ENST00000262460 PLAUP00749 431 aa7.14□□□□□ -1.27
GINS1-201ENST00000262460 COX5AP20674 150 aa7.14□□□□□ -1.27
GINS1-201ENST00000262460 LOXL3P58215 753 aa7.14□□□□□ -1.27
GINS1-201ENST00000262460 SERF2P84101 59 aa7.14□□□□□ -1.27
GINS1-201ENST00000262460 WFDC8Q8IUA0 241 aa7.14□□□□□ -1.27
GINS1-201ENST00000262460 TMEM256Q8N2U0 113 aa7.14□□□□□ -1.27
GINS1-201ENST00000262460 LRFN3Q9BTN0 628 aa7.14□□□□□ -1.27
GINS1-201ENST00000262460 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
GINS1-201ENST00000262460 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
GINS1-201ENST00000262460 SPG11Q96JI7 2443 aa7.14□□□□□ -1.27
GINS1-201ENST00000262460 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa7.14□□□□□ -1.27
GINS1-201ENST00000262460 RNF212BA8MTL3 300 aa7.14□□□□□ -1.27
GINS1-201ENST00000262460 PRR33A8MZF0 331 aa7.14□□□□□ -1.27
GINS1-201ENST00000262460 E7EUB6 86 aa7.14□□□□□ -1.27
GINS1-201ENST00000262460 KBTBD11O94819 623 aa7.14□□□□□ -1.27
GINS1-201ENST00000262460 REG1AP05451 166 aa7.14□□□□□ -1.27
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