RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025354.3

Pggt1b-201, Transcript of Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pggt1b, Length 2,736 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tagln2Q9WVA4 199 aaKnown RBP10.84□□□□□ -0.67
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Aadacl4B1AVU5 407 aa10.83□□□□□ -0.68
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Scgb1b29D2XZ31 93 aa10.83□□□□□ -0.68
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Scgb1b20E9PWZ2 93 aa10.83□□□□□ -0.68
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 EndogO08600 294 aa10.83□□□□□ -0.68
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Glp1rO35659 463 aa10.83□□□□□ -0.68
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sc5dO88822 299 aa10.83□□□□□ -0.68
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tdpoz1P0DMR5 365 aa10.83□□□□□ -0.68
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 PtgfrP43117 366 aa10.83□□□□□ -0.68
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 HhexP43120 271 aa10.83□□□□□ -0.68
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nanos2P60322 136 aa10.83□□□□□ -0.68
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rab1AP62821 205 aa10.83□□□□□ -0.68
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cd55bQ61476 407 aa10.83□□□□□ -0.68
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gpank1Q61858 372 aa10.83□□□□□ -0.68
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tle1Q62440 770 aa10.83□□□□□ -0.68
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ell3Q80VR2 395 aa10.83□□□□□ -0.68
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Stk17bQ8BG48 372 aa10.83□□□□□ -0.68
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nadk2Q8C5H8 452 aa10.83□□□□□ -0.68
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 D330020A13RikQ8C799 211 aa10.83□□□□□ -0.68
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 CdiptQ8VDP6 213 aa10.83□□□□□ -0.68
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr1324Q8VEU7 332 aa10.83□□□□□ -0.68
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr480Q8VEZ0 312 aa10.83□□□□□ -0.68
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr508Q8VG42 310 aa10.83□□□□□ -0.68
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr916Q8VG53 310 aa10.83□□□□□ -0.68
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr1201Q8VGF5 307 aa10.83□□□□□ -0.68
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rbfox1Q9JJ43 396 aa10.83□□□□□ -0.68
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mmp24Q9R0S2 618 aa10.83□□□□□ -0.68
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm13083A2AGW5 501 aa10.83□□□□□ -0.68
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tarm1B6A8R8 288 aa10.83□□□□□ -0.68
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cdhr4H3BJZ2 783 aa10.83□□□□□ -0.68
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Scd2P13011 358 aa10.83□□□□□ -0.68
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fosl2P47930 326 aa10.83□□□□□ -0.68
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Defa11P50709 85 aa10.83□□□□□ -0.68
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Prr27Q3SYJ2 352 aa10.83□□□□□ -0.68
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mcrip1Q3UGS4 97 aa10.83□□□□□ -0.68
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gls2Q571F8 602 aa10.83□□□□□ -0.68
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 NmsQ5H8A1 153 aa10.83□□□□□ -0.68
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Usf1Q61069 310 aa10.83□□□□□ -0.68
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm26558Q8BLW8 286 aa10.83□□□□□ -0.68
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Q8VE95 218 aa10.83□□□□□ -0.68
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr980Q8VH08 310 aa10.83□□□□□ -0.68
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fgfrl1Q91V87 529 aa10.83□□□□□ -0.68
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zmat5Q9CQR5 170 aa10.83□□□□□ -0.68
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 DnlzQ9D113 177 aa10.83□□□□□ -0.68
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ube2v2Q9D2M8 145 aa10.83□□□□□ -0.68
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Clec4eQ9R0Q8 214 aa10.83□□□□□ -0.68
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mbd2Q9Z2E1 414 aa10.83□□□□□ -0.68
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Map1aQ9QYR6 2776 aa10.82□□□□□ -0.68
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Trav15d-1-dv6d-1A0A075B624 124 aa10.82□□□□□ -0.68
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 P01881 257 aa10.82□□□□□ -0.68
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mbd6Q3TY92 1003 aa10.82□□□□□ -0.68
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ankrd33bQ3U0L2 486 aa10.82□□□□□ -0.68
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cd200r5Q8BTP3 270 aa10.82□□□□□ -0.68
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 4922502D21RikQ8C634 189 aa10.82□□□□□ -0.68
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 SptssaQ8R207 71 aa10.82□□□□□ -0.68
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr52Q8VFL0 319 aa10.82□□□□□ -0.68
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr1054Q8VGS7 312 aa10.82□□□□□ -0.68
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pear1Q8VIK5 1034 aa10.82□□□□□ -0.68
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rbmxl1Q91VM5 388 aaKnown RBP10.82□□□□□ -0.68
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Wdr77Q99J09 342 aa10.82□□□□□ -0.68
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rnf151Q9CQ29 239 aa10.82□□□□□ -0.68
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tmem50aQ9CXL1 157 aa10.82□□□□□ -0.68
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Wnt16Q9QYS1 364 aa10.82□□□□□ -0.68
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Xcr1Q9R0M1 322 aa10.82□□□□□ -0.68
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 AcacbE9Q4Z2 2448 aa10.82□□□□□ -0.68
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr1490A0A1L1SVH0 321 aa10.82□□□□□ -0.68
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm6526G3X9Q9 198 aa10.82□□□□□ -0.68
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Il10P18893 178 aa10.82□□□□□ -0.68
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Crisp3Q03402 241 aa10.82□□□□□ -0.68
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tex30Q3TUU5 225 aa10.82□□□□□ -0.68
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr142Q60881 305 aa10.82□□□□□ -0.68
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Adat3Q6PAT0 349 aa10.82□□□□□ -0.68
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr452Q7TRV8 317 aa10.82□□□□□ -0.68
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Exosc6Q8BTW3 273 aa10.82□□□□□ -0.68
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr129Q8VEY1 330 aa10.82□□□□□ -0.68
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr860Q8VFF7 317 aa10.82□□□□□ -0.68
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr38Q8VGP4 317 aa10.82□□□□□ -0.68
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rnps1Q99M28 305 aaKnown RBP10.82□□□□□ -0.68
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tmem178aQ9CZ16 297 aa10.82□□□□□ -0.68
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Alkbh4Q9D8F1 300 aa10.82□□□□□ -0.68
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 MvkQ9R008 395 aa10.82□□□□□ -0.68
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Kmt2bO08550 2713 aa10.82□□□□□ -0.68
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ube2dnl1A2AFH1 155 aa10.81□□□□□ -0.68
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr1564K7N6V7 318 aa10.81□□□□□ -0.68
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm8265K7N6Y8 158 aa10.81□□□□□ -0.68
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fabp9O08716 132 aa10.81□□□□□ -0.68
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ntsr1O88319 424 aa10.81□□□□□ -0.68
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 AregP31955 248 aa10.81□□□□□ -0.68
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rps10P63325 165 aaKnown RBP10.81□□□□□ -0.68
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr890Q7TRD9 314 aa10.81□□□□□ -0.68
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zim1Q8C393 579 aa10.81□□□□□ -0.68
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm9837Q8C607 126 aa10.81□□□□□ -0.68
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr483Q8VG05 315 aa10.81□□□□□ -0.68
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr638Q8VH20 321 aa10.81□□□□□ -0.68
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Lhfpl3Q9CTN8 222 aa10.81□□□□□ -0.68
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mrps30Q9D0G0 442 aaKnown RBP10.81□□□□□ -0.68
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Naa60Q9DBU2 242 aa10.81□□□□□ -0.68
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Hsd17b11Q9EQ06 298 aa10.81□□□□□ -0.68
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ros1Q78DX7 2340 aa10.81□□□□□ -0.68
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr587-ps1A0A1B0GSS1 159 aa10.81□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 44.5 ms