RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000596941.5

GTPBP3-215, Transcript of GTP binding protein 3, mitochondrial, human

TSL 2

Gene GTPBP3, Length 678 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GTPBP3-215	ENST00000596941	BRWD1-AS2	P59051	145 aa		13.48	□□□□□ -0.25
GTPBP3-215	ENST00000596941	NCS1	P62166	190 aa		13.48	□□□□□ -0.25
GTPBP3-215	ENST00000596941	CDK10	Q15131	360 aa		13.48	□□□□□ -0.25
GTPBP3-215	ENST00000596941	UBE2NL	Q5JXB2	153 aa		13.48	□□□□□ -0.25
GTPBP3-215	ENST00000596941	CROCCP3	Q8IVE0	287 aa		13.48	□□□□□ -0.25
GTPBP3-215	ENST00000596941	SECTM1	Q8WVN6	248 aa		13.48	□□□□□ -0.25
GTPBP3-215	ENST00000596941	ACOT12	Q8WYK0	555 aa		13.48	□□□□□ -0.25
GTPBP3-215	ENST00000596941	DCUN1D5	Q9BTE7	237 aa		13.48	□□□□□ -0.25
GTPBP3-215	ENST00000596941	CCL28	Q9NRJ3	127 aa		13.48	□□□□□ -0.25
GTPBP3-215	ENST00000596941	ZNF256	Q9Y2P7	627 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
GTPBP3-215	ENST00000596941	MRPS7	Q9Y2R9	242 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
GTPBP3-215	ENST00000596941	PRELID3B	Q9Y3B1	194 aa		13.48	□□□□□ -0.25
GTPBP3-215	ENST00000596941	MSGN1	A6NI15	193 aa		13.47	□□□□□ -0.25
GTPBP3-215	ENST00000596941	XRCC3	O43542	346 aa		13.47	□□□□□ -0.25
GTPBP3-215	ENST00000596941	PPY	P01298	95 aa		13.47	□□□□□ -0.25
GTPBP3-215	ENST00000596941	HSPB1	P04792	205 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
GTPBP3-215	ENST00000596941	INSL3	P51460	131 aa		13.47	□□□□□ -0.25
GTPBP3-215	ENST00000596941	VKORC1L1	Q8N0U8	176 aa		13.47	□□□□□ -0.25
GTPBP3-215	ENST00000596941	SAMD12	Q8N8I0	201 aa		13.47	□□□□□ -0.25
GTPBP3-215	ENST00000596941	ADAD2	Q8NCV1	583 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
GTPBP3-215	ENST00000596941	OR4S2	Q8NH73	311 aa		13.47	□□□□□ -0.25
GTPBP3-215	ENST00000596941	TMEM68	Q96MH6	324 aa		13.47	□□□□□ -0.25
GTPBP3-215	ENST00000596941	PHB2	Q99623	299 aa		13.47	□□□□□ -0.25
GTPBP3-215	ENST00000596941	HSD17B10	Q99714	261 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
GTPBP3-215	ENST00000596941	B9D2	Q9BPU9	175 aa		13.47	□□□□□ -0.25
GTPBP3-215	ENST00000596941	FUNDC2	Q9BWH2	189 aa		13.47	□□□□□ -0.25
GTPBP3-215	ENST00000596941	TINAGL1	Q9GZM7	467 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
GTPBP3-215	ENST00000596941	COA4	Q9NYJ1	87 aa		13.47	□□□□□ -0.25
GTPBP3-215	ENST00000596941	LSM4	Q9Y4Z0	139 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
GTPBP3-215	ENST00000596941	TNFSF12	O43508	249 aa		13.46	□□□□□ -0.25
GTPBP3-215	ENST00000596941	SAP30	O75446	220 aa		13.46	□□□□□ -0.25
GTPBP3-215	ENST00000596941	SMIM18	P0DKX4	95 aa		13.46	□□□□□ -0.25
GTPBP3-215	ENST00000596941	TAS2R20	P59543	309 aa		13.46	□□□□□ -0.25
GTPBP3-215	ENST00000596941	CD69	Q07108	199 aa		13.46	□□□□□ -0.25
GTPBP3-215	ENST00000596941	DYRK1A	Q13627	763 aa		13.46	□□□□□ -0.25
GTPBP3-215	ENST00000596941	MFSD4A	Q8N468	514 aa		13.46	□□□□□ -0.25
GTPBP3-215	ENST00000596941	C13orf42	A0A1B0GVH6	325 aa		13.45	□□□□□ -0.26
GTPBP3-215	ENST00000596941	BRI3	O95415	125 aa		13.45	□□□□□ -0.26
GTPBP3-215	ENST00000596941	EIF4E	P06730	217 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
GTPBP3-215	ENST00000596941	CBX5	P45973	191 aa		13.45	□□□□□ -0.26
GTPBP3-215	ENST00000596941	FXYD4	P59646	89 aa		13.45	□□□□□ -0.26
GTPBP3-215	ENST00000596941	DCTN2	Q13561	401 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
GTPBP3-215	ENST00000596941	ACSM6	Q6P461	480 aa		13.45	□□□□□ -0.26
GTPBP3-215	ENST00000596941	ZNF66	Q6ZN08	573 aa		13.45	□□□□□ -0.26
GTPBP3-215	ENST00000596941	ZNF429	Q86V71	674 aa		13.45	□□□□□ -0.26
GTPBP3-215	ENST00000596941	MMD2	Q8IY49	270 aa		13.45	□□□□□ -0.26
GTPBP3-215	ENST00000596941	OR5AP2	Q8NGF4	316 aa		13.45	□□□□□ -0.26
GTPBP3-215	ENST00000596941	SLC25A46	Q96AG3	418 aa		13.45	□□□□□ -0.26
GTPBP3-215	ENST00000596941	S100A16	Q96FQ6	103 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
GTPBP3-215	ENST00000596941	SLC5A7	Q9GZV3	580 aa		13.45	□□□□□ -0.26
GTPBP3-215	ENST00000596941	ANAPC10	Q9UM13	185 aa		13.45	□□□□□ -0.26
GTPBP3-215	ENST00000596941	ANKRD34B	A5PLL1	514 aa		13.44	□□□□□ -0.26
GTPBP3-215	ENST00000596941	MPPED1	O15442	326 aa		13.44	□□□□□ -0.26
GTPBP3-215	ENST00000596941	KBTBD11	O94819	623 aa		13.44	□□□□□ -0.26
GTPBP3-215	ENST00000596941	LY86	O95711	162 aa		13.44	□□□□□ -0.26
GTPBP3-215	ENST00000596941	TRBV12-3	P01733	135 aa		13.44	□□□□□ -0.26
GTPBP3-215	ENST00000596941	OR9G9	P0C7N8	305 aa		13.44	□□□□□ -0.26
GTPBP3-215	ENST00000596941	VBP1	P61758	197 aa		13.44	□□□□□ -0.26
GTPBP3-215	ENST00000596941	MSMO1	Q15800	293 aa		13.44	□□□□□ -0.26
GTPBP3-215	ENST00000596941	TMEM69	Q5SWH9	247 aa		13.44	□□□□□ -0.26
GTPBP3-215	ENST00000596941	HAPLN4	Q86UW8	402 aa		13.44	□□□□□ -0.26
GTPBP3-215	ENST00000596941	TMEM17	Q86X19	198 aa		13.44	□□□□□ -0.26
GTPBP3-215	ENST00000596941	PUSL1	Q8N0Z8	303 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
GTPBP3-215	ENST00000596941	IFT46	Q9NQC8	304 aa		13.44	□□□□□ -0.26
GTPBP3-215	ENST00000596941		A0A0G2JLM5	398 aa		13.43	□□□□□ -0.26
GTPBP3-215	ENST00000596941	CREBL2	O60519	120 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
GTPBP3-215	ENST00000596941	PRH1	P02810	166 aa		13.43	□□□□□ -0.26
GTPBP3-215	ENST00000596941	ZNF45	Q02386	682 aa		13.43	□□□□□ -0.26
GTPBP3-215	ENST00000596941	TMEM167A	Q8TBQ9	72 aa		13.43	□□□□□ -0.26
GTPBP3-215	ENST00000596941	RANGRF	Q9HD47	186 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
GTPBP3-215	ENST00000596941	EHF	Q9NZC4	300 aa		13.43	□□□□□ -0.26
GTPBP3-215	ENST00000596941	ADAM30	Q9UKF2	790 aa		13.43	□□□□□ -0.26
GTPBP3-215	ENST00000596941		A0A1B0GW64	132 aa		13.42	□□□□□ -0.26
GTPBP3-215	ENST00000596941	HMX3	A6NHT5	357 aa		13.42	□□□□□ -0.26
GTPBP3-215	ENST00000596941	TEX22	C9J3V5	150 aa		13.42	□□□□□ -0.26
GTPBP3-215	ENST00000596941		E7EUB6	86 aa		13.42	□□□□□ -0.26
GTPBP3-215	ENST00000596941	ACTL6B	O94805	426 aa		13.42	□□□□□ -0.26
GTPBP3-215	ENST00000596941	OR2A4	O95047	310 aa		13.42	□□□□□ -0.26
GTPBP3-215	ENST00000596941	SPN	P16150	400 aa		13.42	□□□□□ -0.26
GTPBP3-215	ENST00000596941	ZNF343	Q6P1L6	599 aa		13.42	□□□□□ -0.26
GTPBP3-215	ENST00000596941	ZNF818P	Q6ZRF7	136 aa		13.42	□□□□□ -0.26
GTPBP3-215	ENST00000596941	C19orf35	Q6ZS72	473 aa		13.42	□□□□□ -0.26
GTPBP3-215	ENST00000596941	SSX9	Q7RTT3	188 aa		13.42	□□□□□ -0.26
GTPBP3-215	ENST00000596941	GIMAP1	Q8WWP7	306 aa		13.42	□□□□□ -0.26
GTPBP3-215	ENST00000596941	KCTD12	Q96CX2	325 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
GTPBP3-215	ENST00000596941	OR2A7	Q96R45	310 aa		13.42	□□□□□ -0.26
GTPBP3-215	ENST00000596941	SPIN2A	Q99865	258 aa		13.42	□□□□□ -0.26
GTPBP3-215	ENST00000596941	SPIN2B	Q9BPZ2	258 aa		13.42	□□□□□ -0.26
GTPBP3-215	ENST00000596941	NAA50	Q9GZZ1	169 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
GTPBP3-215	ENST00000596941	SULT1C2	O00338	296 aa		13.41	□□□□□ -0.26
GTPBP3-215	ENST00000596941	MYOD1	P15172	320 aa		13.41	□□□□□ -0.26
GTPBP3-215	ENST00000596941	NAT1	P18440	290 aa		13.41	□□□□□ -0.26
GTPBP3-215	ENST00000596941	ZP3	P21754	424 aa		13.41	□□□□□ -0.26
GTPBP3-215	ENST00000596941	KIR2DS2	P43631	304 aa		13.41	□□□□□ -0.26
GTPBP3-215	ENST00000596941	RFX2	P48378	723 aa		13.41	□□□□□ -0.26
GTPBP3-215	ENST00000596941	RHOG	P84095	191 aa		13.41	□□□□□ -0.26
GTPBP3-215	ENST00000596941	VAX1	Q5SQQ9	334 aa		13.41	□□□□□ -0.26
GTPBP3-215	ENST00000596941	SPAG16	Q8N0X2	631 aa		13.41	□□□□□ -0.26
GTPBP3-215	ENST00000596941	ZBTB34	Q8NCN2	500 aa		13.41	□□□□□ -0.26
GTPBP3-215	ENST00000596941	VSTM2A	Q8TAG5	236 aa		13.41	□□□□□ -0.26

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