RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000627440.2

SNAP23-223, Transcript of synaptosome associated protein 23, human

TSL 5 BASIC

Gene SNAP23, Length 210 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNAP23-223	ENST00000627440	PLAC8L1	A1L4L8	177 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SNAP23-223	ENST00000627440	ARPC2	O15144	300 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF682	O95780	498 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SNAP23-223	ENST00000627440	PRM2	P04554	102 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SNAP23-223	ENST00000627440	LYN	P07948	512 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SNAP23-223	ENST00000627440	HLA-DRB4	P13762	266 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SNAP23-223	ENST00000627440	GYPE	P15421	78 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SNAP23-223	ENST00000627440	TSPO	P30536	169 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SNAP23-223	ENST00000627440	FUT6	P51993	359 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SNAP23-223	ENST00000627440	SS18	Q15532	418 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SNAP23-223	ENST00000627440	MORN2	Q502X0	79 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SNAP23-223	ENST00000627440	AGK	Q53H12	422 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SNAP23-223	ENST00000627440	CD300LD	Q6UXZ3	194 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SNAP23-223	ENST00000627440	CPO	Q8IVL8	374 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SNAP23-223	ENST00000627440	AGR3	Q8TD06	166 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SNAP23-223	ENST00000627440	CCDC107	Q8WV48	283 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SNAP23-223	ENST00000627440	ST8SIA2	Q92186	375 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SNAP23-223	ENST00000627440	BSCL2	Q96G97	398 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81
SNAP23-223	ENST00000627440	RNF185	Q96GF1	192 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SNAP23-223	ENST00000627440	LINC00479	Q96M42	142 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SNAP23-223	ENST00000627440	ABHD6	Q9BV23	337 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SNAP23-223	ENST00000627440	NRN1	Q9NPD7	142 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SNAP23-223	ENST00000627440	OR2S2	Q9NQN1	319 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SNAP23-223	ENST00000627440	CD300A	Q9UGN4	299 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SNAP23-223	ENST00000627440	HLA-DRB4	X5D2U9	266 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SNAP23-223	ENST00000627440	FLG	P20930	4061 aa	Predicted RBP	3.73	□□□□□ -1.81
SNAP23-223	ENST00000627440	IGLV7-46	A0A075B6I9	117 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SNAP23-223	ENST00000627440	TRAV24	A0A0B4J272	114 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SNAP23-223	ENST00000627440	HELT	A6NFD8	242 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SNAP23-223	ENST00000627440	NPIPB5	A8MRT5	1133 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SNAP23-223	ENST00000627440	TMEM14DP	A8MWL7	114 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SNAP23-223	ENST00000627440	CLIC1	O00299	241 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SNAP23-223	ENST00000627440	ACTL6B	O94805	426 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SNAP23-223	ENST00000627440	YIF1A	O95070	293 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SNAP23-223	ENST00000627440	HIST1H1C	P16403	213 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
SNAP23-223	ENST00000627440	KRTAP5-9	P26371	169 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SNAP23-223	ENST00000627440	PHB	P35232	272 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SNAP23-223	ENST00000627440	MRPS15	P82914	257 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
SNAP23-223	ENST00000627440	RPL39P5	Q59GN2	51 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SNAP23-223	ENST00000627440	SPSB3	Q6PJ21	355 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SNAP23-223	ENST00000627440	CEACAM19	Q7Z692	300 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SNAP23-223	ENST00000627440	PDPN	Q86YL7	162 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SNAP23-223	ENST00000627440	PQLC1	Q8N2U9	271 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SNAP23-223	ENST00000627440	ATP6V0E2	Q8NHE4	81 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SNAP23-223	ENST00000627440	DGCR14	Q96DF8	476 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
SNAP23-223	ENST00000627440	IGF2BP2-AS1	Q96M15	143 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SNAP23-223	ENST00000627440	TEAD3	Q99594	435 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SNAP23-223	ENST00000627440	PAK1IP1	Q9NWT1	392 aa	Predicted RBP	3.73	□□□□□ -1.81
SNAP23-223	ENST00000627440	PIPOX	Q9P0Z9	390 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SNAP23-223	ENST00000627440	TIMM8B	Q9Y5J9	83 aa	Predicted RBP	3.73	□□□□□ -1.81
SNAP23-223	ENST00000627440	IGLV1-50	A0A075B6I6	118 aa		3.72	□□□□□ -1.81
SNAP23-223	ENST00000627440	IGHV3-38	A0A0C4DH36	116 aa		3.72	□□□□□ -1.81
SNAP23-223	ENST00000627440	IGHV3-66	A0A0C4DH42	116 aa		3.72	□□□□□ -1.81
SNAP23-223	ENST00000627440	HMX3	A6NHT5	357 aa		3.72	□□□□□ -1.81
SNAP23-223	ENST00000627440	NAPSA	O96009	420 aa		3.72	□□□□□ -1.81
SNAP23-223	ENST00000627440	APOA2	P02652	100 aa		3.72	□□□□□ -1.81
SNAP23-223	ENST00000627440	DEFA4	P12838	97 aa		3.72	□□□□□ -1.81
SNAP23-223	ENST00000627440	CRHBP	P24387	322 aa		3.72	□□□□□ -1.81
SNAP23-223	ENST00000627440	NME5	P56597	212 aa		3.72	□□□□□ -1.81
SNAP23-223	ENST00000627440	DNAJB13	P59910	316 aa		3.72	□□□□□ -1.81
SNAP23-223	ENST00000627440	GNMT	Q14749	295 aa		3.72	□□□□□ -1.81
SNAP23-223	ENST00000627440	CAVIN1	Q6NZI2	390 aa	Known RBP	3.72	□□□□□ -1.81
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF600	Q6ZNG1	722 aa		3.72	□□□□□ -1.81
SNAP23-223	ENST00000627440	NEGR1	Q7Z3B1	354 aa		3.72	□□□□□ -1.81
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF709	Q8N972	641 aa		3.72	□□□□□ -1.81
SNAP23-223	ENST00000627440	OR2AK2	Q8NG84	335 aa		3.72	□□□□□ -1.81
SNAP23-223	ENST00000627440	OR2T4	Q8NH00	348 aa		3.72	□□□□□ -1.81
SNAP23-223	ENST00000627440		Q8TAT8	98 aa		3.72	□□□□□ -1.81
SNAP23-223	ENST00000627440	NRG4	Q8WWG1	115 aa		3.72	□□□□□ -1.81
SNAP23-223	ENST00000627440	MS4A14	Q96JA4	679 aa		3.72	□□□□□ -1.81
SNAP23-223	ENST00000627440	HARBI1	Q96MB7	349 aa		3.72	□□□□□ -1.81
SNAP23-223	ENST00000627440	RETNLB	Q9BQ08	111 aa		3.72	□□□□□ -1.81
SNAP23-223	ENST00000627440	TSPYL1	Q9H0U9	437 aa		3.72	□□□□□ -1.81
SNAP23-223	ENST00000627440	NOP10	Q9NPE3	64 aa	Known RBP	3.72	□□□□□ -1.81
SNAP23-223	ENST00000627440	ST3GAL6	Q9Y274	331 aa		3.72	□□□□□ -1.81
SNAP23-223	ENST00000627440		V9GYY5	206 aa	Predicted RBP	3.72	□□□□□ -1.81
SNAP23-223	ENST00000627440	RAB29	O14966	203 aa		3.71	□□□□□ -1.82
SNAP23-223	ENST00000627440	E2F6	O75461	281 aa		3.71	□□□□□ -1.82
SNAP23-223	ENST00000627440	HBZ	P02008	142 aa		3.71	□□□□□ -1.82
SNAP23-223	ENST00000627440	RBP2	P50120	134 aa		3.71	□□□□□ -1.82
SNAP23-223	ENST00000627440	SCAND1	P57086	179 aa		3.71	□□□□□ -1.82
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF415	Q09FC8	603 aa		3.71	□□□□□ -1.82
SNAP23-223	ENST00000627440	LAGE3	Q14657	143 aa		3.71	□□□□□ -1.82
SNAP23-223	ENST00000627440	LINC01556	Q5JQF7	62 aa		3.71	□□□□□ -1.82
SNAP23-223	ENST00000627440	C10orf55	Q5SWW7	151 aa		3.71	□□□□□ -1.82
SNAP23-223	ENST00000627440	SLC35F1	Q5T1Q4	408 aa		3.71	□□□□□ -1.82
SNAP23-223	ENST00000627440	DDI2	Q5TDH0	399 aa		3.71	□□□□□ -1.82
SNAP23-223	ENST00000627440	H2BFWT	Q7Z2G1	175 aa		3.71	□□□□□ -1.82
SNAP23-223	ENST00000627440	NOXA1	Q86UR1	476 aa		3.71	□□□□□ -1.82
SNAP23-223	ENST00000627440	LCA5	Q86VQ0	697 aa		3.71	□□□□□ -1.82
SNAP23-223	ENST00000627440	SLC15A3	Q8IY34	581 aa		3.71	□□□□□ -1.82
SNAP23-223	ENST00000627440	THAP8	Q8NA92	274 aa		3.71	□□□□□ -1.82
SNAP23-223	ENST00000627440	AQP11	Q8NBQ7	271 aa		3.71	□□□□□ -1.82
SNAP23-223	ENST00000627440	OR13F1	Q8NGS4	319 aa		3.71	□□□□□ -1.82
SNAP23-223	ENST00000627440	OR6N2	Q8NGY6	317 aa		3.71	□□□□□ -1.82
SNAP23-223	ENST00000627440	CNIH3	Q8TBE1	160 aa		3.71	□□□□□ -1.82
SNAP23-223	ENST00000627440	SLC26A7	Q8TE54	656 aa		3.71	□□□□□ -1.82
SNAP23-223	ENST00000627440	ROPN1B	Q9BZX4	212 aa	Predicted RBP	3.71	□□□□□ -1.82
SNAP23-223	ENST00000627440	SLC35B3	Q9H1N7	401 aa		3.71	□□□□□ -1.82
SNAP23-223	ENST00000627440	IFI27L2	Q9H2X8	130 aa		3.71	□□□□□ -1.82

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